肠道菌群多样性

肠道菌群与人类健康有这密切的关系，然而不同人群，不同年龄，不同饮食均表现为肠道菌群的复杂的多样化。从宿主角度和环境因素可以解释的肠道菌群差异不足20%，提示有更为复杂的生态因素参与肠道菌群复杂多样性和差异。分区在生态学中可以有效揭示群落多样性的内在和外在因素，因此分区可能是有效回答肠道菌群多样性决定因素的重要方法。但是，目前分区在肠道菌群的研究的应用中，通常只关注到特定群体，特定年龄范围的肠道菌群特征，而缺乏更大宏观尺度和时间尺度的分析。为了深入探讨肠道菌群多样性的决定因素，近期一篇发表在Nature子刊，Nature Communications上的研究针对3.5万个样本进行了分区、伪时间的分析，绘制了人类肠道菌群的全尺度图谱。这些结果为全尺度分析肠道菌群多样性特征和决定因素提供了重要的科学方法和依据。

肠道菌群多样性全尺度分支局部状态多样性决定因素研究论文

虚弱

肠道菌群多样性或与老年人虚弱无关

人变老的过程中通常伴随着虚弱的发生，包括身体机能下降、肌肉力量减弱、体重减轻、免疫力下降，最终影响老年人生活质量，增加无法自理、住院和死亡风险。虚弱的病理生理学十分复杂，但尚不清楚。肠道菌群影响着宿主健康的方方面面，菌群的紊乱与多种年龄相关的疾病有关，但尚无充足证据证明菌群是否驱动了老年人虚弱的发生。Ageing Research Reviews近期发表的这篇系统评价与荟萃分析表明，尽管虚弱和非虚弱老年人肠道内特定的菌群丰度存在差异，但没有证据显示二者肠道菌群存在整体上的多样性差异。

虚弱老年人肠道菌群多样性荟萃分析

婴儿菌群

Science：人类婴幼儿期的肠道菌群多样性

关于人类生命早期的肠道菌群建立和演变的规律，目前的研究主要集中在工业化地区的人群中，而对非工业化人群的婴幼儿肠道菌群还少有研究涉足。Science最新发表了来自斯坦福大学Justin Sonnenburg团队的研究，对全球不同生活方式的婴儿肠道菌群大数据进行了荟萃分析，并纳入了非洲哈扎部落婴儿的新样本，揭示出生活方式对生命早期菌群组成和功能的巨大影响。该研究特别关注了3个问题：不同生活方式的婴儿的肠道菌群组成和功能在何时开始“分道扬镳”，不同生活方式如何影响婴儿的特征微生物和功能，以及源自母亲的垂直传递在生活方式相关的婴儿菌群差异中所起的作用。该研究揭示了人类婴幼儿期的肠道菌群多样性，强调了研究工业化地区以外人群的重要性，也再次提出生命早期菌群多样性的丧失对工业化人群的长期健康有何影响这个问题。有兴趣的读者可以看看Martin Blaser教授的书《消失的微生物》和他的肠·道演讲，也许会有些答案。

婴儿菌群肠道菌群多样性生活方式

肠道菌群

婴儿肠道菌群影响因素研究汇总（综述）

肠道菌群研究论文婴儿肠道菌群多样性影响因素

城市环境

接触城市自然环境对婴儿菌群多样性有何影响？

与自然环境的接触被认为有益于人体共生菌群。《Environment International》上发表的一项队列研究，对355名城市婴儿的自然环境暴露及粪便菌群进行分析，发现在非母乳喂养且家中养宠物的婴儿中，与自然环境的密切接触与较低的粪便菌群α-多样性相关，但这种关联对健康的影响还需进一步研究。

城市环境城市环境出生队列研究婴儿生命早期菌群

肠道古菌组

韩国人的肠道古菌组中，嗜盐古菌很丰富

古菌是人体肠道菌群的组成部分，但对肠道古菌组的研究仍比较有限，此前研究认为产甲烷古菌可能是人肠道中最主要的古菌类型。Microbiome近期发表的一项研究分析了韩国人的肠道古菌的丰度和多样性，表明嗜盐古菌在肠道古菌组中广泛存在，并根据优势古菌的种类划分出4种古菌肠型。

