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Zhibo Huang
文章数:1篇
宏基因组
华大基因:SOAPMetaS实现分布式集群高效分析宏基因组大数据
在宏基因组研究中,数据量的快速增长对有效处理大型数据集的新工具提出了更高的要求。为了在大数据情况下加速宏基因组分析过程,作者开发了SOAPMetaS,这是一种基于标记基因的多样本宏基因组分析工具,该工具建立在Apache Spark之上。SOAPMetaS展示了处理大型数据集的高性能和可扩展性。SOAPMetaS可以加速大量多样本宏基因组数据的分析过程,并生成准确的分析结果并可以帮助研究人员有效地获取各种微生物组群落的物种分类和基因组成信息。除了对宏基因组分析外,用户还可以将“比对”模块用作快速的独立分布式比对工具。
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