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徐振江
南昌大学食品科学与技术国家重点实验室教授
2012年博士毕业于University of Rochester，从事ncRNA的计算生物学研究，随后进入Rob Knight实验室从事微生物组学研究。2018年回国就职南昌大学食品科学与技术国家重点实验室。致力于开发微生物组学方法和生物信息大数据算法，研究人体微生物组结构和功能。发表SCI论文60余篇，引用率14000余次，Google Scholoar H-index 35，2020、2021年被遴选为全球高被引学者。获得国自然面上项目、科技部重点研发计划资助。 
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祝贺17位热心肠智库专家入选2024年度“全球高被引科学家”名单
分属于交叉学科、微生物学、农业科学、临床医学领域。
11-20
徐振江等：深度学习新方法DeepPhylo助力提升微生物数据分析准确性
南昌大学徐振江团队发表研究，通过整合微生物丰度数据和系统发育信息，开发出一种深度学习新方法DeepPhylo，显著提高微生物组数据分析的预测准确性。
10-19
徐振江团队：胃癌进展期间的胃部菌群变化
南昌大学的徐振江团队在Gut Microbes上发表的一项荟萃分析结果，利用9个公开数据集中的健康、胃炎、肠化生及胃癌16S样本，分析了胃癌发生过程中的胃部菌群变化，并观察到不同亚型的幽门螺杆菌之间的互斥性。
2023-04-17
徐振江+游月华等：新方法助力区分复杂样本中的活/死菌
PMA处理是少数几种与宏基因组测序能兼容的方法之一，可用于表征活的/完整的微生物群。然而，其在唾液和粪便等复杂群落中的有效性仍存在争议，目前还缺乏一种有效的方法来消除人类微生物组样本中的宿主和死细DNA。近日，南昌大学徐振江、南方医科大学游月华及团队在mSystems发表最新研究，建立了一种渗透压裂解结合PMAxx的方法，可有效区分简单合成群落和复杂人类微生物群落中的活菌和死菌，值得关注。
2023-04-12
《热心肠日报》解读 更多>>
徐振江团队：胃癌进展期间的胃部菌群变化
① 纳入9个16S数据集，包含的健康、胃炎、肠化生和胃癌样本数分别为104、511、223和1360；② 胃癌发生过程中，胃部菌群组成发生显著变化，尤其是移除幽门螺杆菌进行分析时；③ 与胃炎样本相比，梭杆菌属、纤毛菌属及几种乳酸菌（双歧杆菌属、乳杆菌属、咽峡炎链球菌等）在胃癌样本中频繁且显著富集；④ 与肠化生样本相比，口腔菌群在胃癌样本中富集；⑤ 不同亚型的幽门螺杆菌间存在互斥性；⑥ 在胃病进展过程中，胃液和粘膜菌群发生收敛性失调。
2023-04-05
徐振江+游月华等：新方法助力区分复杂样本中的活/死菌
① 建立了一种渗透压裂解结合PMAxx的方法表征复杂样本中的活体微生物群落，优化法（LyPMAxx-qPCR/测序）可有效去除唾液和粪便中95%以上的死菌，对活菌的影响较小；② LyPMAxx会降低唾液和粪便菌群的总体微生物量和多样性，改变物种的相对丰度；③ 冷冻保存会损伤唾液和粪便中65%和94%的活微生物细胞，唾液中变形菌门和放线菌门，粪便中拟杆菌门和厚壁菌门对冷冻最敏感；④ 样本栖息地和宿主个体差异也会影响微生物物种对lyPMAxx和冷冻的反应。
2023-03-27
徐振江团队：食品抗菌防腐剂如何影响菌群和糖代谢？
① 在健康小鼠中评估了11个常用的合成和生物源的抗菌防腐剂（AP）对肠道菌群和葡萄糖代谢的影响；② 不同来源的AP均可诱导健康小鼠产生葡萄糖不耐受并扰乱肠道菌群，其中生物源的乳酸链球菌素（Nisin）作用最显著；③ 结合靶向代谢组和菌群分析发现氨基酸代谢在AP处理后显著降低，可能影响GLP-1释放；④ Nisin通过下调GLP-1的表达改变葡萄糖调节激素的分泌，可能介导葡萄糖代谢紊乱；⑤ Nisin还增加胰岛素分泌，胰岛素抵抗是否参与其中还需研究。
2022-09-13
徐振江等：人类唾液菌群的日常动态变化
① 每隔10-60分钟对人唾液进行密集采样，分析菌群的动态变化及与人类活动的关系；② 进食活动扰动了唾液菌群，2种舌特异性细菌和3种牙菌斑特异性细菌在餐后增加；③ 菌群组成在不同的分类群水平上呈现昼夜振荡模式，如普雷沃菌属和拟普雷沃菌属在夜间增加，Bergeyella HMT 206和嗜血杆菌属在白天缓慢增加；④ 鉴定出与口腔不同部位（舌、牙菌斑）相关的唾液菌共现模式；⑤ 不同口腔部位的细菌对唾液菌群的贡献，受日常活动的动态影响。
2022-06-10
杨瑞馥+徐振江+毕玉晶：肠道微生物组和代谢组变化，或参与高原心脏病发生
① 采用低压性缺氧（H）条件模拟高原环境诱导心肌肥厚大鼠模型，在28天内监测大鼠肠道菌群、短链脂肪酸（SCFAs）和胆汁酸（BAs）的变化；② H组大鼠体重减轻、红细胞增多，发生病理性心肌肥厚，伴随肠道菌群结构改变，副拟杆菌属、别样杆菌属和乳球菌属丰度增加，拟杆菌属和普氏菌属比例升高；③ H刺激引起粪便和血浆中SCFAs和BAs代谢异常，扰动微生物组-代谢组互作网络；④ 粪菌移植增加H大鼠菌群多样性，恢复结构，改善SCFAs代谢和心肌肥厚。
2022-03-14
徐振江+毕玉晶等：高山症中的肠道菌群靶向调控
① 益生菌、益生元和合生制剂治疗可缓解大鼠长期暴露于低压缺氧（模拟海拔5000米）环境下，引起的病理性心脏肥大；② 益生菌、益生元和合生制剂可显著缓解低压缺氧造成的大鼠肠道菌群失调，包括乳杆菌科和普雷沃氏菌科等的改变；③ 低压缺氧改变大鼠血浆短链脂肪酸（SCFAs）、胆汁酸（BAs）、氨基酸、神经递质和游离脂肪酸水平，但不影响粪便总SCFAs和BAs量；④ 靶向治疗能够一定程度恢复血浆中氨基酸和神经递质稳态，但对其他测量的代谢物无效。
