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热心肠研究院 榜单
《热心肠日报》2022-2023榜单 | 50篇肿瘤必读论文
热心肠小伙伴们 2023-05-19
本篇发布“50篇肿瘤必读论文”。

在过去的一年多时间里，全球肠道领域研究继续高歌猛进，取得了颇多令人瞩目的进展。

2023肠道大会来临之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2022年5月以来一年期间发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2022-2023年度榜单。

2022年度榜单参评的文章共有3388篇，发表在420个不同的期刊上，累计影响因子达到了82902.36，平均影响因子24.48。其中来自Cell、Nature、Science的文章133篇，来自NEJM、Lancet、JAMA的文章54篇。

本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。

 

本篇发布“50篇肿瘤必读论文”。

 

提示：下述文章点击中文标题可直达热心肠日报，点击英文标题可访问论文官网。

CA：2023年的结直肠癌统计数据

CA - A Cancer Journal for Clinicians[IF:286.13]
① 2023年，预计全球将确诊153,020例结直肠癌，52,550例结直肠癌死亡；② 21世纪前十年，结直肠癌发病率每年降低3%-4%，2011-2019年每年降低1%，但＜55岁的结直肠癌发病率及比例不断增加；③ 2011-2020年间，结直肠癌死亡率每年降低2%，但＜50岁的结直肠癌死亡率每年增加0.5%-3%；④ 因筛查普及，1995-2005年间的晚期结直肠癌诊断率降低，但2005年后，该趋势因＜65岁的结直肠癌的晚期率增加而逆转；⑤ 直肠癌比例从1995年的27%增加至2019年的31%。 Colorectal cancer statistics, 2023
2023-03-01, doi:10.3322/caac.21772

NEJM：KRAS G12C抑制剂阿达格拉西布可用于治疗晚期结直肠癌

New England Journal of Medicine[IF:176.079]
① 纳入KRAS G12C突变的晚期转移性结直肠癌患者，44例进行阿达格拉西布单药治疗（每日两次、600mg口服），32例在此基础上联用西妥昔单抗；② 单药、联合治疗组中位随访时间分别为20.1个月、17.5个月，客观缓解率分别为19%、46%；③ 单药、联合治疗组的中位缓解持续时间分别为4.3个月、7.6个月，中位无进展生存期分别为5.6个月、6.9个月；④ 单药、联合治疗组的3级或4级治疗相关不良事件发生率分别为34%、16%，未观察到5级不良事件。 Adagrasib with or without Cetuximab in Colorectal Cancer with Mutated KRAS G12C
2022-12-21, doi:10.1056/NEJMoa2212419

NEJM：三氟尿苷/替吡嘧啶+贝伐珠单抗治疗转移性结直肠癌

New England Journal of Medicine[IF:176.079]
① 246名接受过不超过2线化疗的转移性结直肠癌患者随机均分为两组，分别接受FTD-TPI+贝伐珠单抗治疗（联合治疗组）或FTD-TPI治疗（FTD-TPI组）；② 联合治疗组的中位总生存期为10.8个月，显著高于FTD-TPI组的7.5个月；③ 联合治疗组的中位无进展生存期为5.6个月，显著高于FTD-TPI组的2.4个月；④ 最常见不良事件为中性粒细胞减少、恶心、贫血，未发生治疗相关死亡；⑤ 联合治疗组的ECOG评分恶化的中位时长为9.3个月，显著高于FTD-TPI组的6.3个月。 Trifluridine–Tipiracil and Bevacizumab in Refractory Metastatic Colorectal Cancer
2023-05-04, doi:10.1056/NEJMoa2214963

NEJM：超8万人数据，结肠镜筛查大肠癌的益处究竟有多大？

New England Journal of Medicine[IF:176.079]
① 纳入84585名55-64岁的欧洲健康受试者，28220名接受结肠镜筛查邀请（其中42.0%接受了筛查），56365名为对照组（未接受结肠镜筛查）；② 中位随访10年期间，接受邀请组及对照组分别确诊259例及622例结直肠癌，10年结直肠癌风险分别为0.98%及1.20%，接受邀请组相比于对照显著降低18%；③ 接受邀请组及对照组的结直肠癌死亡风险分别为0.28%及0.31%，全因死亡率分别为11.03%及11.04%，两组之间无显著差异。 Effect of Colonoscopy Screening on Risks of Colorectal Cancer and Related Death
2022-10-09, doi:10.1056/NEJMoa2208375

NEJM：ctDNA可用于指示II期结肠癌是否需要辅助化疗

New England Journal of Medicine[IF:176.079]
① 纳入455名II期结肠癌患者以2:1随机分组，ctDNA指导治疗（术后4周或7周ctDNA阳性则提示奥沙利铂或氟嘧啶化疗）组302人，标准治疗组153人；② ctDNA组接受辅助化疗的患者比例低于标准组（15%：28%）；③ 2年无复发生存率的评估中，ctDNA指导的治疗不劣于标准治疗（93.5%：92.4%）；④ ctDNA阳性患者中接受辅助化疗者三年无复发生存率为86.4%，而未接受辅助化疗者三年无复发生存率为92.5%。 Circulating Tumor DNA Analysis Guiding Adjuvant Therapy in Stage II Colon Cancer
2022-06-04, doi:10.1056/NEJMoa2200075

NEJM：CR率100%！PD-1单抗治疗错配修复缺陷的局部进展期直肠癌

New England Journal of Medicine[IF:176.079]
① 招募12名错配修复缺陷的局部进展期直肠癌患者，接受每3周一次的dostarlimab治疗，持续6个月；② 所有患者均为临床完全应答，核磁共振成像、18F-FDG PET-CT成像、内镜下评估、直肠指检及活检样本结果均显示无肿瘤；③ 截止至报告期，所有患者均未接受后续的放化疗或手术，在至少6个月（6-25个月）的随访期间，也未发生任何的进展或复发；④ 未报道3级以上不良事件。 PD-1 Blockade in Mismatch Repair–Deficient, Locally Advanced Rectal Cancer
2022-06-05, doi:10.1056/NEJMoa2201445

