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黄适
香港大学牙学院长聘教轨助理教授  
黄适，近年来作为（共同）第一或通讯作者在Nature Methods，Cell Host Microbe，Microbiome，Genome Biology，ISMEJ，mSystems，Gut Microbes，mBio等国际知名学术期刊发表论文12篇，共计论文超30篇。申请发明专利7项，其中授权国际专利2项、国内专利2项。主持和参加包括国家青年自然基金等多项基金项目。
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郑心+黄适等：肠道菌群可介导肺腺癌治疗疗效
哈佛医学院Zheng Sun、青岛市中医特色卫生院郑心、香港大学黄适与团队发表研究，对携带PC-9肿瘤的小鼠进行不同治疗的肠道菌群变化纵向研究。
02-26
翟齐啸+张家超+黄适Cell子刊：益生菌如何改善便秘？锁定菌株特异性背后的关键遗传因子
江南大学陈卫院士翟齐啸教授团队、海南大学张家超教授团队和香港大学黄适教授团队合作，在Cell Host and Microbe发表重要研究，鉴定出影响长双歧杆菌对功能性便秘疗效的关键细菌遗传因子——abfA基因簇，并结合体外实验、多种小鼠模型、队列分析和临床试验等多种方法，对相关发现进行了系统性验证，揭示了其背后的潜在机制，表明益生菌和菌群中的特定遗传因子可在决定菌群功能和宿主表型上发挥关键作用。
2023-11-22
张家超+黄适：基于多队列人群肠菌的SNV或可用于评估肠道健康状态？（荟萃分析）
近日，海南大学张家超、香港大学黄适及团队在mSystems发表最新研究，通过荟萃分析描述了多个人类队列中不同健康状态下肠道微生物的普遍进化模式。发现微生物遗传变化可先于与宿主生理变化相关的生态变化，从而为疾病预测建模提供一个新的宏基因组数据信息层。此外，发现SCFAs产生的一些遗传生物标志物可以覆盖荟萃分析中涉及的大多数慢性疾病，值得关注。
2023-11-10
张家超+黄适+翟齐啸等：塑造益生菌的肠内进化，土著菌群vs宿主因素谁胜出？
近日，海南大学张家超、香港大学黄适和江南大学翟齐啸及团队在npj Biofilms Microbiomes发表最新研究，利用GF和SPF小鼠区分宿主及肠道菌群对益生菌肠道内进化的驱动贡献，并确定激烈的微生物竞争是益生菌在肠道内进化的主要驱动力，而宿主贡献度小于0.5%，为利用肠道菌群进行微生物的突变驯化提供指导。
2023-10-17
《热心肠日报》解读 更多>>
iMeta：青大苏晓泉组发布跨平台可交互的菌群分析平台PMS
① Parallel-Meta Suite（PMS）是一个易用的软件包，可以在多个平台上进行快速、全面的菌群数据分析；② PMS涵盖了广泛的数据预处理和统计方法，并提供最新的可视化结果；③ PMS的整个流程通过并行计算方案进行了优化，可以快速处理数千个菌群数据；④ PMS的整体计算框架主要由C++开发，该语言与脚本语言相比，拥有更快的运行速度和更高效的内存使用方式；⑤ PMS还具有多操作系统兼容、简易安装与全自动运行等特性。
2022-03-06
黄适+徐健+王师：2bRAD-M实现对低生物量或降解菌群进行种水平测序
① 2bRAD-M是一种高度简化且低成本的策略，仅对约 1% 的宏基因组进行测序，可产生物种水平的细菌、古菌和真菌图谱；② 对于DNA总量只有1pg，宿主DNA污染程度高或降解样本中DNA出现严重碎片化等难以测序的样品，2bRAD-M可准确生成物种水平分类图谱；③ 2bRAD-M 在各种粪便、皮肤、环境和临床中福尔马林固定石蜡包埋的样本上测试，可以成功重建全面、高分辨率的微生物图谱。
2022-01-26
徐健+黄适：菌群和多组学分析揭示何为“牙龈亚健康”
① 纳入40名成人，测定牙菌斑菌群和代谢组及唾液细胞因子在从健康到牙龈炎期间的变化；② 这些测量指标在停止刷牙后1-3天就已迅速改变，标志着牙龈进入亚健康（SoH）阶段，其特征包括11种唾液细胞因子活化、牙菌斑中有潜在保护作用的甜菜碱和罗氏菌快速协同减少；③ 对不同队列的荟萃分析显示，在SoH阶段牙菌斑菌群的组成和功能特征已与牙周炎高度接近；④ 持续的SoH发展能加速牙菌斑菌群衰老，28天内的衰老程度相当于牙龈健康时1年的衰老。
2021-03-09
张和平、魏泓等：生命早期环境暴露影响肠道菌群发育
① 无菌小鼠分别暴露于草原、森林和沙漠土壤环境中60天后，再部分转移到另外两种环境，收集粪便样本；② 来自不同环境类型的土壤菌群可成功地在小鼠肠道内定殖，不同土壤小鼠的肠道菌群组成和功能显著不同；③ 早期定殖的肠道菌群在环境转移中会显著影响肠道菌群的发展，形成”优先效应“，导致在环境变化后，出生地相关的分类群及功能特征仍持续存在；④ “优先效应”部分解释了早期土壤暴露对生命后期肠道菌群可塑性的影响。
2020-12-31
苏晓泉、徐健等：基于微生物组大数据的疾病检测方法
① 肠道菌群进行疾病诊断手段受到微生物实验的准确性、重现性，及微生物组高通量数据等多方面的影响；② 本研究利用前期的微生物搜索引擎开发了基于菌群大数据搜索的疾病检测新策略；③ 第一步通过计算待测样本相对于数据库中所有微生物数据得到离群微生物组新颖性评分，确定样本健康与否；④ 第一步中检测到的不健康样本与数据库中多种疾病的参照样本比对，进行疾病分类；⑤ 该方法使用便捷、快速、适用范围广，能够降低漏诊和误诊率。
2020-03-17
中科院徐健团队：基于皮肤菌群的特应性皮炎诊断及疗效评估
① 纳入来自北京、青岛及美国的116名特应性皮炎（AD）患儿及73名健康儿童，分析对比皮肤菌群的差异；② 基于25个皮肤细菌属，能够以86.4%的准确率诊断出AD患儿（AUC=0.90）；③ AD患儿的非病变皮肤处的菌群组成与病变皮肤处相似，且与健康儿童的皮肤菌群不同，以金黄色葡萄球菌的富集为特征；④ 利用基于菌群的皮肤健康指数（MiSH），可将症状相同的AD患儿分为2组，2组之间的菌群多样性及治疗效果不同。