2022-02-09
王军军团队：绿茶多酚或能调肠菌治肠炎
① DSS诱导的结肠炎小鼠模型中，绿茶多酚EGCG（表没食子儿茶素没食子酸酯）的口服给药能减轻结肠炎症、肠粘膜氧化应激和屏障功能障碍，而结肠给药无此效果；② 这些保护性作用与EGCG改变肠道菌群的组成和功能有关，包括增加阿克曼菌属等丰度、促进丁酸等短链脂肪酸的生成；③ 在诱导结肠炎前预防性口服EGCG，也能改变小鼠肠道菌群，减轻DSS诱导的结肠炎；④ 粪菌移植实验证明，EGCG的有益作用是由肠道菌群介导的。
2021-09-07
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注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者
2024
CAPartial order relation-based gene ontology embedding improves protein function prediction
BRIEF BIOINFORM, 10.1093/bib/bbae077
2023
CAMeta-analysis reveals Helicobacter pylori mutual exclusivity and reproducible gastric microbiome alterations during gastric carcinoma progression
Gut Microbes, 10.1080/19490976.2023.2197835
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CASystematic Evaluation of the Viable Microbiome in the Human Oral and Gut Samples with Spike-in Gram+/- Bacteria
mSystems, 10.1128/msystems.00738-22
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2022
CASystematic evaluation of antimicrobial food preservatives on glucose metabolism and gut microbiota in healthy mice
NPJ SCI FOOD, 10.1038/s41538-022-00158-y
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CADiurnal and eating-associated microbial patterns revealed via high-frequency saliva sampling
Genome Res, 10.1101/gr.276482.121
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CAMicrobial and Nonvolatile Chemical Diversities of Chinese Dark Teas Are Differed by Latitude and Pile Fermentation
J AGR FOOD CHEM, 10.1021/acs.jafc.2c01005
CAAlterations in gut microbiota and metabolites associated with altitude-induced cardiac hypertrophy in rats during hypobaric hypoxia challenge
Sci China Life Sci, 10.1007/s11427-021-2056-1
2021
SEQEL: a tool for biological sequence manipulation in Emacs
10.1093/bioadv/vbab019
2020
CAHuman Skin, Oral, and Gut Microbiomes Predict Chronological Age
mSystems, 10.1128/mSystems.00630-19
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头衔
南昌大学食品科学与技术国家重点实验室教授
简介
2012年博士毕业于University of Rochester，从事ncRNA的计算生物学研究，随后进入Rob Knight实验室从事微生物组学研究。2018年回国就职南昌大学食品科学与技术国家重点实验室。致力于开发微生物组学方法和生物信息大数据算法，研究人体微生物组结构和功能。发表SCI论文60余篇，引用率14000余次，Google Scholoar H-index 35，2020、2021年被遴选为全球高被引学者。获得国自然面上项目、科技部重点研发计划资助。 
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陈从英
江西农业大学首席教授
陈义华
中国科学院微生物研究所研究员
戴磊
中国科学院深圳先进技术研究院研究员
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