NEJM：幽门螺杆菌、同源重组基因与胃癌

New England Journal of Medicine[IF:176.079]
① 纳入日本生物银行中10426例胃癌患者和38153例对照者进行基因组测序，发现APC、ATM、BRCA1、BRCA2、CDH1、MLH1、MSH2、MSH6和PALB2等9个基因的种系致病性突变与胃癌风险增加有关；② 另纳入1433例胃癌患者和5997例对照者，发现致病性突变与幽门螺杆菌（Hp）感染对胃癌风险存在加性相互作用；③ 同源重组相关基因ATM、BRCA1、BRCA2、PALB2与Hp感染的加性相互作用更显著，且Hp感染者中，上述基因致病性突变携带者的胃癌累积风险更高。 Helicobacter pylori, Homologous-Recombination Genes, and Gastric Cancer
2023-03-30, doi:10.1056/NEJMoa2211807

BMJ：利用遗传+非遗传风险评分预测结直肠癌

British Medical Journal[IF:93.333]
① 纳入434,587名参与者，基于GWAS数据计算多基因风险评分，并基于年龄、种族、家族史、饮酒、吸烟、医疗状况计算非遗传风险（QCancer-10）评分；② 结合多基因风险评分与QCancer-10评分，预测结直肠癌的表现优于单独的QCancer-10评分；③ 在结直肠癌高风险（前20%）的参与者中，结合多基因风险评分与QCancer-10评分，预测男性结直肠癌的敏感度及特异性分别为47.8%及80.3%，预测女性结直肠癌的敏感度及特异性分别为42.7%及80.1%。 Integrating genome-wide polygenic risk scores and non-genetic risk to predict colorectal cancer diagnosis using UK Biobank data: population based cohort study
2022-11-09, doi:10.1136/bmj-2022-071707

Nature子刊：揭开肠道菌群与CAR-T免疫治疗效果间的神秘关系

Nature Medicine[IF:87.241]
① 一项多中心前瞻队列纳入172名B细胞淋巴瘤患者，分析肠道菌群和潜在混杂因素与CAR-T疗效的关系；② 治疗前使用广谱抗生素（高风险抗生素）与疗效不佳相关，这可能与治疗前更严重的肿瘤负担和系统炎症有关；③ 在没使用高风险抗生素的患者中，基线肠道菌群特征（如长双歧杆菌和肽聚糖合成通路）与治疗结果相关；④ 对于这些患者，基于基线菌群的机器学习模型可预测应答和非应答者，拟杆菌、瘤胃球菌、真杆菌、Akk菌的特定菌种有主要贡献，Akk菌还与治疗前的外周T细胞水平相关。 A non-antibiotic-disrupted gut microbiome is associated with clinical responses to CD19-CAR-T cell cancer immunotherapy
2023-03-13, doi:10.1038/s41591-023-02234-6

国内团队Nature子刊：斯鲁利单抗联合化疗为晚期食管癌治疗带来新希望

Nature Medicine[IF:87.241]
① 纳入551例既往未经治疗、局部晚期或转移性且PD-L1阳性的食管鳞状细胞癌患者，2:1随机分组接受斯鲁利单抗或安慰剂联合顺铂、5-氟尿嘧啶化疗；② 与对照组相比，斯鲁利单抗联合化疗显著改善患者的无进展生存期（中位FPS 5.8个月 vs. 5.3个月）与总生存期（中位OS 15.3个月 vs. 11.8个月），也改善了客观缓解率和持续缓解时间；③ 斯鲁利单抗组和安慰剂组患者3级或以上治疗相关不良事件发生率无显著差异（53% vs. 48%）。 First-line serplulimab or placebo plus chemotherapy in PD-L1-positive esophageal squamous cell carcinoma: a randomized, double-blind phase 3 trial
2023-02-02, doi:10.1038/s41591-022-02179-2

北肿团队：Claudin18.2 CAR-T治疗胃肠道癌症安全有效

Nature Medicine[IF:87.241]
① 招募37名Claudin18.2阳性的胃肠道癌症患者，接受2.5×10^8、3.75×10^8或5.0×10^8剂量的Claudin18.2 CAR-T（CT041）细胞治疗；② 94.3%的患者发生1/2级细胞因子释放综合征（CRS），未发生3级以上的CRS或神经毒性，未发生治疗相关死亡或剂量限制毒性；③ 总应答率（ORR）为48.6%，疾病控制率为73.0%，6个月的持续缓解率为44.8%；④ 在胃癌患者中，ORR及DCR分别达到了57.1%及75.0%，6个月的总生存率为81.2%。 Claudin18.2-specific CAR T cells in gastrointestinal cancers: phase 1 trial interim results
2022-05-09, doi:10.1038/s41591-022-01800-8

Nature子刊：个性化肿瘤新抗原疫苗用于治疗晚期转移性大肠癌

Nature Medicine[IF:87.241]
① 招募14名患者，制备ChAd68及samRNA组成的个性化肿瘤新抗原疫苗（包含20个排名最高的突变），联用纳武单抗±伊匹单抗；② 个性化肿瘤新抗原疫苗的安全性及耐受性良好，未发生剂量限制毒性，推荐2期剂量（RP2D）为10^12 VP的ChAd68及30μg的samRNA；③ 发生率＞10%的治疗相关不良事件包括发热、疲劳、骨骼肌及注射部位疼痛、腹泻；④ 肿瘤疫苗可诱导长期的新抗原特异性CD8+ T细胞应答，部分微卫星稳定结直肠癌患者的ctDNA减少且总生存期延长。 Individualized, heterologous chimpanzee adenovirus and self-amplifying mRNA neoantigen vaccine for advanced metastatic solid tumors: phase 1 trial interim results
2022-08-15, doi:10.1038/s41591-022-01937-6

