赵方庆等GUT:对新生儿肠菌的影响,宫内环境>遗传因素
热心肠小伙伴们 2022-04-07
华中科大宁康团队近期在iMeta发表综述文章。在本研究中,作者专注于定量的分析宏基因组数据中蕴含的菌群生态和进化模式,解码这些模式与蛋白质结构的复杂关系,并研究如何有效地利用这些模式来提高蛋白质结构预测的效率和准确性。作者从生态和进化模式角度出发,解码了宏基因组数据与蛋白质结构的复杂关系,并在宏基因组数据中发现了可用于高效补充蛋白质同源序列的靶向方法。本研究在有效利用宏基因组数据搜索同源序列并预测蛋白质结构方面具有指导意义。

胎儿生长受限(FGR)是造成围产儿死亡的一个重要原因,并可能对长期发育和健康造成影响。选择性FGR是指单绒毛膜双胞胎(共用一个胎盘的同卵双胞胎)体重不一致的现象(一个体重正常、一个体重轻),主要是由不良宫内环境因素导致的。因此,选择性FGR可用于研究与胎盘有关的生长障碍以及遗传和环境因素如何塑造新生儿肠道菌群等问题。中国科学院北京生命科学研究院赵方庆和王金锋与团队,与北京大学第三医院赵扬玉和魏瑗团队合作,在Gut发表最新研究Unfavourable intrauterine environment contributes to abnormal gut microbiome and metabolome in twins,分析了150对双胞胎新生儿的粪便菌群和代谢组,发现宫内环境是塑造新生儿肠道菌群的一个关键驱动因素,其影响大于遗传。此外,选择性FGR中的新生儿肠道菌群失调和代谢物的变化,可能对之后的发育情况造成长期影响,提示肠道菌群和相关代谢物或能用于监测甚至改善FGR不良预后。

专家简介
赵方庆
中国科学院动物研究所研究员
中国生物信息学会基因组信息学专委会主任
赵方庆,研究员,博士生导师。先后获得基金委优青(2017)、北京杰青(2018)、国家杰青(2020)和中国科学院特聘研究员(2022)。现任副主任、技术平台主任、中国生物信息学会基因组信息学分会主任。在Briefings in Bioinformatics、Science Bulletin、Science China Life Sciences、Genomics,Proteomics & Bioinformatics等国际学术刊物担任副主编或编委。主要致力于建立高效的算法模型和实验技术,探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律,以期解析它们与人类健康和疾病的关系。在Cell、Gut、Nature Biotechnology、Nature Methods、Nature Computational Science和Nature Communications等刊物上发表通讯作者论文100余篇;论文总引用次数超过1.5万次,其中十余篇入选ESI高被引论文;连续6年荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017~2023),3次获得“中国科学院大学领雁奖章”、“中国科学院优秀共产党员”、“中国科学院李佩优秀教师奖”、“中国科学院朱李月华优秀教师奖”、“中国科学院大学必和必拓导师奖”;培养的研究生已有7人次获得“中国科学院院长奖”(含3次特别奖)和“中国科学院优博论文”。现承担国家重点研发计划首席科学家、基金委杰青和重点项目。
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王金锋
中国农业大学教授、博导
从事生命组学与食品营养学科交叉方向的研究,聚焦菌群及代谢与宿主健康之间的密切联系。第一(或并列第一)作者和通讯作者代表作发表在Cell、Gut、Nature Communications等杂志,论文累计引用超3000次,主持6项国家自然科学基金项目和重点研发课题。
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