《热心肠日报》2023-2024年度榜单 | 14学术主题之医药转化30篇必读论文和中国十大研究
热心肠小伙伴们 2024-06-24
本篇发布“医药转化”主题的两个榜单(30篇必读论文、中国十大研究)。

过去的一年里,全球肠道领域的研究成果颇丰,取得了许多令人瞩目的进展。2024年热心肠大会之际,我们基于《热心肠日报》中收录的2023年5月以来的一年期间(2023年5月1日至2024年4月30日)发表的肠道相关领域论文,进行了多维度评选,形成了《热心肠日报》2023-2024年度榜单。

此次榜单评选涵盖了3240篇发表在363个不同期刊上的研究文献,累计影响因子达到75058.51,平均影响因子为23.17。其中,发表在CellNatureScience上的文章有153篇,发表在NEJMLancetJAMA上的文章有46篇。
本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选,可能存在主观因素干扰等不足,仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。
本篇发布“医药转化”主题的两个榜单(30篇必读论文中国十大研究)。

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Lancet:呋喹替尼或可有效延长难治性转移性结直肠癌患者生存期

Lancet[IF:98.4]

① 纳入691例难治性转移性结直肠癌患者(中位年龄64岁),既往接受过标准全身治疗(73%接受了超过3线治疗),2:1随机分配至呋喹替尼治疗组(5mg,每日一次,每1-21天,28天周期)或安慰剂组;② 治疗暴露中位持续时间3.1个月,与安慰剂相比,呋喹替尼显著延长患者的中位总生存期(7.4个月 vs. 4.8个月)和中位无进展生存期(3.7个月 vs. 1.8个月);③ 呋喹替尼和安慰剂组的3级及以上严重不良事件发生率分别为63%和50%。

Fruquintinib versus placebo in patients with refractory metastatic colorectal cancer (FRESCO-2): an international, multicentre, randomised, double-blind, phase 3 study
2023-06-15 , doi: 10.1016/S0140-6736(23)00772-9

Lancet:阿米替林可缓解IBS症状(3期临床)

Lancet[IF:98.4]

① 纳入463名参与者(68%女性)随机分配接受低剂量阿米替林(232人)或安慰剂(231人)治疗;② 阿米替林在3个月和6个月时的主要结果优于安慰剂,组间IBS-SSS评分差异显著;③ 主观全面评定发现服用阿米替林患者总体改善症状的可能性几乎是安慰剂组的两倍;④ 参与者的焦虑或抑郁评分无显著差异,说明药物可能通过肠道而不是抗抑郁发挥作用;⑤ 阿米替林的不良反应主要与其已知的抗胆碱能作用有关,除便秘和腹泻外(<10%),严重的不良反应很少。

Amitriptyline at Low-Dose and Titrated for Irritable Bowel Syndrome as Second-Line Treatment in primary care (ATLANTIS): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 trial
2023-10-16 , doi: 10.1016/S0140-6736(23)01523-4

NEJM:三氟尿苷/替吡嘧啶+贝伐珠单抗治疗转移性结直肠癌

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 246名接受过不超过2线化疗的转移性结直肠癌患者随机均分为两组,分别接受FTD-TPI+贝伐珠单抗治疗(联合治疗组)或FTD-TPI治疗(FTD-TPI组);② 联合治疗组的中位总生存期为10.8个月,显著高于FTD-TPI组的7.5个月;③ 联合治疗组的中位无进展生存期为5.6个月,显著高于FTD-TPI组的2.4个月;④ 最常见不良事件为中性粒细胞减少、恶心、贫血,未发生治疗相关死亡;⑤ 联合治疗组的ECOG评分恶化的中位时长为9.3个月,显著高于FTD-TPI组的6.3个月。

Trifluridine–Tipiracil and Bevacizumab in Refractory Metastatic Colorectal Cancer
2023-05-04 , doi: 10.1056/NEJMoa2214963

NEJM:乌帕替尼可用于治疗中重度克罗恩病

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 两项诱导试验分别纳入526例、495例中重度克罗恩病(CD)患者,2:1随机分组至每日45mg乌帕替尼治疗组或安慰剂;② 维持试验纳入上述诱导治疗有临床反应的患者,1:1:1随机分组至每日15mg、30mg乌帕替尼或安慰剂;③ 12周(诱导试验)时和52周(维持试验)时,乌帕替尼组患者的临床和内镜下缓解比例显著高于安慰剂组;④ 45mg和30mg乌帕替尼组的带状疱疹感染发生率较安慰剂组更高,30mg乌帕替尼组的肝病和中性粒细胞减少发生率较其他组更高。