Nature子刊：肠道菌群、饮食与癌症免疫治疗结果的关联

Nature Medicine[IF:87.241]
① 纳入澳大利亚和荷兰接受新辅助+免疫治疗的103名黑色素瘤患者，分析基线的肠道菌群和饮食模式，并结合115名美国患者的数据做验证；② 与治疗应答和毒性相关的微生物标志物在不同地区间有差异；③ 但肠道菌群类型与治疗反应有关：以瘤胃球菌科主导（Ru）的菌群比以拟杆菌科（Ba）主导的菌群有更好的治疗结果；④ 纤维和ω-3脂肪酸摄入较少以及外周血C反应蛋白（CRP）水平较高，与较差的治疗反应相关；⑤ Ru菌群与纤维摄入较多和CRP较低相关。 Diet-driven microbial ecology underpins associations between cancer immunotherapy outcomes and the gut microbiome
2022-09-22, doi:10.1038/s41591-022-01965-2

Nature Reviews：胃癌治疗的现状与展望（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:73.082]
① 胃癌包括4种TCGA分子亚型：EB病毒型、微卫星不稳定型、染色体不稳定型、基因稳定型；② 目前用于胃癌及胃食管交界癌患者的治疗决策的生物标志物包括：HER2过表达及扩增、PD-L1表达的综合阳性评分、微卫星高度不稳定状态；③ 对于晚期胃癌及胃食管交界癌患者，除化疗之外的药物包括：抗HER2药物、抗血管生成药物、免疫检查点抑制剂；④ 针对EGFR、MET、PARP及mTOR等靶点的药物对胃癌的治疗效果不佳，正在探索FGFR2、Claudin18.2等新靶点。 Current developments in gastric cancer: from molecular profiling to treatment strategy
2022-11-07, doi:10.1038/s41575-022-00703-w

Nature Reviews：转移性大肠癌精准治疗的现状和未来（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:73.082]
① 转移性结直肠癌（mCRC）治疗开始前，强烈建议通过测序确定肿瘤基因组的状态；② MSI-h/dMMR和BRAFV600E患者，确定派姆单抗为一线治疗，康奈非尼+西妥昔单抗联合或不联合比美替尼为二线治疗；③ MSS/pMMR mCRC则基于KRAS、NRAS及原发肿瘤位置，将传统化疗方法与抗VEGF或EGFR治疗相结合；④ 针对ERBB2、KRASG12C等稀有分子特征mCRC的新药试验正积极开展；⑤ 基于循环肿瘤DNA的无创检测方法和基于人工智能的耐药性预测有望用于靶向疗法的筛选。 Therapeutic landscape and future direction of metastatic colorectal cancer
2023-01-20, doi:10.1038/s41575-022-00736-1

Nature Reviews：一文读懂大肠癌的三类筛查方法（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:73.082]
① 早期筛查可以显著降低结直肠癌（CRC）的发病率和死亡率；② 基于粪便的检测包括粪便免疫化学检测（FIT）和多靶点粪便DNA检测，FIT可检测粪便潜血，是全球最常用的CRC筛查手段；③ 肠镜、CT结肠成像等是CRC初筛后的进一步影像学检查手段，但肠镜的侵入性限制了其使用范围和患者依从性；④ 目前，多种基于血液中肿瘤来源DNA（ctDNA）的CRC筛查方法正在开发中；⑤ 核磁结肠成像、结肠胶囊内镜、CT胶囊内镜等非侵入性影像学方法也在进行临床试验。 Current and future colorectal cancer screening strategies
2022-05-03, doi:10.1038/s41575-022-00612-y

国内团队Nature Reviews：东亚地区的胃肠道癌症（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:73.082]
① 2020年东亚报告近250万例胃肠道癌症，男性发病率为117.1/10万，高于女性的56.2/10万；② 与西方相比，东亚的胃癌、肝癌、食管癌及胆囊癌发病率较高，结直肠癌及胰腺癌发病率较低；③ 东亚年轻人的结直肠癌、胰腺癌及胆囊癌的发病率逐渐升高，主要因吸烟、喝酒、饮食、久坐、肥胖及代谢疾病等风险因素在年轻人中显著增加；④ 东亚的幽门螺杆菌、肝吸虫、乙肝病毒、丙肝病毒感染率较高，更多地摄入热饮，胆囊肿较多，可能增加胃肠道癌症风险； Updated epidemiology of gastrointestinal cancers in East Asia
2023-01-11, doi:10.1038/s41575-022-00726-3

Nature：菌群代谢物3-IAA或可增强化疗疗效

Nature[IF:69.504]
① 响应化疗的胰腺癌（PDAC）患者血液中富集了肠道菌群的色氨酸代谢物3-IAA；② 移植响应者的菌群、高色氨酸饮食、口服3-IAA，均可增强化疗对人源化PDAC小鼠模型的疗效；③ 3-IAA通过中性粒细胞的髓过氧化物酶（MPO）（而非AhR信号）发挥这些作用；④ MPO氧化3-IAA，使其与化疗联用时引起活性氧（ROS）降解酶GPX3和GPX7下调，导致ROS积累和癌细胞自噬减少，从而损害癌细胞代谢适性、减少增殖；⑤ 在2个PDAC队列中，3-IAA水平与化疗疗效显著相关。 Microbiota-derived 3-IAA influences chemotherapy efficacy in pancreatic cancer
2023-02-22, doi:10.1038/s41586-023-05728-y

Nature：细胞-基质界面调节人结肠癌干细胞的休眠

Nature[IF:69.504]
① 开发活体遗传谱系追踪系统，发现化疗前LGR5+癌症干细胞（CSC）表现出休眠状态；② 休眠的LGR5+细胞表达p27，活体成像显示化疗期间，LGR5+p27+细胞持续存在，随后克隆扩增；③ COL17A1在休眠LGR5+p27+细胞中上调，COL17A1是一种增强半桥粒的细胞粘附分子；④ COL17A1敲除的类器官失去休眠LGR5+p27+亚群，对化疗敏感；⑤ 化疗通过激活FAK-YAP破坏COL17A1并打破LGR5+p27+细胞的休眠，去除YAP信号则抑制了化疗耐药细胞退出休眠状态并延迟肿瘤再生。 Cell-matrix interface regulates dormancy in human colon cancer stem cells
2022-07-07, doi:10.1038/s41586-022-05043-y

