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李兆明/陈卫华/张明智：产丁酸的普拉梭菌通过抑制JAK-STAT通路抑制自然杀伤/T细胞淋巴瘤

郑州大学第一附属医院李兆明、张明智和华中科技大学陈卫华作为通讯作者发表研究，揭示了自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL）患者的肠道菌群特征，表明肠道菌群中的产丁酸菌——普氏粪杆菌（F. prausnitzii）能通过抑制JAK-STAT信号通路，改善NKTCL，为NKTCL的治疗提供了新视角。

陶凯雄+陈卫华等：肿瘤内微生物促进胃肠间质瘤肝转移

华中科技大学陶凯雄、陈卫华和Xiangyu Zeng在Cancer Letters发表最新研究，通过收集未经治疗的手术切除新鲜肠道间质瘤（GIST）组织测序，采用机器学习算法进行特征选择，筛选并构建了微生物组特征的GIST肝转移预测模型（长期肝脏转移富集属）。

刘智/陈卫华/张瑞林/孙鹥：多靶点益生菌群或可治疗肥胖

华中科技大学刘智、陈卫华和昆明医科大学张瑞林以及昆明理工大学附属医院孙鹥合作，通过筛选多菌株组合，成功开发出能有效对抗高脂饮食诱导的小鼠肥胖的共生益生菌群。

陈卫华/刘智/何一凡：面部微生态与皮肤老化的关系

华中科技大学陈卫华和刘智、北京工商大学何一凡及团队发表研究，通过整合分析面部微生物组与皮肤生理光学特性，揭示了与皮肤类型相关的衰老效应。

赵兴明/陈卫华等Science子刊：绘制人类肠道病毒组的遗传图谱

遗传变异对于揭示噬菌体进化和解读其功能意义至关重要，复旦大学赵兴明、华中科技大学陈卫华与团队通过长读测序技术探索了肠道噬菌体组中的精细尺度遗传变异，特别是结构变异（SVs）。

赵兴明+陈卫华：VirRep助力从人类肠道微生物组中识别病毒

复旦大学赵兴明、华中科技大学陈卫华与团队发表研究，开发出一种人类肠道微生物基因组语言混合表征学习框架VriRep，能够整合基因组语义信息和序列同源性表征DNA序列，从而更精准地识别人类肠道环境中的病毒基因组。

陈卫华+王燕：基于口腔宏基因组的牙周炎的通用特征

华中科技大学陈卫华、王燕与团队发表研究，分析了来自三个大洲五个国家的八个口腔宏基因组队列，揭示了牙周炎的通用口腔微生物组特征。

陈卫华+刘庆友等：反刍动物肠道病毒群落中存在高比例的裂解性噬菌体

华中科技大学陈卫华、佛山大学刘庆友与团队，基于8种反刍动物10个胃肠道位点的2333个样本，构建出统一反刍动物噬菌体目录，用于表征不同反刍动物和胃肠道位点中噬菌体基因组的分布。

赵兴明+陈卫华+刘智：组合短、长读长测序可高效恢复肠道病毒基因组

复旦大学赵兴明团队与华中科技大学陈卫华和刘智团队，通过富集病毒样颗粒（VLP）和短读、长读测序相结合，成功组装出中国肠道噬菌体目录（CHGV），其中约35%的vOTUs为完整基因组，揭示了肠道噬菌体的巨大多样性和功能能力。

张必翔/杨祥良/刘智/陈孝平/陈卫华Cell子刊：调肠菌可改善肝癌手术预后

Cell Host and Microbe最新发表了来自华中科技大学张必翔、杨祥良、刘智、陈孝平、陈卫华与团队的重要研究，结合队列分析、小鼠实验和临床试验等手段，发现长双歧杆菌对促进肝癌术后肝功能恢复、提高生存率具有积极作用，并探索了背后的肠-肝轴机制。这项研究为肝癌术后治疗提供了新策略，强调了调节肠道菌群的重要作用。

