傅静远
荷兰格罗宁根大学医学中心系统医学教授
荷兰格罗宁根大学系统医学教授。研究领域包括宿主和肠道菌群在代谢及免疫的相互作用,以及对人体健康的影响。研究项目涉及大数据群体水平研究,例如荷兰LifeLines 项目,跟踪分析近17万个体30年,分析遗传,饮食,环境,肠道菌群及社会经济因素对疾病和性状的影响,以达到个体化、精准化医疗。至今共发表SCI论文70多篇,其中18篇论文发表Science, Cell, Nature及其子刊(8篇作为第一或通讯作者)。论文总引用数达6500以上 (H index 36)。
傅静远等Nature:大规模解析人体与肠菌的基因互作,揭示血型如何影响肠菌
① 对4个荷兰队列9015人进行微生物组全基因组关联分析,鉴定出宿主基因型与肠道菌群基因组结构变异(SV)的>210个潜在关联;② 普氏粪杆菌(Fp)的一个SV区域与宿主ABO位点高度相关,并在坦桑尼亚队列中验证;③ 该SV区域编码N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)利用基因簇,在粘膜A抗原个体中(分泌含有GalNAc的A型抗原)富集,且体外实验证明携带GalNAc代谢途径的Fp菌株可利用GalNAc作为唯一碳源;④ 产气柯林斯菌等其他ABO相关肠菌物种也能利用GalNAc;⑤ GalNAc利用基因还与菌群丰富度和多样性以及宿主心脏代谢健康指标相关,尤其在粘膜A抗原个体中。
01-03
Cell子刊:构建炎症性肠病患者的抗体表位库
① 高通量噬菌体展示免疫沉淀测序技术(PhIP-Seq)对497名IBD患者和1326名对照进行分析,鉴定出针对344000种抗菌、免疫和食物抗原的抗体;② IBD存在373种差异的抗体反应(202种过度表达,171种不足表达),其中17%由两种IBD共享,55%为CD独有,28%为UC独有;③ 针对细菌鞭毛蛋白的抗体反应性在CD中占主导地位,与回肠受累、纤维狭窄性疾病和抗酿酒酵母抗体阳性有关,但与粪菌组成无关;④ 抗体表位库以及仅使用10种抗体都可将CD与对照区分。
2023-05-09
Nature子刊:gutSMASH助力评估肠道菌群特定代谢潜力
① 开发了一种用于识别肠菌代谢潜力的工具gutSMASH,在4240个高质量基因组中鉴定到近2万个代谢基因簇(MGC);② 梭状芽胞杆菌属呈现显著的代谢多功能性(含43种不同MGC),其次是肠杆菌科(含22-25种不同MGC);③ gutSMASH揭示了SCFAs生产的分类学差异,且拟杆菌属、埃希氏菌属和梭菌属3种主要菌属的能量捕获机制也存在显著差异;④ 对含1135名个体的人群队列分析,发现血浆和粪便菌群的代谢物水平与相应代谢基因的宏基因组丰度相关性很弱。
2023-02-13
傅静远团队:菌群衍生的维生素与糖尿病相关因素间有何关联?
① 纳入1135人,系统评估肠道菌群产生的维生素与糖尿病和心脏代谢相关因素间的关联;② 相比男性,女性肠菌中维生素B2和B6合成途径丰度更高,B12更低,且B9和B12生物合成途径与年龄负相关;③ 血糖相关因子(如胰岛素)、脂质、循环炎症和粪便短链脂肪酸等糖尿病相关因素与肠道菌群维生素产生有关;④ 泻药和二甲双胍使用与维生素B1/B6生物合成途径水平升高相关;⑤ 水果衍生的蛋白质和成分可通过调节肠菌产生维生素B1/B2降低患糖尿病的风险。
2022-12-06
傅静远+陈连民Nature子刊:大规模解析!遗传、饮食和肠道菌群如何影响人体代谢?
① 纳入1368人,系统分析1183种血浆代谢物与遗传、饮食和肠道菌群的关联;② 饮食和菌群对代谢物的影响大于遗传,三者分别主导了610、85和38种代谢物的个体间变化;③ 受饮食/菌群/遗传影响越大的代谢物,其时间稳定性越高;④ 建立模型,能基于代谢物水平评估饮食质量;⑤ 通过孟德尔随机化和中介分析,推测了饮食、菌群和代谢物之间的因果关系,如直肠真杆菌可能有利于降低损害心血管的亚硫酸氢盐,以及饮食可通过代谢物塑造菌群。
2022-10-10
1型糖尿病患者的肠道菌群特征,及其与血糖控制和并发症的关系
① 纳入238名1型糖尿病(T1D)患者和2937名匹配的对照个体,分析肠道菌群及其与T1D相关特征和血管并发症的关系;② 肠道菌群的α多样性在T1D患者与健康对照间无显著差异,分别有43个和37个细菌分类群在T1D中减少和富集;③ 血糖控制(糖化血红蛋白HbA1c)、病程、微血管和大血管并发症,都可部分解释肠道菌群变异性;④ HbA1c、肾病和大血管并发症均与菌群的多个物种丰度有关,其中肾病和大血管并发症都与梭菌目相关。
2022-06-29
傅静远等Nature:人类肠道微生物组、暴露组与遗传力
① 纳入来自3代人、2756个家庭的8208名荷兰人,分析其肠道微生物组成、功能、抗生素耐药性和毒力因子等数据;② 鉴别出1253个微生物分类单元、564条代谢通路,约600个菌种、9个核心菌种以及基石特征(28个菌种、53条通路),发现Prevotella copri主导微生物组分型;③ 分析241个宿主表型与微生物组间关系,揭示了菌群与饮食、童年生活环境、社会经济地位等暴露组参数间7519个显著关联;④ 发现同居是影响菌群的主要因素,只有6.6%的菌群如Akk菌可遗传;⑤ 不同疾病具有共同微生物组特征且与共存病无关,不健康肠道菌群同时反映疾病和用药情况。
2022-04-13
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
2024
2023
2022
2021
荷兰格罗宁根大学医学中心系统医学教授
荷兰格罗宁根大学系统医学教授。研究领域包括宿主和肠道菌群在代谢及免疫的相互作用,以及对人体健康的影响。研究项目涉及大数据群体水平研究,例如荷兰LifeLines 项目,跟踪分析近17万个体30年,分析遗传,饮食,环境,肠道菌群及社会经济因素对疾病和性状的影响,以达到个体化、精准化医疗。至今共发表SCI论文70多篇,其中18篇论文发表Science, Cell, Nature及其子刊(8篇作为第一或通讯作者)。论文总引用数达6500以上 (H index 36)。
1995年,南京大学生物化学系,获学士学位
2003年,荷兰瓦赫宁根大学,获生物信息学优异硕士学位
2007年,荷兰格罗宁根大学,获优异博士学位
2008-2010年 荷兰格罗宁根大学遗传系 博士后
2010-2012 荷兰格罗宁根大学遗传系 VENI research fellow
2012-2015 荷兰格罗宁根大学遗传系 助理教授
2015-2019 荷兰格罗宁根大学遗传系及儿科系 副教授,博导
2019 荷兰格罗宁根大学遗传系及儿科系 Tenure Track教授,博导
宿主和肠道菌群在代谢及免疫的相互作用,以及对人体健康的影响