Nature：结直肠癌残留细胞导致转移复发的新机制

Nature[IF:69.504]
① 在人结直肠癌（CRC）中鉴定到一个高表达Emp1（上皮膜蛋白1）等不良预后相关基因的上皮样细胞群，称为高复发细胞（HRCs）；② HRCs不表达Lgr5及多数YAP靶基因，主要存在于原发CRC的侵袭前沿和出芽部位，起始向肝脏的微转移；③ 小鼠模型中，原发CRC切除后残留的HRCs可导致复发，切除前靶向清除原发瘤中Emp1高表达细胞可减少肝转移；④ HRCs形成的肝脏微转移缺乏成熟的肿瘤微环境，新辅助生物治疗促进免疫系统杀伤HRCs，减少术后转移复发。 Metastatic recurrence in colorectal cancer arises from residual EMP1+ cells
2022-11-09, doi:10.1038/s41586-022-05402-9

Nature：大肠癌演化过程中的表型可塑性和遗传控制

Nature[IF:69.504]
① 分析27个结直肠癌（CRC）的297个样本的空间分辨的配对单腺体基因组、表观基因组和转录组，发现多数基因表达具有高可塑性；② 亚克隆转录组变异中仅有低于1%的基因和低于5%的标志性途径与遗传性变化有关；③ 在1529个基因中鉴定到表达数量性状位点，仅2.4%的亚克隆与顺式基因表达变化显著相关；④ 大部分CRC缺少亚克隆遗传性的选择证据，其表型可塑性与遗传无关，与肿瘤微环境等因素相关；⑤ 亚克隆的空间混合或隔离均常见，导致异质性增加。 Phenotypic plasticity and genetic control in colorectal cancer evolution
2022-10-26, doi:10.1038/s41586-022-05311-x

Nature：大肠癌基因组与表观基因组的共同演化

Nature[IF:69.504]
① 从30个原发癌和8个伴随腺瘤中收集1370个样本，生成1207个染色质可及性谱，527个全基因组和297个全转录组；② 染色质修饰基因和复发性体细胞染色质可及性改变中，包括癌症驱动基因调控区域，DNA突变是正向选择，反之不突变；③ 转录因子结合可及性在全基因组改变， 包括CTCF、干扰素下调和、SOX和HOX转录因子家族可及性增加，表明发育基因参与肿瘤发生；④ 体细胞染色质可及性改变可遗传且可区分腺瘤与癌症；⑤ 表观基因组可影响DNA突变的积累。 The co-evolution of the genome and epigenome in colorectal cancer
2022-10-26, doi:10.1038/s41586-022-05202-1

Nature：硬币的两面——化疗药物诱导的癌细胞死亡可能反过来导致耐药

Nature[IF:69.504]
① 结直肠癌患者来源的肿瘤类器官中，化疗药5-氟尿嘧啶（5-FU）可诱导部分肿瘤细胞死亡，但也激活临近细胞的mTORC1，导致类器官对5-FU耐药；② 机制上，肿瘤细胞死亡后向周围环境释放ATP，作用于临近细胞的嘌呤受体P2X4进而激活mTOR；③ 5-FU诱导细胞死亡后释放活性氧，通过DNA损伤促进临近细胞凋亡，而临近细胞依靠激活的mTOR信号抵抗该过程，清除活性氧可避免mTOR的激活；④ 抑制P2X4受体或mTOR可增强5-FU对肿瘤类器官皮下移植瘤的杀伤作用。 Colon tumour cell death causes mTOR dependence by paracrine P2X4 stimulation
2022-11-16, doi:10.1038/s41586-022-05426-1

Nature：瘤内菌群的空间分布，如何影响肿瘤异质性

Nature[IF:69.504]
① 用空间转录组学方法分析口腔鳞癌和大肠癌的肿瘤菌群，发现菌群在瘤内呈异质性分布；② 与细菌含量低的区域相比，细菌富集的区域血管较少、髓系细胞增多、T细胞减少、呈现免疫抑制特征、p53表达下调、细胞增殖减少；③ 开发单细胞RNA测序方法INVADEseq，分析单个瘤内细胞-细菌互作，发现被细菌感染/黏附的细胞在炎症、转移、DNA修复和休眠方面发生改变；④ 被细菌（如具核梭杆菌）感染的癌细胞能以单细胞形式入侵周围环境，并招募髓系细胞。 Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer
2022-11-16, doi:10.1038/s41586-022-05435-0

Cell：膳食色氨酸+罗伊氏乳杆菌，帮助小鼠抗肿瘤

Cell[IF:66.85]
① 小鼠模型中，口服的罗伊氏乳杆菌（Lr）可移位并持续定植于肿瘤内，以依赖于产IFNγ的CD8+ T细胞（Tc1）的方式增强局部抗肿瘤免疫和免疫检查点抑制剂（ICI）疗效；② Lr释放的色氨酸代谢物吲哚-3-乙醛（I3A）是该作用的充要条件，I3A通过激活CD8+ T细胞的AhR信号，促进转录因子CREB磷酸化，从而增强IFNγ生成等Tc1效应功能；③ 小鼠吃高色氨酸饮食可增强Lr和ICI诱导的抗肿瘤免疫；④ I3A在促进黑色素瘤患者的ICI应答和生存方面有潜在作用。 Dietary tryptophan metabolite released by intratumoral Lactobacillus reuteri facilitates immune checkpoint inhibitor treatment
2023-04-06, doi:10.1016/j.cell.2023.03.011

Cell：构建全新癌症图谱，揭示大肠癌全貌

Cell[IF:66.85]
① 使用循环免疫荧光及多重成像技术，对肿瘤样本约1亿个细胞进行成像和分析，发现即使是单一肿瘤，也具备不同分区，其中有些侵袭性更强，有些则更弱；② 除肿瘤本身存在内部差异，免疫系统在单个肿瘤内部及不同肿瘤间的变化也很大；③ 负责抗击癌症的T细胞功能通常会被抑制，但其实与肿瘤无关，抑制根源可能与微环境中其他免疫细胞有关；④ 3D成像还发现一类特殊结构（黏蛋白池），黏蛋白池间存在各种通道连接，其中有些是突起状的癌细胞。 Multiplexed 3D atlas of state transitions and immune interaction in colorectal cancer
2023-01-19, doi:10.1016/j.cell.2022.12.028

