首都儿科研究所（Capital Institute of Pediatrics）是一所以医学基础研究、儿科疾病发病机理研究、儿童保健为重点，承担有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。 研究所前身是中国医学科学院儿科研究所，成立于1958年，是新中国第一家儿科医学研究所。1983年改隶北京市，1984年开设门诊，1986年建立首都儿科研究所附属儿童医院。1993年，在京郊顺义区组建“北京市医用生物制品中试基地”。