如何从众多R包中选择合适、高效、便捷、易学的工具,是微生物组研究者面临的难题。中国农科院刘永鑫、南京工业大学袁军与团队在Protein & Cell 2023肠道大会微生物组专刊中发表综述文章The best practice for microbiome analysis using R,系统地梳理了R包在微生物组研究中的应用,为今后开发更好的微生物组工具提供了重要的理论基础和实践参考。本文干货很多,推荐专业人士学习参考。