Cell：胃肠道等癌症中的肿瘤真菌组

Cell[IF:66.85]
① 基于TCGA的测序数据，在去除污染和假阳信号后，鉴定出肿瘤相关真菌，不同癌症类型的真菌组成有差异，真菌细胞与肿瘤细胞的比例可达1:10000；② 多种念珠菌和酿酒酵母等在胃肠道（GI）肿瘤真菌组中富集，芽生菌属和马拉色菌属物种分别在肺和乳腺肿瘤中富集；③ 胃癌中念珠菌的富集伴随着促炎症免疫通路表达上调，结肠癌中念珠菌与癌症转移增加、细胞粘附减弱相关；④ GI肿瘤含有活的、有转录活性的多种念珠菌，肿瘤中念珠菌DNA的富集与生存率减低相关。 A pan-cancer mycobiome analysis reveals fungal involvement in gastrointestinal and lung tumors
2022-09-29, doi:10.1016/j.cell.2022.09.015

Cell：全方位分析癌症真菌组

Cell[IF:66.85]
① 分析4个队列、35种癌症的17401个患者组织和血液样本的真菌组；② 对于所有癌症类型，都在部分肿瘤组织中检测到低丰度的真菌信号，不同癌症有不同的真菌载量和癌症类型特异性的真菌组成，真菌大多位于癌细胞或巨噬细胞内；③ 瘤内的真菌多样性和丰度低于细菌，但二者间正相关，提示它们在肿瘤微环境中不是竞争关系；④ 基于瘤内的真菌-细菌-免疫细胞共现关系鉴定出3个真菌型，与不同的免疫反应有关；⑤ 特定的瘤内真菌与患者临床特征和预后（如免疫治疗应答、生存期）相关，血浆真菌组可用于癌症早期检测，与细菌组联用可提高诊断性能。 Pan-cancer analyses reveal cancer-type-specific fungal ecologies and bacteriome interactions
2022-09-29, doi:10.1016/j.cell.2022.09.005

Nature Reviews：一文读懂早发性结直肠癌（综述）

Nature Reviews Disease Primers[IF:65.038]
① 预计到2030年，YO-CRC占结肠癌的11%和直肠癌的23%，趋势适用于不同地区和性别；② YO-CRC的风险因素包括性别、种族、生活方式、饮食、肥胖、糖尿病、抗生素、肠道菌群等，约20%的YO-CRC由遗传因素导致；③ WNT/β-catenin、KRAS、TP53、BRAF、NRAS等信号通路参与YO-CRC的发生发展；④ 因缺乏筛查，YO-CRC患者常被诊断为晚期，应对Lynch综合征、家族性腺瘤息肉患者进行监测；⑤ 对YO-CRC患者的管理需考虑长期治疗相关并发症及生活质量。 Young-onset colorectal cancer
2023-04-27, doi:10.1038/s41572-023-00432-7

Science：γδ T细胞对大肠癌的“双刃剑”作用

Science[IF:63.714]
① 分析结直肠癌（CRC）患者和模型小鼠的样本表明，非肿瘤或癌变前结肠组织中的γδ T细胞主要呈现抗肿瘤的细胞毒性特征（如产IFNγ），而肿瘤中富集的γδ T细胞则以促肿瘤特征为主（如表达IL-17和PD-1）；② 这些相反的功能特征与γδ T细胞所用的T细胞受体有关：肠上皮常驻的抗肿瘤亚群主要是Vγ1+和Vγ7+，而肿瘤中浸润的促肿瘤亚群主要是Vγ4+和Vγ6+；③ 小鼠基因敲除和抗体靶向实验证实了这两类γδ T细胞分别对CRC有保护和加剧的作用，其中Vγ6+细胞的扩增依赖于菌群，且Vγ4+和Vγ6+细胞具有冗余的促CRC作用。 TCR-Vγδ usage distinguishes protumor from antitumor intestinal γδ T cell subsets
2022-07-14, doi:10.1126/science.abj8695

Science：用工程菌治疗癌症（综述）

Science[IF:63.714]
① 细菌可在肿瘤中定植，用合成生物学工具可构建靶向肿瘤的治疗性工程菌；② 工程菌可特异性定位于肿瘤，通过分泌、扩散或细菌裂解机制，将携带的治疗性分子释放到肿瘤细胞内/外；③ 工程菌还可通过自身成分（如LPS、鞭毛蛋白）和表达免疫相关分子（如肿瘤抗原、细胞因子）等，来重塑肿瘤微环境和免疫反应、招募适应性免疫细胞，以增强抗肿瘤免疫；④ 工程菌还可与其他生物技术（如溶瘤病毒、合成菌群、CAR-T）和非生物技术（如MRI/PET成像、聚焦超声、纳米药物）联用，改善诊断和治疗。 Engineering bacteria as interactive cancer therapies
2022-11-24, doi:10.1126/science.add9667

曹议匀等Science突破：锁定表达新型基因毒素的促肠癌细菌

Science[IF:63.714]
① 建立一套筛选方法，系统性评估IBD患者的122株肠菌的基因毒性；② 发现多个菌株可以产生不同于colibactin的基因毒性小分子代谢物，如革兰氏阳性的产气荚膜梭菌和多枝梭菌、革兰氏阴性的摩氏摩根氏菌（Mm）的菌株可诱导DNA损伤；③ Mm在IBD和CRC患者中都富集，鉴定出Mm生成的一类新型小分子基因毒素indolimines及其合成所需的脱羧酶基因aat，构建敲除aat的Mm突变株证实aat介导了Mm的基因毒性；④ 产indolimines的Mm可增加小鼠的肠道通透性，加剧结肠肿瘤生成。 Commensal microbiota from patients with inflammatory bowel disease produce genotoxic metabolites
2022-10-27, doi:10.1126/science.abm3233

