赵立平团队：“功能群”分析或是人类肠道菌群研究的突破口

热心肠小伙伴们 2021-11-15

罗格斯大学、上海交通大学的赵立平团队在Genome Medicine发表观点文章，讨论了目前常用的菌群分析方法中存在的缺陷，提出了更具有生态学意义的基于“功能群”的研究策略，并列举了两个实例，说明了如何将这种研究思路应用于宏基因组和16S测序的数据分析，值得专业人士关注。

肠道菌群研究为探索疾病机理打开了一扇新的大门，但目前这一领域的研究存在着难以找到真正的“致病”微生物等难题。罗格斯大学、上海交通大学的赵立平团队在Genome Medicine发表观点文章Guild-based analysis for understanding gut microbiome in human health and diseases，讨论了目前常用的菌群分析方法中存在的缺陷，提出了更具有生态学意义的基于“功能群”的研究策略，并列举了两个实例，说明了如何将这种研究思路应用于宏基因组和16S测序的数据分析，值得专业人士关注。

专家简介

赵立平

美国罗格斯大学应用微生物学冠名讲席教授
上海交通大学微生物学特聘教授

在国内最早系统开展微生物分子生态学研究，在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作，取得了有意义的结果。在美国科学院院报（PNAS）, 国际微生物生态学会会刊（ISME Journal）、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物发表论文四十余篇，2012年6月，美国《科学》周刊曾对他的研究工作做过专题报道(Science 336: 1248)。

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