中科院微生物所王军团队和中科院动物所宋默识团队合作,在Nature Communications发表文章Short- and long-read metagenomics expand individualized structural variations in gut microbiomes,报道了一种新方法,结合短读长的二代测序(Illumina)和长读长的三代测序(纳米孔)数据进行宏基因组分析,深入挖掘了人类肠道微生物组的基因结构变异、原噬菌体和CRISPR间隔元件,在菌株水平上揭示了肠菌功能差异以及与宿主代谢组和表型的关系。