王明帮
深圳大学附属华南医院 副研究员、微生态治疗研究所 所长
儿科学博士、临床医学博士后,毕业于复旦大学上海医学院;深圳大学硕导(专业学位-儿科学),附属华南医院副研究员,微生态治疗研究所所长。关注围产及新生儿期风险因素和“微生物-肠-脑”轴与神经发育疾病发生,研究方向包括:1)遗传及环境互作与儿童神经发育疾病发生(Am J Hum Genet 2013;Brain Behav Immun 2019,2020;Respir Res 2020);2)“微生物-肠-脑”轴及微生态治疗方法开发(mSystems 2019;J Dent Res 2022;Nat Neurosci 2023);3)机器学习、因果推断等人工智能方法研究(Comput Struct Biotechnol J 2020,2021,2022)。主持国家自然科学基金青年和面上各一项。累积发表50余篇SCI学术论文(被引超5500次, H-index为20)。是中国生物物理学会肠道菌群分会理事,“热心肠智库”专家,担任儿科学(Children (Basel)),神经科学(Neurosci Bull、Brain-X),遗传学(J Genet Genomics),微生物组学(iMeta)等领域知名期刊的编委(含青编)或执行副主编。
国内团队:帕金森病患者的菌群相关表位变化
① 纳入69名PD患者及244名对照,分析肠道菌群及菌群相关表位(ME);② 27种细菌标志物及28种表位肽在PD患者及对照中有显著差异;③ 与L-组氨酸降解通路正相关的4种ME及与L-脯氨酸生物合成通路正相关的13种ME,与炎症标志物及放线菌门的5种细菌相关;④ 与异丙醇生物合成通路负相关的1种ME及与丙酮酸发酵产生propanoate通路正相关的2种ME,与炎症标志物及厚壁菌门的2种细菌相关;⑤ 2种来自GROEL2及RPSC的ME由结核分支杆菌产生,可驱动T细胞应答。
2021-07-02
程国强+王明帮:代谢组学+机器学习,预测新生儿败血症合并脑膜脑炎
① 招募70例新生儿败血症患者,其中42例被诊断为脑膜脑炎,采集脑脊液(CSF)和血清标本;② 通过代谢组学检测分析后发现,败血症合并脑膜脑炎患者血清和脑脊液中L-精氨酸、肌酐和其他精氨酸代谢物的浓度显著降低,提示一氧化氮合成发生改变;③ 血清中抗氧化剂牛磺酸和脯氨酸显著升高,提示氧化应激异常;④ 同时血清中潜在有害胆盐和芳香族化合物明显升高;⑤ 结合LASSO和XGBoost算法成功地根据血清代谢物标记物浓度预测脑脊液中L-精氨酸的浓度。
2021-05-18
王明帮等:肠道IgA+菌群毒力因子基因,助力自闭症早期诊断
① 纳入43名ASD患儿及31名正常儿童,对VFGM基因进行对比分析;② ASD患儿的VFGM基因多样性显著升高,且与肠道IgA含量呈显著正相关;③ VFGM基因组成与ASD相关,17个VFGM基因在ASD患儿中富集,而7个VFGM基因在ASD患儿中减少;④ 在上述24个差异化表达的VFGM基因中,B型链球菌(GBS)基因比例最高;⑤ 结合肠道IgA水平、VFGM基因多样性及GBS基因丰度开发的机器学习算法,可准确区分ASD患儿及正常儿童。
2020-12-29
国内团队:重度抑郁症患者的肠道菌群及代谢通路变化
① 收集26名重度抑郁症(MDD)及29名健康人的粪便进行宏基因组测序,建立随机森林模型;② MDD患者的拟杆菌门丰度显著减少,放线菌门及双歧杆菌属的丰度显著升高;③ 色氨酸生物合成和代谢途径相关的四种肠道菌群代谢通路丰度在MDD患者中显著降低,其中K01626和K01817的丰度与抑郁和焦虑得分有关;④ 基于菌属和菌种水平的随机森林模型可以很好的区分MDD患者和健康人(AUC=0.890)。
2019-11-05
强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化
