Nature子刊：刘洋彧、Rob Knight等评测不同宏基因组物种定量方法及其对结果的影响

热心肠小伙伴们 2021-05-15

哈佛大学医学院刘洋彧团队与加州大学圣地亚哥分校Rob Knight团队合作，在Nature Methods发表文章，通过严谨的论证分析，量化了宏基因组学物种分类工具所产生的两种相对丰度类型的差别，对于混淆两种丰度所产生的影响进行了全面系统地研究，呼吁整个菌群研究界应更多地关注由于忽视序列丰度和物种丰度之间的区别而引起的潜在误导性生物学结论。

哈佛大学医学院刘洋彧团队与加州大学圣地亚哥分校Rob Knight团队合作，在Nature Methods发表文章Challenges in benchmarking metagenomic profilers，通过严谨的论证分析，量化了宏基因组学物种分类工具所产生的两种相对丰度类型的差别，对于混淆两种丰度所产生的影响进行了全面系统地研究，呼吁整个菌群研究界应更多地关注由于忽视序列丰度和物种丰度之间的区别而引起的潜在误导性生物学结论。

专家简介

刘洋彧

哈佛大学医学院副教授
布莱根女子医院副研究员

刘洋彧博士现任哈佛大学医学院副教授和布莱根女子医院副研究员。他于 2009年从美国伊利诺伊大学获得物理学博士学位。博士期间关于无序系统中相变的研究曾入选《欧洲物理学评论》2009年度最佳论文。2009年至2012年，他在美国东北大学物理系和复杂网络研究中心先后担任博士后和助理研究教授。期间他关于复杂网络的可控性和可观性的一系列工作曾被列为Nature封面故事，PNAS封面故事，并受到包括Nature, Science, Science News, Science Daily, WIRED等期刊或媒体的广泛报道。他于2013年加入哈佛大学医学院。他实验室(https://yangyuliu.bwh.harvard.edu)目前的研究重点是从群落生态学，网络科学，控制论，和机器学习等多个角度研究复杂微生物群落，尤其关注人类微生物组的一系列根本性问题以及人类微生物组在疾病治疗和精准营养上的应用。迄今为止，刘洋彧博士已经发表学术论文130余篇（其中Cell/Nature/Science正刊及子刊近40篇），总引用超万次，并担任多个学术期刊的副编辑，近70个学术期刊的特约审稿人，以及10多个国际会议的组织或程序委员会成员。

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