陈卫华+赵兴明：抑酸药PPI促口腔菌入肠，破坏肠道菌群

华中科技大学的陈卫华和复旦大学的赵兴明合作在Gut发表文章，发现质子泵抑制剂（PPI）比组胺-2受体拮抗剂（H2RA）对肠道微生物组和口-肠传播的影响更大，从而揭示了与长期使用PPI相关的某些疾病风险更高的机制。

刘庆友+陈卫华：构建山羊肠道微生物基因组目录

佛山科学技术学院刘庆友、华中科技大学卫华与团队近期在Microbiome发表研究，对来自不同胃肠道部位、不同年龄、不同饲养方式和不同地理位置的268只山羊的497个样本进行了全面的微生物生态结构调查。

赵兴明+郑琰+陈卫华：人类的4种真菌“肠型”结构

复旦大学类脑智能科学与技术研究院赵兴明教授、人类表型组研究院郑琰研究员，以及华中科技大学的陈卫华教授在Microbiome上发表了题为Enterotypes of the human gut mycobiome的研究论文。此研究揭示了肠道真菌组成高度结构化的性质，并发现其与宿主表型之间的紧密相关性。

陈卫华+赵兴明+刘智：大规模解析人类肠道噬菌体的DNA甲基化

DNA甲基化在噬菌体的生存中起着至关重要的作用，但对其基因组甲基化的理解仍然有限。近日，华中科技大学陈卫华和刘智、复旦大学赵兴明、欧洲分子生物学实验室Peer Bork及团队在Advanced Science发表最新研究，使用单分子实时测序分析了来自104个粪便样本的近9000个宏基因组组装的高质量噬菌体的DNA甲基化模式，发现肠道噬菌体普遍存在甲基化，进一步分析揭示广泛的DNA甲基化与其编码的甲基转移酶有关，值得关注。

陈卫华+赵兴明等：基于肠菌的机器学习模型对20种疾病的诊断性能如何？

近日，复旦大学赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Gut Microbes发表最新研究，系统地评估了基于肠道菌群的机器学习分类器对20种疾病的跨队列分类性能，发现可以使用肠道菌群作为独立的、跨队列的诊断工具，但仅用于少数肠道疾病。

陈卫华+赵兴明等：用于识别和校正宏基因组数据装配错误工具—metaMIC

近日，复旦大学类脑智能科学与技术研究院Luis Pedro Coelho、赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Genome Biology发表最新研究，开发了一种基于机器学习，用于全自动识别和纠正宏基因组数据中装配错误的工具metaMIC（https://github.com/ZhaoXM-Lab/metaMIC），通过模拟和真实数据集验证，发现metaMIC的性能良好可为下游分箱提供可靠基础，值得测试。

张明智+陈卫华+李兆明：肠道菌群可作为NK/T细胞淋巴瘤的诊断和预后标志物

郑州大学第一附属医院张明智、李兆明及华中科技大学陈卫华团队近日在Gut发表最新文章，建立了用于NK/T细胞淋巴瘤诊断和预后的肠道菌群标志物模型，支持肠道菌群成为NK/T细胞淋巴瘤的有效无创辅助诊断工具。

刘庆友+陈卫华+滑国华Nature子刊：构建水牛肠道微生物基因组目录

广西大学刘庆友、华中科技大学陈卫华和华中农业大学滑国华及团队在Nature Communications上发表文章，在国际上首次提供了完整的水牛肠道微生物基因组目录。该成果为水牛肠道菌群相关研究以及分析肠道菌群对水牛粗纤维消化率、产奶性状、生长速度等经济性状的影响提供了重要的数据基础和挖掘蓝图。

陈卫华+赵兴明+赫丽杰：实现疾病标志物识别和跨数据集比较的人类肠道菌群数据库GMrepo v2

GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库，其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性，并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2，在这个新版本中，作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。

陈卫华+刘智+赵兴明：人体菌群及其与健康和疾病关联的精选数据库 mBodyMap

华中科技大学陈卫华、刘智和复旦大学赵兴明作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，报道了mBodyMap——一个针对人体菌群及其与健康和疾病关联的精选数据库。