① 纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行鸟枪法宏基因组测序;② 鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有显著差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的显著差异;③ 抗TNF治疗与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④ AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF治疗与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。
2019-10-29
王明帮+周文浩+许瑞环:精神分裂症患者的肠道菌群及免疫变化
① 纳入84名精神分裂症患者及84名年龄性别匹配的健康对照;② 精神分裂症患者的肠道菌群丰富度显著降低,肠道菌群组成也发生了显著变化,通过宏基因组相关分析鉴定出19个与精神分裂症相关的分类群;③ 根据差异分类群的丰度计算出菌群失调(MD)指数,发现MD指数与肠道菌群相关表位的多样性及肠道IgA水平呈正相关,并与肠道菌群丰富度呈负相关;④ 精神分裂症患者的肠道谷氨酸盐合成酶活性更高,并与肠道IgA相关分类群的变化相关。
2019-06-27
王明帮:自闭症谱系障碍儿童肠道菌群结构及代谢产物研究
① 自闭症谱系障碍(ASD)儿童肠道菌群丰度降低,结构改变,且放线菌纲丰度显著增高;② 代谢组分析提示肠道α-酮戊二酸降低可能是ASD潜在标志物;③ 研究发现34种与ASD相关的肠道菌群表位肽,且其与肠道IgA含量相关;④ ASD儿童肠道菌群毒力因子(VFGM)多态性显著上升,并与IgA含量呈正相关,毒力因子基因丰度与无乳链球菌丰度呈正相关;⑤ 发现21个与ASD可能相关的尿液氨基酸,其或可作为ASD潜在的生物标志物。
2019-05-05
深圳大学附属华南医院 副研究员
微生态治疗研究所 所长
儿科学博士、临床医学博士后,毕业于复旦大学上海医学院;深圳大学硕导(专业学位-儿科学),附属华南医院副研究员,微生态治疗研究所所长。关注围产及新生儿期风险因素和“微生物-肠-脑”轴与神经发育疾病发生,研究方向包括:1)遗传及环境互作与儿童神经发育疾病发生(Am J Hum Genet 2013;Brain Behav Immun 2019,2020;Respir Res 2020);2)“微生物-肠-脑”轴及微生态治疗方法开发(mSystems 2019;J Dent Res 2022;Nat Neurosci 2023);3)机器学习、因果推断等人工智能方法研究(Comput Struct Biotechnol J 2020,2021,2022)。主持国家自然科学基金青年和面上各一项。累积发表50余篇SCI学术论文(被引超5500次, H-index为20)。是中国生物物理学会肠道菌群分会理事,“热心肠智库”专家,担任儿科学(Children (Basel)),神经科学(Neurosci Bull、Brain-X),遗传学(J Genet Genomics),微生物组学(iMeta)等领域知名期刊的编委(含青编)或执行副主编。
2001.9~2005.6:华中农业大学,生命科学技术学院,国家生命科学与技术人才培养基地
2005.9~2008.6:华中农业大学,植物科学技术学院,作物遗传育种,硕士,导师:张端品教授 / 合作导师:罗利军教授(上海市农业生物基因中心)
2016.9~2019.6:复旦大学,上海医学院/复旦大学附属儿科医院,临床医学/儿科学,导师:周文浩
2009.5~2015.2:深圳华大基因科技服务有限公司
2017.3~2019.2:复旦大学附属儿科医院厦门医院(厦门市儿童医院),科教科,学术主任
2020.1~2022.1:复旦大学,上海医学院/附属儿科医院,博士后,合作导师:周文浩
2022.2:深圳大学附属华南医院,实验研究部,微生态治疗研究所 所长
遗传及环境互作与儿童神经发育疾病发生
“微生物-肠-脑”轴及微生态治疗方法开发
机器学习、因果推断等人工智能方法研究
中国生物物理学会肠道菌群分会 委员;