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菌群-代谢物
文章数:6篇
数据库
用于识别菌群和代谢物间关联的数据库
对人类粪便样本中获得的菌群和代谢物数据进行综合分析,可更好地了解人体肠道细菌和代谢物间的关联,以及其在健康和疾病方面的作用。近日,以色列特拉维夫大学研究人员在NPJ Biofilms and Microbiomes发表最新研究,通过14项人类成对的肠道菌群-代谢组数据构建数据库,发现通过菌群组成可较好预测97种代谢物,还识别多种菌属和代谢物间的关联(尤其是颤杆菌属及另枝菌属为高代谢物关联菌属),在肠道生态系统中可能发挥重要作用。总之,该研究为未来进一步探究菌群和代谢物间的联系提供了新视角。
数据库
菌群-代谢物
荟萃分析
基础研究
随机森林模型
菌群-肠道-大脑轴
罗伊氏乳酸杆菌代谢产物或可缓解抑郁
随着生活压力不断增大,越来越多的人群患上了心理疾病,其中重度抑郁症(Major depressive disorder,MDD)就是一类常见的情绪障碍疾病,是由患者个体的遗传系统异常或获得性环境的变化引起的情绪功能障碍。尽管有研究表明,肠道菌群变化可引发或改善抑郁症,但由于菌群代谢产物的数量稀少且易被代谢的特点,使得在代谢物水平的研究受到了极大限制。发表在《Translational Psychiatry》上的一项研究,分析了社会挫败应激(SDS)小鼠模型肠道菌群和代谢物变化,发现SDS显著增加肠道罗伊氏乳杆菌(L.reuteri)及其产生的麦角硫因(ergothioneine )含量,且口服麦角硫因可显著改善SDS导致的社会回避行为及睡眠异常,表明了肠道细菌在治疗情绪障碍疾病中的巨大潜力。
菌群-肠道-大脑轴
小鼠实验
菌群-代谢物
压力
睡眠障碍
菌群-代谢物
东非狒狒不同肠段菌群和代谢物的组成
目前关于不同肠段菌群组成的研究主要集中在老鼠、鸡和狗等动物模型,而对人体或非人类灵长类动物的研究较少。《mSystems》的这篇文章介绍了关于和人类同属灵长类的东非狒狒的研究。相比人类,对东非狒狒的研究避免了取样前的肠道准备工作,因此能保证肠道菌群组成不被影响。该研究发现东非狒狒大肠段关于癌症相关的代谢途径多余小肠,或许能解释人了大肠癌发的概率高于小肠癌发的概率,另外也发现芸苔属蔬菜与肠道有益菌群有关,认为其可作为益生元的候选。
菌群-代谢物
microbiota
metabolome
Host-Microbiota Interactions
nonhuman primate
菌群-代谢物
肠杆菌素介导口腔微生物间的相互作用
众多的口腔微生物之间存在合作代谢现象。一些种属的细菌可以改变局部微环境,使其有利于或抑制其他种属细菌的生长。罗斯氏菌(Rothia)是口腔内广泛存在的一类共生细菌,目前对该类细菌在口腔内的定植机制研究十分有限。发表在《mSystems》上的一项研究发现,含有儿茶酚类铁载体合成基因簇的罗斯氏菌可合成铁载体——肠杆菌素,并研究了共培养中R.mucilaginosa及纯化的肠杆菌素对其他共生细菌生长的影响,表明肠杆菌素作为一种铁载体参与了口腔微生物之间的的相互作用。
菌群-代谢物
铁载体
肠毒素
共生生物-菌群互作
口腔微生物群
肠道菌群与疾病
湖北中医药大学:壳寡糖或可用于治疗下肢缺血性疾病
下肢缺血性疾病主要由动脉硬化性闭塞症,糖尿病及血栓闭塞性脉管炎等引起的一种严重危害健康、致残率较高的疾病,其发生率随年龄的增长而明显增加。壳聚糖(chitosan)是由自然界广泛存在的几丁质(chitin)经过脱乙酰作用得到的,具有血液相容性好、安全性高、微生物降解性强以及抗炎、免疫调节、抗肿瘤、抗氧化等优良性能。湖北中医药大学刘洪涛和胡海明团队发表在《Carbohydrate Polymers》上的一篇文章探究了壳寡糖在后肢缺血小鼠模型中的有益作用,指出了壳寡糖在治疗外周缺血性疾病中的潜在作用。
肠道菌群与疾病
Lower limb ischemia
Chitosan oligosaccharides
Gut microbiota
metabolomics
菌群-代谢物
Nature子刊:多形拟杆菌中糖胺聚糖代谢途径解析
糖胺聚糖(GAG)是多形拟杆菌(B.thetaiotaomicron)主要的优先利用营养素。按单糖残基、残基间连键的类型以及硫酸基的数目和位置,GAG可分为5个主要类别:透明质酸(HA)、硫酸软骨素(CS)、硫酸皮肤素(DS)、硫酸角质素(KS)及硫酸乙酰肝素和肝素(HP)。尽管HP代谢途径以及参与CS代谢的酶已有报道,但CS、DS、HA的代谢途径以及各个酶之间是如何协调作用的还不清晰。发表在《Nature Communications》上的一篇文章对多形拟杆菌的多糖利用基因座(PUL)进行了深入研究,鉴定了两个新的GAG结合蛋白,与多糖裂解酶(PL)协同作用促进GAG利用。并进一步研究了不同PL及其对应突变体的底物利用度、硫酸酯酶的三维结构以及PUL在不同拟杆菌的分布情况,填补了肠道细菌在糖胺聚糖代谢方面的空白。
菌群-代谢物
多形拟杆菌
糖胺聚糖(GAGs)
多糖利用基因座
GAG结合蛋白