肠道古菌组 Human gut Population-level metataxonomic analysis archaeome Haloarchaea

同种异体造血干细胞移植

NEJM：肠道菌群多样性可预测骨髓移植后的死亡风险

同种异体造血干细胞移植移植物抗宿主病肠道菌群肠道菌群多样性预后预测

肠-皮肤轴

紫外线可调节人肠道菌群组成，促进维生素D合成

肠道菌群在人类健康中扮演着越来越重要的角色。因此，许多研究集中在影响其微生物结构和功能的因素上，如饮食、年龄、性别、生活阶段、行为、种族、疾病等，并发现了它们之间强有力的联系。然而，关于微生物组影响因素的某些方面仍有待于探索。发表在《Frontiers in Microbiology》上的一项研究显示，皮肤暴露在窄波紫外线下可调节维生素D缺乏人群的肠道菌群，并促进维生素D的前体25-羟基维生素D合成。该研究表明，与阳光照射有关的人类生活方式应被视为调节肠道菌群的一种因素，指出了一种新的健康和疾病相关的皮肤-肠轴的存在。

肠-皮肤轴 16s UVB light diversity Microbiome

肠道菌群多样性

Nature子刊：血液代谢组可预测人肠道菌群多样性

肠道菌群多样性 Biomarkers Microbial communities Data integration machine learning

红酒

适量喝红酒或能增加肠道菌群多样性

Gastroenterology发表的一项通讯研究，分析了英国TwinsUK队列中900多名双胞胎的喝酒情况与肠道菌群多样性的关系，发现喝红酒与菌群α多样性增加显著相关，可能介导了红酒对体重和脂代谢的潜在益处。研究者认为，红酒富含的膳食多酚可能在其中起主要作用。

红酒 Gut microbiota Red wine epidemiology 肠道菌群多样性

宿主-菌群互作

Science子刊：线粒体基因型可影响肠道菌群多样性和组成

很多因素都可影响肠道菌群的组成，此前研究显示环境因素对菌群的塑造作用可能远超遗传的影响。《Science Signaling》本周以封面文章形式发表的一项研究表明，线粒体基因型通过影响活性氧（ROS）生成及其在体内的水平，可影响小鼠的肠道菌群多样性和组成，显示出遗传因素对菌群组成的影响，抗氧化药物干预或许是提高菌群多样性的潜在方法，或为治疗菌群相关疾病带来启示。

宿主-菌群互作线粒体线粒体DNA 遗传肠道菌群多样性

菌群-宿主互作

年龄和性别如何影响肠道菌群多样性？

人类肠道菌群的多样性随宿主年龄增长而改变，宿主性别也对菌群多样性具有影响。《mSystems》近期发表人群研究，纳入来自美国、英国、哥伦比亚和中国共计9000余名参与者，发现年龄和性别对于肠道菌群多样性的影响具有一定的人群差异性。该结果有助于进一步研究宿主特点对共生菌群的影响。

菌群-宿主互作 16S rRNA amplicon age diversity Microbiome

环境影响

圈养vs野生环境对鹿鼠肠道菌群的影响

肠道菌群的多样性和组成受多种因素影响，ISME Journal近期发表的一项研究以鹿白足鼠为模型，揭示了生活环境对动物肠道菌群的重要影响作用。

环境影响动物肠道菌群微生物生态学肠道菌群多样性鹿白足鼠

造血细胞移植

骨髓移植后，肠道菌群多样性恢复，但组成结构面目全非

来自Bone Marrow Transplantation的一篇通信文章，报道了3名白血病患者进行骨髓移植治疗前后的肠道菌群变化，表明虽然菌群的多样性逐渐恢复，但其组成结构与原来有很大差异，这种菌群变化的影响有待进一步研究。

造血细胞移植肠道菌群多样性肠道菌群组成和功能 Christopher M Mazzone Jing Liang-Guallpa

同种异体造血干细胞移植

菌群多样性影响接受造血干细胞移植的患者生存率

肠道菌群多样性从多个方面影响人群健康。本文回顾了接受了造血干细胞移植的病人罹患移植物抗宿主病的相关研究，指出菌群多样性与患者生存率有显著联系，强调了维护、恢复肠道菌群多样性对改善移植物抗宿主病患者预后情况的重要作用，值得专业人士关注。

同种异体造血干细胞移植粪菌移植移植物抗宿主病肠道菌群多样性

饮酒

适度饮酒影响肠道菌群

酒精很可能通过改变肠道菌群来影响人类健康。本研究发现，适度饮酒对肠道菌群的多样性会产生影响，动物模型显示短时间适度饮酒降低菌群多样性，有引起菌群失调的风险。然而实验动物和人肠道菌群多样性的变化趋势并不相同。该成果对研究饮酒对不同类型宿主肠道菌群的影响具有启发性，值得专业人士参考。

饮酒肠道菌群多样性大鼠人类 Alcohol

心血管

肠道菌群多样性越低，动脉硬化越厉害

心血管领域的高分刊物European Heart Journal[IF：19.651]近期发表研究，首次在人体中证实，肠道菌群多样性与动脉硬化程度相关，并鉴定出与动脉硬化负相关的7个菌群成员。此外，该研究还发现菌群对动脉硬化程度的影响，可能与包括氧化三甲胺在内的菌群代谢物、代谢综合征和炎症因素关系不大。以肠道菌群为靶点或是改善动脉老化的新策略。

