动物菌群

猪呼吸系统疾病是养猪业面临的主要挑战之一，可造成重大经济损失。长期使用抗生素治疗猪呼吸系统疾病会改变肺部微生物组和耐药组的组成。近期江西农业大学陈从英和黄路生院士与研究团队在Nature Communications上发表了其研究工作，利用745个猪下呼吸道宏基因组数据，建立了目前猪下呼吸道微生物组中最大的抗生素耐药基因（ARG）集，且首次研究了猪下呼吸道微生物群的抗生素耐药性与猪肺部病变间的关系。该研究对优化生猪生产中抗生素使用具有重要参考价值，并有助于了解猪下呼吸道微生物群的抗生素耐药性对猪肺部健康的影响。

动物菌群抗生素耐药组下呼吸道猪

动物菌群

Nature子刊：灵长类肠道共生菌已从人类种群中灭绝

人类及其他灵长类动物拥有影响健康和疾病的复杂肠道菌群，但由于目前关于祖先灵长类动物菌群的信息有限，肠道共生菌的进化历史尚不清楚。近日，发表在Nature Microbiology上的这篇文章，发现早于人类多样化的宿主物种特异性细菌共生菌，其中许多已经从人类种群中加速灭绝。

动物菌群肠道菌群演化灵长类动物

动物菌群

吉林农大：母鸡自产卵起，便影响着后代的肠道发育与免疫？

营养物质会促进动物的免疫功能，母体良好的免疫也有利于后代健康。但母亲的免疫优势是如何转移给她们的后代，受益方式是什么？仍需深入探究。近日，吉林农业大学郑鑫及团队在Microbiome发表最新研究，将486只蛋鸡分为对照组和营养干预组，发现禽类肠道在胚胎期便开始微生物定植，这些微生物大多数溯源于母体生殖道，并且自胚胎期便影响着肠道的基因表达与发育。总之，该研究提出了生殖道菌群是改善动物健康的潜在资源之一，启发了禽类健康养殖的新方向，值得关注。

动物菌群母体效应肠道免疫肠道发育家禽

动物菌群

国内团队：滤食性牡蛎体内的病毒组具有明显的多样性和组织性

病毒与宿主相互作用，在海洋环境中起着至关重要的作用。目前的研究大多集中于海水中病毒，关于栖息在海洋动物身上的病毒研究屈指可数。滤食性双壳类动物牡蛎是沿海生态系统中的关键物种，然而它们在海洋病毒传播和沿海菌群调节中的作用尚不清楚。近日，中国水产科学研究院张殿昌、姜敬哲团队在Microbiome发表文章，发现滤食性牡蛎中具有非常多样化和组织良好的病毒组。

动物菌群牡蛎病毒组

动物菌群

倪学勤等：在小鼠中再现大熊猫的肠道菌群特征

四川农业大学的倪学勤和Jinge Xin团队在Microbiology spectrum发表文章，探究如何构建动物模型用于研究大熊猫的肠道菌群与消化疾病之间的关系。研究发现，相比于抗生素处理的假无菌小鼠，将大熊猫的粪菌移植到无菌小鼠能更好地再现大熊猫的肠道菌群特征。

动物菌群大熊猫无菌小鼠粪菌移植

鱼类菌群

Nature子刊：101种海洋鱼类的菌群分析

Nature Communications上发表的一项最新研究结果，对101种海洋鱼类的各部位菌群进行分析，鉴定了影响鱼类菌群生物量及多样性的因素，并探索了不同部位的种系共生（phylosymbiosis），同时对比了鱼类与其它脊椎动物（两栖动物、爬行动物、鸟类及哺乳动物）的菌群。

鱼类菌群研究论文基础研究其它动物动物菌群

动物菌群

毛胜勇+刘军花：全面分析反刍动物胃肠道菌群的维生素B和K2生物合成

在畜牧养殖中，向日粮中添加维生素有助于改善动物健康，但增加成本。很多胃肠道微生物具有合成维生素的能力，如能善加利用可帮助减少过多的维生素补充，从而降低养殖成本。南京农业大学的毛胜勇、刘军花与团队在Microbiome发表最新研究，全面分析了参与反刍动物维生素B族和K2生物合成的胃肠道微生物基因和基因组，揭示了维生素生物合成在胃肠道中的分布特点和饮食的影响，并特别分析了菌群的钴胺（维生素B12）生物合成。这些发现有望为增强反刍动物胃肠道微生物的维生素B族和K2生物合成，提供新的解决方案。