Upadacitinib Induction and Maintenance Therapy for Crohn’s Disease
2023-05-25 , doi: 10.1056/NEJMoa2212728

NEJM:Mirikizumab或成为新一代炎症性肠病药物

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 在中度至重度活动性溃疡性结肠炎患者中开展mirikizumab的诱导和维持两项试验;② 诱导试验第12周,治疗组24.2%患者达到临床缓解,高于安慰剂组13.3%,维持试验第40周,治疗组49.9%达到临床缓解,显著高于安慰剂组25.1%;③ 两项试验均符合临床缓解、内镜下缓解和急便症状改善的标准;④ 治疗组发生鼻咽炎和关节痛的不良事件比安慰剂组更频繁,且在1217例治疗组中,发生机会性感染15例,癌症8例,安慰剂组1例患带状疱疹感染,无人患癌。

Mirikizumab as Induction and Maintenance Therapy for Ulcerative Colitis
2023-06-29 , doi: 10.1056/NEJMoa2207940

NEJM:索托拉西布+帕尼单抗,或对化疗难治性转移性大肠癌有益

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 开展一项多中心、开放标签、随机的3期临床试验,将未接受KRAS G12C抑制剂治疗的转移性CRC患者分3组;② 中位随访7.8个月后,接受960和240mg的索托拉西布+帕尼单抗组及标准治疗组的中位无进展生存期为5.6、3.9和2.2个月,客观缓解率为26.4、5.7和0%;③ 相比标准治疗组,接受960和240mg的索托拉西布+帕尼单抗组的疾病进展或死亡风险比为0.49和0.58,不良事件发生率为35.8和30.2%;④ 皮肤相关毒性作用和低镁血症是联合治疗最常见的不良事件。

Sotorasib plus Panitumumab in Refractory Colorectal Cancer with Mutated KRAS G12C
2023-10-22 , doi: 10.1056/NEJMoa2308795

仁济医院NEJM:治疗小肠血管发育不良反复出血,沙利度胺疗效显著

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 开展一项多中心、双盲、随机、安慰剂对照试验,共150名小肠血管发育不良(SIA)反复出血患者被分配接受沙利度胺或安慰剂治疗4个月,评估沙利度胺对SIA反复出血的疗效和安全性;② 其中,51人和49人被随机分配到100 mg和50 mg沙利度胺组,50人被分配到安慰剂组;③ 100 mg和50 mg沙利度胺组及安慰剂组有效缓解率为68.6%、51.0%和16.0%;④ 沙利度胺组不良事件发生率高于安慰剂组,如便秘、嗜睡、肢体麻木、外周水肿、头晕和肝酶水平升高。

Thalidomide for Recurrent Bleeding Due to Small-Intestinal Angiodysplasia
2023-11-02 , doi: 10.1056/NEJMoa2303706

NEJM:首款NASH疗法有望问世!

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 在resmetirom的3期临床试验中,评估了resmetirom治疗有明显肝纤维化(纤维化2级或3级)的NASH患者的效果,发现其能够同时改善肝纤维化和清除非酒精性脂肪性肝炎(NASH)症状,且严重不良事件的发生率与安慰剂组相似;② 在接受80和100 mg的resmetirom治疗的患者中,分别有25.9%和29.9% NASH改善且无肝纤维化恶化,安慰剂组仅有9.7%;③ 肝纤维化至少一级改善且无NAFLD活动评分恶化的比例在80和100 mg的resmetirom组分别为24.2%和25.9%,而安慰剂组为14.2%;④ Resmetirom组的低密度脂蛋白胆固醇水平显著下降,但伴有较高的腹泻和恶心发生率,严重不良事件的发生率在试验组间相似。

A Phase 3, Randomized, Controlled Trial of Resmetirom in NASH with Liver Fibrosis
02-08 , doi: 10.1056/NEJMoa2309000

国内团队JAMA:信迪利单抗联合化疗用于胃癌和胃食管交界腺癌

JAMA[IF:63.1]

① 在中国62家医院共纳入650例患有无法切除的局部晚期或转移性胃或胃食管交界癌患者进行信迪利单抗或安慰剂联合XELOX方案治疗;② 在所有随机患者中,与安慰剂相比,信迪利单抗将总生存期中位数从12.3个月提高到15.2个月;③ 61.1%患者的肿瘤PD-L1联合阳性评分大于等于5,在这些患者中信迪利单抗将总生存期中位数从12.9个月提高到18.4个月;④ 与治疗相关最多的不良事件是血小板计数减少、中性粒细胞计数减少和贫血。

Sintilimab Plus Chemotherapy for Unresectable Gastric or Gastroesophageal Junction Cancer - The ORIENT-16 Randomized Clinical Trial
2023-12-05 , doi: 10.1001/jama.2023.19918

JAMA:用GLP-1受体激动剂减肥,可能引发哪些胃肠道副作用?

