iMeta:褚海燕团队开发量化微生物群落水平生物关联的方法
热心肠小伙伴们 2023-11-04
中科院褚海燕团队近期在iMeta发表研究,开发了一个 R包(qcmi)来识别微生物生态网络中假定的生物关联,并将其量化。该 R包基于一系列常见且先进的微生物生态学分析方法,设计成便于使用、应用灵活的分析流程。

中科院褚海燕团队近期在iMeta发表研究,开发了一个 R包(qcmi)来识别微生物生态网络中假定的生物关联,并将其量化。该 R包基于一系列常见且先进的微生物生态学分析方法,设计成便于使用、应用灵活的分析流程。该方法包括以下四个步骤:构建生态网络、分配构建过程、量化生物关联以及评估生态后果。R包和使用说明见https://github.com/joshualiuxu/qcmi。本研究为探讨微生物在不同生境间的潜在生物关联提供了一条新途径,有助于我们更好地了解多变世界中复杂微生物群落的动态。

专家简介
褚海燕
中国科学院南京土壤研究所二级研究员
中国科学院大学岗位教授
褚海燕,中国科学院南京土壤研究所二级研究员,中国科学院大学岗位教授(A类)、土壤生物学首席教授。主要从事土壤微生物学、微生物生态学方面的研究工作。主持国家重点研发计划项目、国家自然科学基金重点项目等。发表SCI论文170余篇,被引用1.6万次。主编《土壤生物学》教材、《微生物组实验手册》。担任中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会主任,Soil Ecology Letters共同主编,Microbiome副主编,The ISME Journal等国际期刊编委。曾获中国土壤学会科学技术奖一等奖(第一完成人),江苏省科学技术奖二等奖(第一完成人),中国科学院优秀导师奖。2019年以来连续入选科睿唯安全球高被引科学家。
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