动物菌群反刍动物胃肠道菌群维生素B 维生素K2 生物合成

动物菌群

益生菌及合生制剂影响虹鳟鱼的肠道菌群及代谢组

动物菌群研究论文基础研究其它动物虹鳟鱼

动物菌群

圈养导致类人猿的菌群发生变化

Nature Communications近期发表的文章，对野生猿、圈养猿和人类的肠道菌群进行分析，发现野生猿的宿主限制性、共分化的细菌菌株在圈养环境中逐渐被人类限制性细菌菌株而替代，缺乏持久性和忠诚度。

动物菌群类人猿野生圈养

动物菌群

野生狮尾狒的肠道菌群季节性变化

肠道菌群组成的适应性变化是野生动物适应食物季节性变化的方式之一。来自Microbiome上发表的一项最新研究，分析了野生狮尾狒（一种非人灵长类动物）的肠道菌群季节性变化，发现降雨及温度分别通过影响食物供应及体温调节，影响狮尾狒的肠道菌群组成及功能。该研究结果提示，肠道菌群的可塑性为宿主提供了对食物及温度等环境变化的适应性。

动物菌群狮尾狒研究论文基础研究其它动物

动物菌群

四川农业大学：饮食、栖息地环境及生活方式如何影响大熊猫的肠道菌群

肠道菌群对于大熊猫的健康十分重要。四川农业大学的邹立扣团队在Science of the Total Environment上发表的一项最新研究，详细分析了饮食、栖息地环境及生活方式对大熊猫的肠道菌群（包括细菌与真菌）的影响。

动物菌群研究论文基础研究大熊猫

动物菌群

国内团队：一文读懂狗肠道菌群（综述）

动物菌群 Gut microbiota Dog Diets metagenomics

动物菌群

不同类型蜜蜂的肠道菌群差异

春季到秋季期间，成年工蜂可分为2类：年轻的为照顾幼虫的哺乳蜂（nurse），年老的为外出采蜜的觅食蜂（forager），一些于晚秋新出现的成年工蜂可成为冬季蜂。ISME Journal上发表的一项最新研究，对比分析了上述3种工蜂的肠道菌群，鉴定出了菌群负荷、多样性及组成的差异，并发现饮食中的花粉是造成差异的主要原因。

动物菌群蜜蜂 Joonatan Palmu Christin S Börschel Teemu Niiranen

动物菌群

地理区域及栖息地如何影响家蝇的体内及体表菌群

动物菌群家蝇地理区域栖息地 Xuebin Wang

动物菌群

栖息地变化影响北极熊的粪便菌群

来自ISME Journal上发表的一项最新研究，发现随着气候变暖，冰层熔化加快，一些北极熊开始从冰上迁移到陆地上生存，而栖息地的变化也显著影响了北极熊粪便菌群的多样性及组成。

动物菌群北极熊气候变暖 Isabella Parilli-Moser Sara Hurtado-Barroso

动物菌群

蚊子-共生菌-虫媒病毒的互作（综述）

蚊子共生菌群对宿主的生理功能有重要影响。《Current Opinion in Virology》近期发表综述，总结了蚊子共生菌群对宿主生理、虫媒病毒感染的影响，对于开发新型抗病毒药物、抗感染手段具有重要参考价值。

动物菌群蚊子-共生菌-虫媒病毒互作宿主-细菌-病毒互作 Christopher E Ramsden Christopher E Ramsden

动物菌群

华中农大黄飞若：低浓度氨气影响猪鼻菌群

来自华中农业大学的黄飞若团队在Frontiers in Microbiology上发表的一项最新研究，发现低浓度的氨气（20-25ppm）可显著影响猪的鼻菌群多样性、组成及功能，并影响了猪的健康及生长，建议养猪场氨浓度不应超过20ppm。

动物菌群鼻菌群猪氨气 Antonio Agudo

动物菌群

张吉斌：水虻及其肠道微生物联合转化有机废弃物的研究和应用

华中农业大学生命科学技术学院的张吉斌教授发表题为《水虻及其肠道微生物联合转化有机废弃物的研究和应用》的报告，介绍了水虻肠道微生物在保护环境、促进绿色发展中的作用。

