苏晓泉等:利用条件致病菌指数评估环境微生物风险
热心肠小伙伴们 2022-01-19
近期,青岛大学苏晓泉作为通讯作者在Journal of Genetics and Genomics发表文章。作者开发的生物信息工具-条件致病菌指数(Microbial index of pathogenic bacteria,MIP) ,从人体条件致病菌角度考察菌群多样性和致病性,并从菌群大数据层面揭示条件致病菌分布情况,为理解全球范围内致病菌的组成和分布提供了启示。

近期,青岛大学苏晓泉作为通讯作者在Journal of Genetics and Genomics发表文章Comprehensive understanding to the public health risk of environmental microbes via a microbiome-based index。作者开发的生物信息工具-条件致病菌指数(Microbial index of pathogenic bacteria,MIP) ,从人体条件致病菌角度考察菌群多样性和致病性,并从菌群大数据层面揭示条件致病菌分布情况,为理解全球范围内致病菌的组成和分布提供了启示。并展望未来,MIP的精确度将进一步提升,涉及全基因组测序数据,用于物种和菌株水平的病原菌鉴定。此外,还将根据目前在破译菌群功能方面的进展,考虑代谢功能基因和途径,以进一步了解病原菌的风险。

专家简介
苏晓泉
青岛大学计算机科学技术学院教授
苏晓泉,博士,教授,博士生导师。泰山学者青年专家,山东青创人才引育团队带头人,CCF高级会员,国家留学基金公派访问学者,青岛大学特聘教授。研究方向为生物信息学与大数据科学,已在该领域内mBio、mSystems、Bioinformatics、Adv. Intell. Syst.等期刊发表学术论文50余篇,主持国家自然科学基金面上/青年项目、国家重点研发计划任务、山东省自然基金重大基础项目、中科院重点部署项目子课题等,相关成果获得10项软件著作权。主持开发的“微生物组搜索引擎”(mse.ac.cn),入选“中国生物医药技术十大进展”,并被新华社、科技日报、AsianScientist等国内外媒体报道评价为“A Google For Microbiome Research”。
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