刘小敏+张涛+贾慧珏:基因决定口腔微生物组组成
热心肠小伙伴们 2021-12-22
近期深圳华大生命科学研究院刘小敏、张涛和贾慧珏作为共同通讯作者,在Cell Discovery上发表的最新工作,首次通过大样品基因组测序探索了宿主基因组对口腔微生物的影响,发现了5个影响口腔微生物组的显著性位点,并应用人工智能学习的方法探索了基因组和微生物对牙周疾病的预测性能,取得了较好的结果。

人类口腔内有超过十亿的口腔微生物组,这些微生物不仅仅在口腔中发挥重要的作用。而且可以通过吞咽的方式进入消化道的其他位置,例如肠道,从而影响肠道微生物组,对人体的健康产生重要的影响。多个宏基因组研究均提示,口腔微生物组与风湿性关节炎、结肠癌、2型糖尿病等疾病有一定的关系。肠道微生物组的研究发现,人类遗传因素与肠道微生物组组成具有相关性。但是,高度动态变化的口腔微生物组是否也与宿主遗传因素具有一定的相关性呢?这一问题目前尚没有证据证明。近期深圳华大生命科学研究院刘小敏、张涛和贾慧珏作为共同通讯作者,在Cell Discovery上发表的最新工作Metagenome-genome-wide association studies reveal human genetic impact on the oral microbiome,首次通过大样品基因组测序探索了宿主基因组对口腔微生物的影响,发现了5个影响口腔微生物组的显著性位点,并应用人工智能学习的方法探索了基因组和微生物对牙周疾病的预测性能,取得了较好的结果。

专家简介
贾慧珏
复旦大学生命科学学院/粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)研究员
共生菌群领域国际知名专家,2022年全职加入粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)并担任研究员,组建人体共生微生物组与健康实验室。主要致力于宏基因组参考数据集、菌株集和复杂疾病的研究,把传统上以肠道菌群为主的团队带入口腔、生殖道、尿液等更具挑战的科研与应用领域,完整解析各部位菌群的遗传与环境因素,并把复杂疾病标志物的研究迈入因果关系解释。第一作者或通讯作者(含共同)成果包括Cell、Nature Biotechnology、Nature Medicine、Nature Genetics、Nature Reviews Microbiology等杂志论文,已获批国内外专利18项,参与制定国家标准1项。2020年,荣登科睿唯安高引学者榜,目前总引用数8000余次,H-index 32;担任Nature子刊及综述子刊审稿人;受邀出版首部人体共生微生物组与疾病研究英文专著,已由Academic Press/Elsevier全球发行(ISBN 978-0-323-91369-0)。
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