胡圣伟+倪伟+陈同等:动物微生物组组成与功能综合数据库—CRAMdb
热心肠小伙伴们 2022-11-10
近日,中国中医科学院陈同、石河子大学胡圣伟、倪伟及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究,建立一个包含与动物相关的细菌、古细菌、真菌和病毒数据的CRAMdb综合数据库(http://www.ehbio.com/CRAMdb/;含9430种细菌、278种古细菌、2216种真菌和458种病毒等超1.2万种微生物),用于探索各种动物中微生物的组成和功能,以及与表型的关联等。总之,极大地促进了国内外动物微生物相关数据的汇总、储存以及共享,也为未来的实际转化应用奠定了基础。

近年来,随着高通量测序技术与生物信息学技术的快速发展,已经成为研究人员解决动物健康与疾病的诊断、治疗、预防等一系列科学难题的两把利刃。随着科学数据的爆炸式增长,急需建立以动物宏微生物组为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据。近日,中国中医科学院陈同、石河子大学胡圣伟、倪伟及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究,建立一个包含与动物相关的细菌、古细菌、真菌和病毒数据的CRAMdb综合数据库(http://www.ehbio.com/CRAMdb/;含9430种细菌、278种古细菌、2216种真菌和458种病毒等超1.2万种微生物),用于探索各种动物中微生物的组成和功能,以及与表型的关联等。总之,极大地促进了国内外动物微生物相关数据的汇总、储存以及共享,也为未来的实际转化应用奠定了基础。

专家简介
陈同
中国中医科学院 副教授
生信宝典公众号 主编
陈同,博士,中国中医科学院副教授。研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、Evenn、IMP,使用超 60 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平杂志。
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