心血管动脉僵硬度动脉硬化动脉老化肠道菌群多样性

饮食减肥干预

Obesity Facts：低热量饮食减肥改变菌群，但不持续

① 肥胖患者接受3个月的低卡路里饮食以减肥，随后3个月保持体重；② 接受3个月的低卡路里饮食后，肥胖患者的厚壁菌门/拟杆菌门的比值显著改变；③ 不动杆菌属是观察效应中的指示物种；④ 代谢分析发现了核黄素通路的显著变化；⑤ 菌群组成及代谢的变化在保持体重的3个月中消失。

饮食减肥干预肠道菌群多样性新陈代谢 Manuel T Velasquez Dominic S Raj

双胞胎

PLoS One：中国婴儿菌群改变的主因是什么？

10对0-6岁的中国双胞胎婴儿（5对同卵双生、5对异卵双生），他们的菌群发展有什么规律？有什么区别？菌群代谢通路水平怎样？什么对菌群影响最大？看看这篇文章吧，貌似是中国的第一个针对双胞胎的菌群研究。

双胞胎肠道菌群代谢通路肠道菌群多样性 Wei Liu Zhenhua Liu

芽囊原虫属

Microbiome：是否感染芽囊原虫，不影响IBS病人的菌群

芽囊原虫属阳性或阴性的肠易激综合征患者的粪便菌群上会有显著差别么？看看这篇文章。

芽囊原虫属肠易激综合征粪便菌群肠道菌群多样性 Tanika N Kelly

肠易激综合征

Gut：粪菌移植应对IBS，有良好效果

限制摄入可发酵寡/双/单糖和多元醇(FODMAP)，是很多医生给IBS患者的选择，但这使得肠道菌群失衡，并不是最佳方案。那试试粪菌移植呢？Hi Microbes #1群的王军老师参与的这个研究，给了我们不错的正面答案。

肠易激综合征肠道菌群多样性链球菌可发酵寡/双/单糖和多元醇粪菌移植

中国HIV感染者

SR：感染HIV的中国人，粪便菌群有何变化？

李兰娟院士等新发表的研究，值得看一看。

中国HIV感染者高效抗逆转录病毒治疗 HIV 肠道菌群多样性肠道菌群紊乱

肠道菌群多样性

微生物：继代失踪的类群

① 菌群可获取的碳水化合物（MACs）来源于膳食纤维，工业化的社会使膳食纤维摄入减少，进而肠道菌群的生物多样性也有所降低；② 利用人源化小鼠模型，发现由高MAC饮食转为低MAC饮食的小鼠肠道微生物多样性会丧失，但可通过在饮食中重新引入纤维来部分扭转；③ 初代消失的菌群在随后的世代中不可逆转地从肠道丢失，补充MAC可以恢复初代小鼠部分菌群，但对于后三代小鼠的菌群多样性影响不大；④ 粪菌移植结合MAC可以恢复后代小鼠的菌群多样性。

肠道菌群多样性膳食纤维

二甲双胍

Cell子刊：二甲双胍改变糖尿病人肠道菌群

神奇的二甲双胍，经典的菌群研究，来自今年1月份的Cell Metabolism，特别再次分享。

二甲双胍二型糖尿病宏基因组氨基酸代谢短链脂肪酸

黄连素

赵立平团队：黄连素和二甲双胍应对肥胖？

黄连素和二甲双胍通过调节肠道菌群在临床中治疗二型糖尿病：① 两种药物都可逆转高脂肪饮食引起的小鼠肠道菌群的改变；② 两种药物都可显著降低肠道菌群多样性；③ 134种与肥胖表型相关的OTU受两种药物调控；④ 60种OTU会减少而产短链脂肪酸菌株会增加。

黄连素二型糖尿病二甲双胍产短链脂肪酸细菌赵立平

黄连素

黄连素预防高脂肪餐饲养大鼠肥胖及胰岛素抵抗过程中肠道菌群的结构性变化

黄连素处理高脂肪餐（HFD）饲养大鼠，血清脂多糖结合蛋白、单核细胞趋化因子蛋白-1、瘦蛋白升高，而校正的血清脂联素下降；肠道菌群多样性明显受抑；肠道菌群结构发生改变，产短链脂肪酸的菌种增加；菌群种类的离散，与宿主的代谢表型相关。减少外源性抗原负荷、提高SCFA可减轻肠道炎症。

黄连素脂多糖结合蛋白单核细胞趋化因子蛋白-1 脂联素肥胖