刘洋彧等Nature子刊:利用深层宏蛋白质组学揭示肠道菌群蛋白质组功能冗余
热心肠小伙伴们 2023-06-22
最近宏基因组学数据对人类菌群潜在功能的冗余(或基因组级功能冗余FRg) 进行了量化,然而目前关于人类菌群表达功能的冗余从未被量化。近日,刘洋彧等在Nature Communications上发表文章,利用深层宏蛋白质组学揭示人类肠道菌群蛋白质组水平的功能冗余。

功能冗余是关键的生态系统属性,表示不同的类群通过冗余功能的表达以相似的方式为生态系统做出贡献。最近宏基因组学数据对人类菌群潜在功能的冗余(或基因组级功能冗余FRg) 进行了量化,然而目前关于人类菌群表达功能的冗余从未被量化。近日,刘洋彧等在Nature Communications上发表文章Revealing proteome-level functional redundancy in the human gut microbiome using ultra-deep metaproteomics,利用深层宏蛋白质组学揭示人类肠道菌群蛋白质组水平的功能冗余。

专家简介
刘洋彧
哈佛大学医学院副教授
布莱根女子医院副研究员
刘洋彧博士现任哈佛大学医学院副教授和布莱根女子医院副研究员。他于 2009年从美国伊利诺伊大学获得物理学博士学位。博士期间关于无序系统中相变的研究曾入选《欧洲物理学评论》2009年度最佳论文。2009年至2012年,他在美国东北大学物理系和复杂网络研究中心先后担任博士后和助理研究教授。期间他关于复杂网络的可控性和可观性的一系列工作曾被列为Nature封面故事,PNAS封面故事,并受到包括Nature, Science, Science News, Science Daily, WIRED等期刊或媒体的广泛报道。他于2013年加入哈佛大学医学院。他实验室(https://yangyuliu.bwh.harvard.edu)目前的研究重点是从群落生态学,网络科学,控制论,和机器学习等多个角度研究复杂微生物群落,尤其关注人类微生物组的一系列根本性问题以及人类微生物组在疾病治疗和精准营养上的应用。迄今为止,刘洋彧博士已经发表学术论文130余篇(其中Cell/Nature/Science正刊及子刊近40篇),总引用超万次,并担任多个学术期刊的副编辑,近70个学术期刊的特约审稿人,以及10多个国际会议的组织或程序委员会成员。
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