Science：巧妙改造皮肤菌，激活免疫助抗癌

Science[IF:63.714]
① 设计制备表皮葡萄球菌工程菌，使之能分泌或在菌体表面表达黑色素瘤肿瘤抗原；② 将活的工程菌定植于小鼠局部皮肤，可在不引发感染的情况下诱导肿瘤抗原特异性的CD4+和CD8+ T细胞（包括效应记忆T细胞）；③ 黑色素瘤小鼠模型中，工程菌诱导的T细胞可迁移并浸润到远端皮肤和肺转移的肿瘤中，展现出强抗肿瘤活性；④ 工程菌的皮肤定植可与免疫检查点阻断治疗发挥协同作用，在侵袭性黑色素瘤形成后开始治疗也能有效诱导肿瘤消退。 Engineered skin bacteria induce antitumor T cell responses against melanoma
2023-04-13, doi:10.1126/science.abp9563

复旦大学Cell子刊：限制亮氨酸摄入或抑制结直肠癌的免疫逃逸

Immunity[IF:43.474]
① 结直肠癌（CRC）中存在一类高表达亮氨酸tRNA合成酶2（LARS2）的B细胞亚群（LARS B）；② LARS2定位在线粒体，促进亮氨酸依赖的呼吸链复合物表达，促进NAD+再生并提高SIRT1的去乙酰化活性，进而去乙酰化PAX5并提高其转录Tgfb1的活性；③ 高亮氨酸饮食诱导LARS B增多，TGF-β分泌增加并介导肿瘤免疫逃逸，Lars敲除或亮氨酸阻断导致LARS B缺失，减缓肿瘤进展；④ LARS B定位于三级淋巴结外围，与CRC患者的结直肠增生和生存期缩短相关。 Leucine-tRNA-synthase-2-expressing B cells contribute to colorectal cancer immunoevasion
2022-06-03, doi:10.1016/j.immuni.2022.04.017

武汉大学Cell子刊：肾脏NF-kB促进果蝇肠道肿瘤相关死亡

Immunity[IF:43.474]
① 携带恶性yki3SA肠道肿瘤的果蝇，其共生菌（来自环境）呈指数增长，菌群组成紊乱，IMD-NF-κB信号系统性激活，肿瘤诱导的死亡增加，而肿瘤诱导的宿主消耗没有影响；② yki3SA肿瘤通过抑制肠道抗菌酰胺酶PGRP-SC2，导致细菌增加，促进宿主死亡；③ 清除肠道菌群或特异性阻断肾脏样Malpighian小管的IMD-NF-κB均能有效改善yki3SA荷瘤果蝇的死亡率，且不影响宿主消耗；④ 肾脏IMD-NF-κB激活导致尿酸（UA）超载，从而降低荷瘤果蝇的存活率。 Renal NF-κB activation impairs uric acid homeostasis to promote tumor-associated mortality independent of wasting
2022-08-26, doi:10.1016/j.immuni.2022.07.022

北肿团队Cell子刊：肠道菌群如何影响直肠癌新辅助化疗效果？

Cancer Cell[IF:38.585]
① 分析局部晚期直肠癌（LARC）患者进行新辅助化疗（nCRT）前后的粪便样本，发现nCRT后菌群多样性减少；② 普通拟杆菌介导的核苷酸生物合成与LARC患者的nCRT耐药性相关，削弱LARC患者对nCRT的反应，无反应肿瘤的特征是与DNA修复和核苷转运相关的基因上调；③ 核苷类补充剂或普通拟杆菌灌胃可保护癌细胞免受5-氟尿嘧啶或辐射治疗的损伤；④ 对735名患者的2205份血清样本的分析表明，尿酸是LARC患者接受nCRT治疗的潜在预后指标。 Gut microbiota-mediated nucleotide synthesis attenuates the response to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer
2022-12-22, doi:10.1016/j.ccell.2022.11.013

产毒素的艰难梭菌，可在小鼠中促结肠肿瘤

Cancer Discovery[IF:38.272]
① 不同结直肠癌患者的黏膜浆液在易患肠癌的Apc小鼠中有不同的致瘤能力；② 菌群分析、分离培养结合实验数据表明，患者黏膜浆液中的艰难梭菌产毒菌株可诱发小鼠的结肠肿瘤，其促瘤作用依赖于菌株的持续定植及产生的毒素TcdB；③ 单细胞测序和流式分析表明，艰难梭菌诱导的肿瘤发生与肠上皮祖细胞Wnt信号活化、肠细胞活性氧生成以及促瘤性黏膜免疫反应（如活化髓系细胞的浸润、产IL-17淋巴细胞亚群增多）有关。 Human colon cancer-derived Clostridioides difficile strains drive colonic tumorigenesis in mice
2022-06-09, doi:10.1158/2159-8290.CD-21-1273

秦环龙团队：大肠癌的跨人群肠道菌群特征，及与血清代谢物的关系

Gastroenterology[IF:33.883]
① 纳入上海结直肠癌（CRC）队列225人（包括CRC和腺瘤患者及健康对照），鉴定出CRC的肠道菌群和血清代谢组变化；② 将所得的肠道菌群特征在7个不同地域的CRC队列中验证，得到一组跨队列的CRC相关微生物；③ 对菌群和代谢组进行整合分析，鉴定出CRC相关肠道菌群特征与多种CRC相关血清代谢物（如2-亚油酰甘油(18:2)和全氟辛烷磺酸）的关联；④ 开发了基于菌群和血清代谢物的诊断模型，能够准确鉴定CRC和腺瘤患者（AUC分别为0.994和0.912）。 Integrated analysis of colorectal cancer reveals cross-cohort gut microbial signatures and associated serum metabolites
2022-07-01, doi:10.1053/j.gastro.2022.06.069

