徐振江等：深度学习新方法DeepPhylo助力提升微生物数据分析准确性

热心肠小伙伴们 2024-10-19

南昌大学徐振江团队发表研究，通过整合微生物丰度数据和系统发育信息，开发出一种深度学习新方法DeepPhylo，显著提高微生物组数据分析的预测准确性。

专家简介

徐振江

南昌大学食品科学与技术国家重点实验室教授

2012年博士毕业于University of Rochester，从事ncRNA的计算生物学研究，随后进入Rob Knight实验室从事微生物组学研究。2018年回国就职南昌大学食品科学与技术国家重点实验室。致力于开发微生物组学方法和生物信息大数据算法，研究人体微生物组结构和功能。发表SCI论文60余篇，引用率14000余次，Google Scholoar H-index 35，2020、2021年被遴选为全球高被引学者。获得国自然面上项目、科技部重点研发计划资助。

了解更多

相关推荐

祝贺17位热心肠智库专家入选2024年度“全球高被引科学家”名单

分属于交叉学科、微生物学、农业科学、临床医学领域。

2024-11-20

徐振江团队：胃癌进展期间的胃部菌群变化

南昌大学的徐振江团队在Gut Microbes上发表的一项荟萃分析结果，利用9个公开数据集中的健康、胃炎、肠化生及胃癌16S样本，分析了胃癌发生过程中的胃部菌群变化，并观察到不同亚型的幽门螺杆菌之间的互斥性。

2023-04-17

徐振江+游月华等：新方法助力区分复杂样本中的活/死菌

PMA处理是少数几种与宏基因组测序能兼容的方法之一，可用于表征活的/完整的微生物群。然而，其在唾液和粪便等复杂群落中的有效性仍存在争议，目前还缺乏一种有效的方法来消除人类微生物组样本中的宿主和死细DNA。近日，南昌大学徐振江、南方医科大学游月华及团队在mSystems发表最新研究，建立了一种渗透压裂解结合PMAxx的方法，可有效区分简单合成群落和复杂人类微生物群落中的活菌和死菌，值得关注。

2023-04-12