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陈同
中国中医科学院 副教授、生信宝典公众号 主编
陈同，博士，中国中医科学院副教授。研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等，在Cell Stem Cell (封面文章)，Nucleic Acids Research，Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇；开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、Evenn、IMP，使用超 60 万人次；运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》，分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频，阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊，现为执行主编，致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平杂志。
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最新动态 更多>>
刘永鑫/陈同：FoodMicroDB——用于食物微生物组成和时间序列研究的微生物组数据库
中国农业科学院深圳农业基因组研究所刘永鑫团队和中国中医科学院国家中药资源中心陈同与团队发表研究，构建了一个具备丰富数据分析和可视化功能的食物微生物组数据库，收集了来自62种食物的108个扩增子测序项目数据，促进了食物微生物组数据的可访问性和可重用性，为该领域提供了一个有价值的资源平台。
11-16
陈同/黄璐琦/刘永鑫等：ImageGP 2.0——用于生物医学研究的强大数据可视化与可重复性分析工具
中国中医科学院黄璐琦、陈同和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队发表文章，发布了在线数据可视化和生信分析平台ImageGP的升级版ImageGP 2.0（https://www.bic.ac.cn/BIC/#/），引入了最新网络开发技术，重新设计了用户使用界面，大大丰富和增强了原有功能，并显著改善了用户使用体验。
10-19
黄璐琦/刘永鑫/陈同等：最全可视化韦恩图和集合图工具EVenn使用手册
中国中医科学院黄璐琦、陈同和中国农科院深圳基因组所刘永鑫与团队发表文章，概述了EVenn的各种应用。
04-25
胡圣伟+倪伟+陈同等：动物微生物组组成与功能综合数据库—CRAMdb
近日，中国中医科学院陈同、石河子大学胡圣伟、倪伟及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究，建立一个包含与动物相关的细菌、古细菌、真菌和病毒数据的CRAMdb综合数据库（http://www.ehbio.com/CRAMdb/；含9430种细菌、278种古细菌、2216种真菌和458种病毒等超1.2万种微生物），用于探索各种动物中微生物的组成和功能，以及与表型的关联等。总之，极大地促进了国内外动物微生物相关数据的汇总、储存以及共享，也为未来的实际转化应用奠定了基础。
2022-11-10
《热心肠日报》解读 更多>>
胡圣伟+倪伟+陈同等：动物微生物组组成与功能综合数据库—CRAMdb
① 建立了动物宏基因组领域首个跨宿主、跨样本位点和跨表型比较的综合数据库CRAMdb；② 该数据库整理、收集和统一标准分析了世界范围内动物微生物组相关数据，实现了不同物种、不同样本位点和不同表型背景下宿主与微生物关联性的交互查询和联合比较分析；③ 分析来自475个项目的516种动物的微生物组，涉及43个表型，构建了含9430种细菌、278种古菌、2216种真菌和458个病毒的数据库；④ 数据库包括两个主要模块内容，即微生物组成和微生物关联。
2022-11-01
iMeta：陈同等开发高颜值高被引绘图网站imageGP
① ImageGP 可以在线生成常见的线图、柱状图、散点图、箱线图、集合图、热图和直方图等；② 用户只要粘贴数据矩阵，即可一键快速出图；③ ImageGP 还支持火山图、富集分析泡泡图、主成分分析类图等和 4 种微生物领域的功能预测和生物标志物鉴定分析，包括 FAPROTAX, BugBase, PICRUSt 和 LEFSe；④ 在满足方便易用的同时， ImageGP 也提供了灵活性，可以设置多种参数、调整样式，输出发表质量的图，提供脚本实现可重复分析和用户进一步修改。
2022-02-21
代表性文章 更多>>
注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者
2024
FAThe role of the autonomic nervous system in polycystic ovary syndrome
FRONT ENDOCRINOL, 10.3389/fendo.2023.1295061
2023
FAIMP: bridging the gap for medicinal plant genomics
NAR, 10.1093/nar/gkad898
点击查看热心肠日报解读
CACRISPR-detector: fast and accurate detection, visualization, and annotation of genome-wide mutations induced by genome editing events
JGG, 10.1016/j.jgg.2023.03.010
CAEasyAmplicon: An easy-to-use, open-source, reproducible, and community-based pipeline for amplicon data analysis in microbiome research
iMeta, 10.1002/imt2.83
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2022
CACRAMdb: a comprehensive database for composition and roles of microbiome in animals
NAR, 10.1093/nar/gkac973
点击查看热心肠日报解读
CAIntegrating Multiple Omics Identifies Phaeoacremonium rubrigenum Acting as Aquilaria sinensis Marker Fungus to Promote Agarwood Sesquiterpene Accumulation by Inducing Plant Host Phosphorylation
Microbiol Spectr, 10.1128/spectrum.02722-21
CAImageGP: An easy-to-use data visualization web server for scientific researchers
iMeta, 10.1002/imt2.5
点击查看热心肠日报解读
2021
FAEVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online
JGG, 10.1016/j.jgg.2021.07.007
点击查看热心肠日报解读
FAComparative anatomical and transcriptomic analyses of the color variation of leaves in Aquilaria sinensis
PeerJ, 10.7717/peerj.11586
FAExpansion within the CYP71D subfamily drives the heterocyclization of tanshinones synthesis in Salvia miltiorrhiza
Nat Commun, 10.1038/s41467-021-20959-1
头衔
中国中医科学院 副教授
生信宝典公众号 主编
iMeta 杂志 执行主编
简介
陈同，博士，中国中医科学院副教授。研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等，在Cell Stem Cell (封面文章)，Nucleic Acids Research，Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇；开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、Evenn、IMP，使用超 60 万人次；运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》，分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频，阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊，现为执行主编，致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平杂志。
教育经历
2009年9月~2015年7月：中国科学院遗传与发育生物学研究所，博士
2005年9月~2009年7月：东北林业大学，学士
工作经历
2021年~至今：中国中医科学院，副研究员
2015年8月~2021年12月：中国中医科学院，助理研究员
主要研究领域与方向
生信分析软件开发和生物数据平台建设
机器学习解析中药有效成分合成通路的基因
其他专家 更多>>
师俊玲
西北工业大学生命学院教授
司同
中科院深圳先进院合成生物学研究所研究员
赵文婧
中山大学医学院教授
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