猪呼吸系统疾病是养猪业面临的主要挑战之一，可造成重大经济损失。长期使用抗生素治疗猪呼吸系统疾病会改变肺部微生物组和耐药组的组成。近期江西农业大学陈从英和黄路生院士与研究团队在Nature Communications上发表了其研究工作Characterization of the pig lower respiratory tract antibiotic resistome，利用745个猪下呼吸道宏基因组数据，建立了目前猪下呼吸道微生物组中最大的抗生素耐药基因（ARG）集，且首次研究了猪下呼吸道微生物群的抗生素耐药性与猪肺部病变间的关系。该研究对优化生猪生产中抗生素使用具有重要参考价值，并有助于了解猪下呼吸道微生物群的抗生素耐药性对猪肺部健康的影响。