动物菌群有机废物处理水虻

益生菌

马曦：饲用益生菌的筛选和功能鉴定

中国农业大学动物科技学院的马曦教授发表题为《饲用益生菌的筛选和功能鉴定》的报告，指出益生菌制剂是饲用抗生素替代物的最佳选择，高质量菌种的筛选是其作为饲料添加剂的关键一步。

益生菌动物菌群

动物菌群

彭楠：时空和饲料对小龙虾肠道微生物菌落结构的影响

华中农业大学生命科学技术学院的彭楠博士发表题为《时空和饲料对小龙虾肠道微生物菌落结构的影响》的报告，指出喂养发酵饲料通过影响肠道微生物可提高小龙虾的产量

动物菌群小龙虾

瘤胃菌群

王佳堃：调控消化道氢代谢微生物助力甲烷减排

浙江大学动物科学学院的王佳堃教授发表题为《调控消化道氢代谢微生物助力甲烷减排》的报告，指出植物提取物通过调控瘤胃氢代谢，降低甲烷的生成量。

瘤胃菌群动物菌群产甲烷

动物菌群

姚军虎：日粮可降解淀粉调控奶山羊瘤胃代谢的微生物组学机制

西北农林科技大学动物科技学院的姚军虎教授发表题为《日粮可降解淀粉调控奶山羊瘤胃代谢的微生物组学机制》的报告，指出日粮可降解淀粉通过降低氧化磷酸化进而影响瘤胃微生物。

动物菌群瘤胃菌群

动物菌群

赵江潮：早期干预猪的肠道菌群可改善宿主健康和生长情况

阿肯色大学动物科学系助理教授赵江潮博士发表题为《Early modulation of the swine gut microbiome improves animal health and growth performance》的报告，指出仔猪早期饲养在有土壤的环境中提高了肠道微生物的多样性，进而提高了生长效率。

动物菌群菌群干预猪

动物菌群

韩新燕：外源粪菌干预对仔猪肠道微生态的调控

浙江大学动物科学学院的韩新燕教授发表题为《外源粪菌干预对仔猪肠道微生态的调控》的报告，指出粪菌移植调节受体仔猪肠屏障功能或许是由色氨酸代谢物及其下游信号通路AhR-IL22轴调节。

动物菌群菌群移植

动物菌群

刘红宾：微生物垂直传递影响子代肠道微生物定植与功能发育的研究

中国农业大学动物科技学院的刘红宾博士发表题为《微生物垂直传递影响子代肠道微生物定植与功能发育的研究》，指出微生物垂直传递影响子代肠道微生物定植与功能发育的研究。

动物菌群早期菌群建立

动物菌群

晏向华：我国重要地方猪肠道微生物资源发掘与实践

华中农业大学动科动医学院的晏向华教授表题为《我国重要地方猪肠道微生物资源发掘与实践》的报告，指出粪菌移植（FMT）可缓解早期断奶仔猪的腹泻，该作用依赖于格氏乳杆菌分泌的GA蛋白。

动物菌群猪抗腹泻

抗生素替代物

曾建国：肠道宏基因组视野下饲用替抗产品作用机制研究

湖南农业大学动物医学院的曾建国教授发表题为《肠道宏基因组视野下饲用替抗产品作用机制研究》的报告，指出博落回提取物（MCE）能够促进乳酸菌的丰富度，抑制病原菌，增强氨基酸的合成，表明MCE作为饲用抗生素替代产品的潜力巨大。

抗生素替代物动物菌群肠道宏基因组

动物菌群

李晓平：模式动物的菌群研究

深圳华大生命科学研究院的李晓平博士介绍了小鼠、大鼠、猪到食蟹猴等模式动物对于肠道菌群的研究的贡献和价值。

动物菌群模式动物

动物菌群

张美玲：无菌斑马鱼模型在肠道微生物研究中的应用

华东师范大学生命科学学院的张美玲教授介绍了无菌斑马鱼模型在肠道微生物研究中的应用。

动物菌群斑马鱼无菌动物

动物菌群

李英：肠道菌群与大熊猫保护

四川农业大学动物遗传育种研究院的李英研究员发表了《肠道菌群与大熊猫保护》的报告，指出分析大熊猫的肠道菌群，有助于保护大熊猫的繁衍。

动物菌群大熊猫