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Patrick T West
文章数:2篇
多组学揭示近平滑念珠菌对新生儿菌群的遗传和行为适应
近平滑念珠菌病是侵袭性念珠菌病的常见原因之一,尤其是在新生儿中,且其感染率逐年增加。目前对近平滑念珠菌的研究主要集中在其纯培养物中进行,目前尚不清楚其在菌群环境中的功能。发表在Microbiome上的这篇文章,利用鸟枪法宏基因组学、宏转录组学和宏蛋白质组学研究近平滑念珠菌在新生儿肠道和医院环境中的行为和进化,发现近平滑念珠菌在肠道与实验室环境中的功能的具有显著差异,造成医院菌株持续存在并转移到新生儿菌群,从而引发近平滑念珠菌感染。
肠道菌群建立
早产儿与婴儿病房内的真核生物
对于婴儿早期真核生物定植的研究相对较少。《Microbiome》近期发表研究,比较了早产儿和婴儿病房环境样品中的宏基因组数据,从中组装出14个新的真核基因组,显示真菌和其他真核生物在生命早期就可以定植于肠道中,病房环境真核生物不仅可能影响婴儿早期真核菌群的建立,也存在发生院感的风险。本文一定程度填补了生命早期共生真菌群建立的知识空白,值得参考。
肠道菌群建立
Eukaryotes
Genome-resolved metagenomics
Hospital microbiome
metagenomics