2019-08-20
青岛能源所徐健+苏晓泉等：微生物组的“三大指数”
① 开发微生物组搜索引擎，可实现菌群的快速比对和搜索；② 用户只需提供菌群的OTU表，即可在数据库收录的>10万的菌群研究数据中展开搜索，结果可在1秒内返回，给出菌群的“新奇指数”（MNS）、“关注指数”（MAS），和基于二者的“影响力指数”（MFI）；③ 通过 MFI 可对菌群样本/项目新颖性和学界关注度进行追踪和比较，并对未来趋势作出预测；④ 海洋、室内环境、母婴互作等菌群研究领域，或将成为未来研究火热的“睡美人”领域。
2018-11-13
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注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者
2024
CARevealing the role of the gut microbiota in enhancing targeted therapy efficacy for lung adenocarcinoma
EXP HEMATOL ONCOL, 10.1186/s40164-024-00478-7
2023
CAA key genetic factor governing arabinan utilization in the gut microbiome alleviates constipation
Cell Host Microbe, 10.1016/j.chom.2023.10.011
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CACross-cohort single-nucleotide-variant profiling of gut microbiota suggests a novel gut-health assessment approach
mSystems, 10.1128/msystems.00828-23
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CANative microbiome dominates over host factors in shaping the probiotic genetic evolution in the gut
NPJ BIOFILMS MICROBI, 10.1038/s41522-023-00447-8
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FACAEmerging paradigms in exploring the interactions among diet, probiotics, and cancer immunotherapeutic response
Innovation, 10.1016/j.xinn.2023.100456
2022
FACASpecies-resolved sequencing of low-biomass or degraded microbiomes using 2bRAD-M
GB.C, 10.1186/s13059-021-02576-9
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2021
FALongitudinal Multi-omics and Microbiome Meta-analysis Identify an Asymptomatic Gingival State That Links Gingivitis, Periodontitis, and Aging
mBio, 10.1128/mBio.03281-20
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头衔
香港大学牙学院长聘教轨助理教授  
简介
黄适，近年来作为（共同）第一或通讯作者在Nature Methods，Cell Host Microbe，Microbiome，Genome Biology，ISMEJ，mSystems，Gut Microbes，mBio等国际知名学术期刊发表论文12篇，共计论文超30篇。申请发明专利7项，其中授权国际专利2项、国内专利2项。主持和参加包括国家青年自然基金等多项基金项目。
教育经历
2012年~2016年：中国科学院大学/中国科学院青岛生物能源与生物过程技术研究所，单细胞中心，生物化学与分子生物学，博士
2008年~2011年：上海师范大学，生命与环境科学系 水生生物学，硕士
2009年~2011年：中国科学院青岛生物能源与生物过程技术研究所，联培硕士
工作经历
2022年~至今：香港大学牙学院，长聘教轨助理教授
2018年~2021年：加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心，博士后学者
2017年~2018年：加州大学圣地亚哥分校儿科和计算机工程学院，博士后学者
2016年~2018年：中国科学院青岛生物能源与生物过程技术研究所，单细胞中心，博士后学者
主要研究领域与方向
研究方向聚焦在：(1) 基于微生物组的医学诊断工具，(2) 开发简化宏基因组学工具解决低生物量样品微生物组分析挑战，(3) 机器学习在微生物组meta-analysis中的应用，(4) 肠道益生菌适应性进化原理及应用机制
所获荣誉
2020年，青岛市科学技术进步奖二等奖
其他专家 更多>>
康禹
中科院北京基因组研究所，中科院基因组科学与信息重点实验室，研究员
孙嘉
江南大学食品学院教授、博导
张磊
山东大学公共卫生学院，教授、博士生导师
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