西式饮食促大肠癌，又添新证！

Gastroenterology[IF:33.883]
① 对美国13万余名参与者随访30年，并对随访期间发生的3200例结直肠癌患者中的1175例肿瘤进行了pks+大肠杆菌DNA检测；② 对于pks+大肠杆菌高含量的肿瘤，西式饮食评分最高相比最低三分位组的多变量校正风险比（95%可信区间）为3.45 (1.53-7.78)，而对于pks+大肠杆菌低含量的肿瘤为1.22 （0.57-2.63），pks+大肠杆菌阴性的肿瘤为1.10（0.85-1.42）；③ 因此，西式饮食评分与结直肠癌发病风险的相关性在pks+大肠杆菌含量较高的肿瘤中更强。 Western-style Diet, pks Island-Carrying Escherichia coli, and Colorectal Cancer: Analyses from Two Large Prospective Cohort Studies
2022-06-24, doi:10.1053/j.gastro.2022.06.054

于君团队：大肠癌中的肠道真菌群特征和促癌真菌

Gastroenterology[IF:33.883]
① 纳入7项（共1329个粪便宏基因组）数据集进行荟萃分析，总结肠道真菌菌群与结直肠癌（CRC）的关系；② 与健康人和腺瘤患者相比，CRC患者肠道内Aspergillus rambellii等6种真菌丰度增加，Aspergillus kawachii丰度减少；③ 体内和体外实验表明，A. rambellii可促进CRC细胞和异种移植小鼠肿瘤的生长；④ CRC患者肠道内真菌-真菌、真菌-细菌相互作用明显增强，且与CRC病程呈正相关；⑤ 联合使用真菌与细菌的生物标志物可在临床上更准确地诊断CRC。 Altered mycobiota signatures and enriched pathogenic Aspergillus rambellii are associated with colorectal cancer based on multi-cohort fecal metagenomic analyses
2022-06-17, doi:10.1053/j.gastro.2022.06.038

张明明Gut：Akk菌或可用于改善大肠癌

Gut[IF:31.793]
① 将Akk菌和纯化Amuc_2172的分泌细胞外囊泡用于不同肿瘤发生模型，评估Amuc_2172诱导的CD8+细胞毒T淋巴细胞（CTLs）免疫活性；② Amuc_2172是Akk菌的乙酰转移酶，可通过巨胞作用进入结直肠细胞，作为组蛋白H14上Lys14的乙酰转移酶起作用；③ Hspa1a位点H14K1ac升高促进癌细胞中热休克蛋白70（HSP70）转录和分泌，高水平HSP70可促进CTLs的免疫活性；④ 生物工程纳米颗粒为同种异体移植小鼠模型中的CRC治疗提供了可靠的Amuc_2172药物递送策略。 Acetyltransferase from Akkermansia muciniphila blunts colorectal tumourigenesis by reprogramming tumour microenvironment
2023-02-08, doi:10.1136/gutjnl-2022-327853

黄秀娟+吴开春等GUT：用无创生物标志物诊断大肠癌（指南）

Gut[IF:31.793]
① 对结直肠癌（CRC）进行筛查能有效降低CRC相关死亡率；② 本实践指南旨在为临床医生使用无创生物标志物进行癌症筛查提供循证指导；③ 该指南涉及使用粪便免疫化学试验、基于血液的肿瘤生物标志物、基于粪便的肿瘤生物标志物或微生物标志物来检测CRC和腺瘤；④ 针对每一种筛查方法的适应症、目标筛查人群和优缺点，本文件均提供了最新且全面的指导；⑤ 此外，还讨论了无创生物标志物筛查CRC的最新研究及未来发展方向。 Joint Asian Pacific Association of Gastroenterology (APAGE)–Asian Pacific Society of Digestive Endoscopy (APSDE) clinical practice guidelines on the use of non-invasive biomarkers for diagnosis of colorectal neoplasia
2023-04-05, doi:10.1136/gutjnl-2023-329429

房静远+洪洁+陈豪燕Cell子刊：菌群失调相关的尿素积累或促大肠癌

Cell Metabolism[IF:31.373]
① 分析患者结直肠的正常、腺瘤和癌组织，发现肿瘤进展过程中，宿主的尿素循环代谢被激活；② 这与肠道菌群失调相关，特征为双歧杆菌等有尿素分解能力的有益菌减少、缺乏尿素分解能力的致病菌增多；③ 机制上，尿素可进入巨噬细胞，抑制p-STAT1与SAT1启动子区域结合，导致SAT1表达减少，从而抑制多胺分解代谢，引起多胺积累，诱导了巨噬细胞的促肿瘤表型；④ 用尿素循环抑制剂，或基于双歧杆菌的益生菌干预，可缓解尿素介导的小鼠肿瘤发生。 Urea cycle activation triggered by host-microbiota maladaptation driving colorectal tumorigenesis
2023-03-23, doi:10.1016/j.cmet.2023.03.003

国内团队Cell子刊：产丁酸的直肠真杆菌或能抑制肠道淋巴瘤发生

Cell Host and Microbe[IF:31.316]
① 肠道淋巴瘤（PIL）患者的肠道菌群组成改变，共生菌减少，尤其是真杆菌属和产丁酸的直肠真杆菌（Er），伴随粪便丁酸和戊酸水平降低；② 给小鼠移植缺乏Er的PIL患者菌群可引起肠道炎症，增加促炎细胞因子TNF生成；③ 给易患B细胞淋巴瘤的Eμ-Myc小鼠补充Er，能提高粪便丁酸水平，减少TNF生成，降低淋巴瘤发生率；④ TNF可上调TLR4表达，使B细胞对菌群产生的脂多糖（LPS）敏感，增强LPS诱导的TLR4/MyD88信号，进而通过活化NF-κB促进PIL发生。 Butyrate-producing Eubacterium rectale suppresses lymphomagenesis by alleviating the TNF-induced TLR4/MyD88/NF-κB axis
2022-08-10, doi:10.1016/j.chom.2022.07.003

