刘星吟团队:新的鉴定和量化菌群关系变化的分析框架—PM2RA
热心肠小伙伴们 2021-05-20
南京医科大学刘星吟教授课题组在Genomics, Proteomics & Bioinformatics杂志上在线发表了文章,借鉴工业领域监测变量之间关系一致性的方法,提出了一个鉴定和量化菌群关系变化的分析框架(PM2RA),以检测和量化各种条件下菌群中的关系变化。

近期,来自南京医科大学刘星吟教授课题组在Genomics, Proteomics & Bioinformatics杂志上在线发表了文章PM2RA: A Framework for Detecting and Quantifying Relationship Alterations in Microbial Community,借鉴工业领域监测变量之间关系一致性的方法,提出了一个鉴定和量化菌群关系变化的分析框架(PM2RA),以检测和量化各种条件下菌群中的关系变化。PM2RA无需构建共现网络,可直接比较不同条件下菌群关联的变化。为了方便临床医生以及没有生信基础的科研人员使用该软件进行两种状态下菌群关系的变化分析,PM2RA提供在线分析工具及单机版软件 http://www.pm2ra-xingyinliulab.cn/。

专家简介
刘星吟
南京医科大学特聘教授,江苏省特聘教授
南京医科大学肠道微生态创新团队组长
刘星吟 南京医科大学教授,生殖医学与子代健康全国重点实验室A类科学创新PI, 博士生导师,南京医科大学肠道微生态创新团队组长,江苏特聘医学专家,江苏特聘教授,江苏省333高层次中青年领军人才。南京医科大学国际基因工程机器大赛(iGEM)指导老师和社团负责人。任中国医药教育微生态与健康专委副主任委员, 中国优生科学协会医学遗传学专业委员会副主任委员,中国神经科学学会儿童认知与脑功能障碍分会委员,中国生物物理学会肠道菌群分会委员,主要致力于肠道菌群与宿主表观遗传修饰互作对神经发育和生殖衰老发生发展的影响及其调控机制。近年来以通讯作者在 Cell Metabolism, GUT,Cell Host & Microbe、Gut Microbes等知名国际权威期刊共发表了30多篇高水平科研论文,授权专利8项,转化2项。任Cell Host& Microbe, GUT, Science Advance, Microbiome, Nucleic Acids Research, Cell Reports,Cell Medicine Reports, Gut Microbes,mSystem等20多本国际知名期刊的特约审稿人,承担科技部重点研发和国家自然科学基金委项目多项。
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