王军+宋默识Nature子刊:二代+三代测序,深挖人类肠道菌
热心肠小伙伴们 2022-06-09
中科院微生物所王军团队和中科院动物所宋默识团队合作,在Nature Communications发表文章,报道了一种新方法,结合短读长的二代测序(Illumina)和长读长的三代测序(纳米孔)数据进行宏基因组分析,深入挖掘了人类肠道微生物组的基因结构变异、原噬菌体和CRISPR间隔元件,在菌株水平上揭示了肠菌功能差异以及与宿主代谢组和表型的关系。

中科院微生物所王军团队和中科院动物所宋默识团队合作,在Nature Communications发表文章Short- and long-read metagenomics expand individualized structural variations in gut microbiomes,报道了一种新方法,结合短读长的二代测序(Illumina)和长读长的三代测序(纳米孔)数据进行宏基因组分析,深入挖掘了人类肠道微生物组的基因结构变异、原噬菌体和CRISPR间隔元件,在菌株水平上揭示了肠菌功能差异以及与宿主代谢组和表型的关系。

专家简介
王军
中国科学院微生物研究所研究员
中国肠道大会联合发起人
中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师,国家高层次海外人才项目入选者,德国马普学会合作伙伴小组负责人,北京市科技新星,北京市自然基金委杰出青年项目获得者,中源协和生命医学创新突破奖获得者(2022),中科院优秀导师(2022、23)。主要进行生物数据的深度挖掘和分析工作,工作中利用生物信息学、人工智能和新测序方法结合的方法,研究肠道菌群在动物和人类生态、基因组进化和疾病中的作用,以及实现其在疾病治疗中的转化。至今,在Nature Biotechnology、Science,Nature,Nature Genetics等国际一流科技刊物上发表SCI论文70余篇,承担重大基金项目8项,申请专利6项。
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