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谭宇翔
中国科学院深圳先进技术研究院 助理研究员
中科院生物信息助理研究员，主要从事微生物组学相关的算法、流程和数据库的开发及应用研究。曾参与菌株分析算法的开发、宏基因组和扩增子测序数据的分析流程搭建、扩增子引物覆盖度数据库的构建等开发工作。同时参与婴幼儿肠道微生物发育评估、抗生素干预后的菌群重构等应用课题。博士期间曾从事测序和芯片数据的疾病基因组学研究。有丰富的生信经验，良好的沟通技巧，擅长跨学科合作，与医生等跨领域研究者都有过合作经验。
介绍 成果
代表性文章 更多>>
注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者
2022
FAStrainPanDA: Linked reconstruction of strain composition and gene content profiles via pangenome-based decomposition of metagenomic data
iMeta, 10.1002/imt2.41
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2021
Establishment and resilience of transplanted gut microbiota in aged mice
iScience, 10.1016/j.isci.2021.103654
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FADPSN: standardizing the short names of amplicon-sequencing primers to avoid ambiguity
Wei Sheng Wu Xue Bao, 10.13343/j.cnki.wsxb.20200760
Drought stress and plant ecotype drive microbiome recruitment in switchgrass rhizosheath
JIPB, 10.1111/jipb.13154
2020
FA[Research progress and applications of strain analysis based on metagenomic data]
Sheng wu gong cheng xue bao, 10.13345/j.cjb.200380
Predominance of positive epistasis among drug resistance-associated mutations in HIV-1 protease
PLoS Genet, 10.1371/journal.pgen.1009009
2019
FAPreventive consumption of green tea modifies the gut microbiota and provides persistent protection from high-fat diet-induced obesity
J Funct Foods, 10.1016/j.jff.2019.103621
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2016
FAImproving drug safety: From adverse drug reaction knowledge discovery to clinical implementation
Methods, 10.1016/j.ymeth.2016.07.023
Diffuse large B-cell lymphoma patient-derived xenograft models capture the molecular and biological heterogeneity of the disease
Blood, 10.1182/blood-2015-09-672352
Targetable genetic features of primary testicular and primary central nervous system lymphomas
Blood, 10.1182/blood-2015-10-673236
发明专利
谭宇翔; 钟竞辉; 杨恒文; 尹芝南。一种用于评估婴幼儿肠道菌群发育年龄的预测方法。（受理） 2019年
谭宇翔；张宇；尹芝南。优化基因组测序结果的分类方法。（受理） 2018年
Tan, Y. Computational Approaches for Transcriptome Cancer Analysis by RNA-Seq. LAP LAMBERT Academic 2016年
头衔
中国科学院深圳先进技术研究院 助理研究员
简介
中科院生物信息助理研究员，主要从事微生物组学相关的算法、流程和数据库的开发及应用研究。曾参与菌株分析算法的开发、宏基因组和扩增子测序数据的分析流程搭建、扩增子引物覆盖度数据库的构建等开发工作。同时参与婴幼儿肠道微生物发育评估、抗生素干预后的菌群重构等应用课题。博士期间曾从事测序和芯片数据的疾病基因组学研究。有丰富的生信经验，良好的沟通技巧，擅长跨学科合作，与医生等跨领域研究者都有过合作经验。
教育经历
2010年8月~2016年1月：波士顿大学医学院，哲学博士
2008年8月~2010年7月：伊利诺州理工大学，理学硕士
2004年9月~2008年6月：中山大学，理学学士
工作经历
2019年6月~现今：中国科学院深圳先进技术研究院，助理研究员
2016年6月~2019年5月：暨南大学，博士后
主要研究领域与方向
生物信息学：深耕算法和数据库开发12年，自主研发算法4个，数据模拟体系2个，数据库4个；建立微生物组和转录组两大组学数据分析平台；5年服务器管理和3年生信团队管理经验。  
肠道微生物组学：多角度分析肠道微生物群落的组成和功能变化对人体健康的影响，并致力于挖掘新型益生菌及靶向致病微生物的药物。已建立可用于衡量菌群失调程度的婴幼儿肠道菌群发育评估模型并申请专利。建立人肠道微生物资源库包含细菌、古菌、病毒等1770株，并进行了细致的单基因组分析。
所获荣誉
深圳市海外高层次人才“孔雀计划”获得者
广东省“珠江人才计划”海外青年引进计划获得者
首届全国大学生基因应用创意大赛 优秀导师
2014中国创新创业大赛优秀团队（团队负责人）
其他专家 更多>>
李菁
中国药科大学生命科学与技术学院教授
刘永鑫
中国农科院深圳农业基因组研究所研究员
滕永生
重庆市人民医院消化内科科研PI
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