古菌

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文章数：10篇

Nature子刊：一文读懂古菌的细胞生物学进展（综述）

古菌（又称古生菌、古细菌等），是单细胞微生物，多生活在极端的生态环境中。过去十年中揭示了古菌在自然界的多样性和普遍性，越来越多的研究强调了它们在生态学、生物技术甚至人类健康中的重要性。近日，德国弗莱堡大学在Nature Microbiology发表最新综述，描述了古菌细胞生物学的最新进展，并讨论了它们的形态、细胞组织、细胞包膜和内部组织结构特点。还论述了高度多样化古菌的两种细胞分裂机制，未来还需借助高性能的观测仪器、优化古菌培养条件等手段进一步挖掘古菌的新颖性，值得关注。

古菌细胞形态综述基础研究细胞生物学

国内团队Nature：发现阿斯加德古菌新分支悟空古菌

阿斯加德古菌（Asgard）是近期发现的一个新的古菌超门（superphylum）。多方面证据显示，真核生物可能起源于阿斯加德古菌，探讨阿斯加德古菌与真核生物起源是当前国际生命科学研究的前沿热点。近期国内深圳大学高等研究院李猛教授团队在Nature发表关于阿斯加德古菌研究的最新进展，他们对阿斯加德古菌的162个完整或几乎完整的基因组进行了比较分析，大大扩展了阿斯加德古菌的系统发育多样性，将阿斯加德古菌从原有的6个门增加到12个门，并将其中一个门命名为悟空古菌，进而对真核生物起源于阿斯加德古菌的假设进行了深入的探讨。

古菌研究论文基础研究阿斯加德古菌悟空古菌

微生物命名

Nature子刊：命名不可培养的古菌和细菌的两条路径（共识）

随着DNA测序技术的广泛应用，人们发现了大量不可培养的古菌和细菌，对于这些原核生物的命名目前仍缺少清晰、稳定的规则。为解决这一问题，在Nature Microbiology上发表的一篇共识声明文章提出了包含两条路径的路线图，并呼吁学界共同努力来完善和推进相关工作，推荐专业人士参考。

微生物命名细菌古菌共识声明

北大陆雅海组揭示群落构建过程的平衡介导农田土壤微生物群落物种共存

理解生物多样性的产生和维持是生态学的关键主题。目前，对于群落构建过程与微生物生态系统共发生物种的生态策略之间的关系仍然缺乏足够的了解。北大陆雅海组的博士后焦硕在ISME发表文章，揭示了不同生境和区域农业生态系统土壤微生物群落构建与物种共存生态策略之间的联系，可促进农业生态系统微生物群落的管理，基于重组和共现过程的恢复策略，以更好地应对生境破碎和气候变化。

群落构建农业微生态真菌细菌古菌

产甲烷古菌在过敏中的作用（综述）

古菌作为人体肠道菌群中的一员，对健康与疾病的影响常被忽视。Clinical Reviews in Allergy and Immunology上发表的一篇综述文章，详细介绍了产甲烷古菌与多种疾病的关联，并重点讨论了产甲烷古菌与宿主免疫系统的互作机制，以及产甲烷古菌的失调如何触发超敏反应及过敏性疾病。

古菌 Allergy Archaea Atopy Hypersensitivity

北京大学：环境过滤驱动农田生态系统土壤古菌独特的空间分布

对于陆地古菌生态的研究主要集中于自然生态系统，而农田是典型的人类管理的陆地生态系统，由于长期的耕作和施肥，农业生态系统和自然生态系统之间的土壤理化性质和生态系统过程有很大不同，进而影响其微生物群落构建。目前，对于水田和旱地农田土壤古菌群落生态多样性，以及优势古菌的空间分布模式（atlas）还尚不明确。北京大学陆雅海团队的这项研究，根据不同生境和环境偏好性，提供了详细的玉米和水稻土壤古细菌群落大陆尺度多样性模式和空间分布模式，为预测农业生态系统土壤古菌的空间分布和响应环境变化提供依据。

古菌农业生态系统空间分布模式环境过滤 Eran Elinav

Nature Reviews：被低估的人体古菌组

人体肠道中可能10%以上的厌氧微生物是古菌。此前的菌群研究，大多使用细菌和古菌的通用引物，或许严重低估了菌群中的古菌组成及其健康相关的作用。近期Nature Reviews Microbiology[IF：26.819]发表了相关评论短文，推荐关注。

古菌 Mary I Butler Timothy G Dinan

ISME：Micrarchaeota和Parvarchaeota古菌门的代谢多样性

Micrarchaeota门和Parvarchaeota门是古菌新发现的DPANN超门的成员，它们的基因组较小(~1 Mb)，但在自然界分布广泛，与其他古菌Thermoplasmatales目的成员存在共生或寄生关系。然而，Micrarchaeota门和Parvarchaeota门的生态功能、进化历程至今仍未研究清楚。本文通过宏基因组组装及分箱，丰富了数据库中现存Micrarchaeota门和Parvarchaeota门的基因组，并深入研究了它们的代谢多样性，揭示了Micrarchaeota、Parvarchaeota谱系相关的基因组共有和特有的特征，并为酸性矿山排水(AMD)和热泉群落的相互作用和生态功能提供了新的见解。

Micrarchaeota 古菌宏基因组组装代谢潜力 Parvarchaeota

mBio：特异检测人体不同部位的古菌组

古菌是人体菌群的组成部分，但相关研究十分有限。mBio[IF：6.956]发表的一项研究，使用古菌特异引物，首次分析了人体多个部位的古菌组特征，表明引物选择和测序数据分析方法可对结论产生显著影响，之前的研究低估了人体古菌组的多样性。这项工作为研究人体古菌组的构成、功能及其与健康的关系，打下基础。

古菌 Archaea archaeome methanogens Microbiome

极端嗜酸古菌的单菌基因组分析套路

Ferroplasma是极端酸性环境中极难分离培养的古菌，该研究首次获得Ferroplasma acidiphilum的全基因组完成图，获得了其代谢和进化的基本情况，同时为深入研究他们的进化地位、自然生态中的角色和功能提供了基础。

生物信息古菌极端嗜酸菌细菌基因组基因功能