房静远+陈萦晅Cell子刊：具核梭杆菌产生琥珀酸，让大肠癌抵抗免疫治疗

Cell Host and Microbe[IF:31.316]
① 对免疫疗法不应答的转移性结直肠癌患者中，具核梭杆菌（Fn）丰度较高，血清琥珀酸水平增加；② 小鼠中，Fn通过其代谢物琥珀酸让肿瘤对抗PD-1单克隆抗体（mAb）变得不敏感；③ 机制上，Fn产生的琥珀酸抑制了cGAS-IFNβ通路，使肿瘤中的趋化因子CCL5和CXCL10水平降低，从而限制CD8+T细胞向肿瘤微环境迁移，抑制抗肿瘤反应；④ 用抗生素甲硝唑治疗可减少肠道的Fn含量，进而降低血清琥珀酸水平，使小鼠肿瘤对免疫疗法重新敏感。 Fusobacterium nucleatum-derived succinic acid induces tumor resistance to immunotherapy in colorectal cancer
2023-04-30, doi:10.1016/j.chom.2023.04.010

王硕等Cell子刊：肠道组织内的2种共生菌可促进肿瘤免疫监视，抑制大肠癌

Cell Host and Microbe[IF:31.316]
① 分析大肠癌患者的正常结肠组织、癌旁组织和肿瘤组织内的共生菌群，发现非肿瘤组织富含活泼瘤胃球菌（Rg）和Blautia producta（Bp）等毛螺菌科细菌，肿瘤组织富含具核梭杆菌和厌氧消化链球菌等；② 小鼠中，Rg和Bp能促进肿瘤中的CD8+ T细胞活化，抑制结肠肿瘤生长；③ 机制上，肿瘤微环境中的代谢物溶血甘油磷脂可抑制CD8+ T细胞的增殖和功能，从而促肿瘤生长，而在肿瘤中定植Rg和Bp能快速降解溶血甘油磷脂，恢复CD8+ T细胞的肿瘤免疫监视功能。 Tissue-resident Lachnospiraceae family bacteria protect against colorectal carcinogenesis by promoting tumor immune surveillance
2023-03-08, doi:10.1016/j.chom.2023.01.013

房静远等Nature子刊：他汀类药物可预防大肠癌？肠菌色氨酸代谢物或是关键

Nature Microbiology[IF:30.964]
① 回顾性队列分析表明，服用他汀类药物与结直肠腺瘤复发风险降低相关；② 小鼠模型中，阿托伐他汀通过调节肠道菌群抑制肠道肿瘤；③ 阿托伐他汀可抑制肠道Ido1，从而提高肠腔色氨酸水平供菌群利用，促进了罗伊氏乳杆菌生长；④ 罗伊氏乳杆菌通过产生色氨酸分解代谢物吲哚-3-乳酸（ILA）抑制结直肠肿瘤发生；⑤ ILA通过靶向RORγt减少Th17细胞分化，抑制Th17反应、下调IL-17信号，并通过激活肠上皮AHR改善屏障完整性，从而发挥抗肿瘤作用。 Microbiota-derived tryptophan catabolites mediate the chemopreventive effects of statins on colorectal cancer
2023-04-17, doi:10.1038/s41564-023-01363-5

Nature子刊：肠道细菌和宿主共享抗癌药物的代谢途径

Nature Microbiology[IF:30.964]
① 抗癌药物氟嘧啶可抑制肠道细菌（来自6个门）的生长；② 大肠杆菌和哺乳动物细胞中，氟嘧啶破坏嘧啶代谢，而变形菌和厚壁菌将5-氟尿嘧啶代谢为非活性代谢物二氢氟尿嘧啶，模拟了宿主清除药物的主要机制；③ 细菌的preTA操纵子对还原反应具有较高的催化效率，对于大肠杆菌失活5-氟尿嘧啶是必要且充分的，可降低小鼠口服氟嘧啶治疗的生物利用度和疗效，并且在结直肠癌患者的肠道菌群中普遍存在。 Host and gut bacteria share metabolic pathways for anti-cancer drug metabolism
2022-09-22, doi:10.1038/s41564-022-01226-5

Science子刊：揭示肠道菌群促进肠外抗肿瘤免疫的关键机制

Science Immunology[IF:30.63]
① 免疫检查点阻断治疗（ICT）诱导特定的内源性肠道细菌易位至次级淋巴器官（肠系膜淋巴结（MLN）和肿瘤引流淋巴结（TDLN））和皮下黑色素瘤；② 大量的细菌易位激活DC，并诱导抗肿瘤效应T细胞反应，而DC也有助于肠道细菌易位至次级淋巴器官；③ MLN调节TDLN和肿瘤内肠道细菌依赖性的抗肿瘤反应；④ ICT诱导MLN中HEV小静脉的淋巴管生成和扩张；⑤ 抗生素治疗导致肠道细菌向MLN和TDLN的转移减少，减弱DC和效应CD8+T细胞反应，减弱机体对ICT的响应。 Immune checkpoint blockade induces gut microbiota translocation that augments extraintestinal antitumor immunity
2023-03-03, doi:10.1126/sciimmunol.abo2003

Science子刊：肠道菌群相关代谢物TMAO可驱动胰腺癌的免疫激活

Science Immunology[IF:30.63]
① 肠道菌群衍生代谢物TMAO可增强对PDAC的抗肿瘤免疫；② 腹腔内或补充膳食胆碱以向PDAC模型小鼠递送TMAO，或静脉输注经TMAO刺激的巨噬细胞，能减少肿瘤生长；③ TMAO增强I型干扰素途径，诱导免疫刺激性肿瘤相关巨噬细胞表型、激活肿瘤微环境的效应T细胞；④ TMAO联合免疫检查点阻断疗法能显著降低PDAC小鼠的肿瘤负荷，改善生存率；⑤ 含CutC（产生TMAO前体的酶）的细菌水平与PDAC患者的长期生存和黑色素瘤患者对anti-PD1反应改善相关。 The microbiome-derived metabolite TMAO drives immune activation and boosts responses to immune checkpoint blockade in pancreatic cancer
2022-09-09, doi:10.1126/sciimmunol.abn0704
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