JAMA[IF:63.1]

① 纳入4757例GLP-1激动剂「4144例利拉鲁肽(L)和613例司美格鲁肽(S)」和654例纳曲酮-安非他酮(BN)使用者,并随访;② GLP-1激动剂的胆道疾病、胰腺炎、肠梗阻和胃轻瘫发生率比BN高,如S、L和BN胆道疾病发病率(千人年)为11.7、18.6和12.6;③ GLP-1激动剂会增加胰腺炎、肠梗阻和胃轻瘫风险(HR分别为9.09、4.22、3.67),但与胆道疾病风险的关联无统计学意义;④ 敏感性分析表明,上述关联的显著性不受高血脂症和肥胖史影响。

Risk of Gastrointestinal Adverse Events Associated With Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonists for Weight Loss
2023-10-05 , doi: 10.1001/jama.2023.19574

Nature Reviews:微生物组在癌症治疗中的重要作用(综述)

Nature Reviews Immunology[IF:67.7]

① 肠道微生物及其产物可影响如化疗、放疗、免疫检查点抑制剂和CAR-T疗法等多种癌症治疗效果;② 肠道微生物及其产物可改善癌症治疗导致的粘膜炎、结肠炎、神经毒性等副作用;③ 肠道微生物相关分子模式(MAMP)可激活NOD2等模式识别受体,驱动炎症反应;④ 肠道微生物向肿瘤和淋巴结的转移可增强免疫细胞激活,并可改变免疫检查点分子的表达;⑤ 粪菌移植、饮食、益生菌、益生元、抗生素和噬菌体等可调节肠道菌群,从而改善癌症治疗效果。

Role of the microbiota in response to and recovery from cancer therapy
2023-11-06 , doi: 10.1038/s41577-023-00951-0

Nature Reviews:将微生物组纳入精准医学(综述)

Nature Reviews Microbiology[IF:69.2]

① 菌群可作为标志物鉴定疾病易感个体,通过菌群靶向性干预调控疾病风险可用于个体化的疾病一级预防;② 量化疾病相关微生物和菌群代谢物等分子可用于疾病诊断,肿瘤等组织的低生物量菌群也有应用前景;③ 治疗疾病的菌群干预包括:补充微生物(用益生菌/元和精准营养促进有益菌、工程菌、菌群移植)、靶向性清除疾病相关微生物(如噬菌体疗法)、菌群衍生分子(如SCFA、胆汁酸等);④ 菌群还可用于调节疗效和不良反应;⑤ 该领域仍有诸多挑战。

Utilization of the microbiome in personalized medicine
2023-12-18 , doi: 10.1038/s41579-023-00998-9

Nature子刊:饮食干预对造血干细胞移植患者的肠道菌群代谢的影响

Nature Medicine[IF:58.7]

① 纳入10名造血干细胞移植(HCT)患者纵向分析表明,HCT患者服用抗性马铃薯淀粉(RPS)作为饮食干预是安全可行且耐受的;② 服用RPS后患者粪便中丁酸含量明显高于未服用时,但由于样本数量有限,菌群α多样性和产丁酸菌群相较对照组均无显著区别;③ RPS组患者血浆中的丁酸、丙酸和乙酸的含量均无变化,与对照组也无显著区别;④ 与基线相比,HCT短期内改变了82种血浆代谢物,虽然3个月后会缓解,但与对照组相比,RPS组的缓解速度更快更好。

Feasibility of a dietary intervention to modify gut microbial metabolism in patients with hematopoietic stem cell transplantation
2023-10-19 , doi: 10.1038/s41591-023-02587-y

Nature子刊:移植健康人肠道菌群,或能改善抗PD-1免疫治疗效果

Nature Medicine[IF:58.7]

① 一项多中心1期试验纳入20名未经治疗的晚期黑色素瘤患者,单次口服健康供体粪菌移植(FMT)胶囊后进行抗PD-1免疫治疗,中位随访20.7个月;② 安全性方面,单独FMT及联合免疫治疗后,分别有0和5名患者发生3级不良事件;③ 客观缓解率65%,有4名患者完全应答;④ 所有患者都有其对应供体的菌株植入,但只有应答者的菌株植入率随时间增加;⑤ FMT后,应答者中特定肠菌富集(如某些瘤胃球菌属物种);⑥ 小鼠实验表明,健康供体菌群有助于抗PD-1治疗。

Fecal microbiota transplantation plus anti-PD-1 immunotherapy in advanced melanoma: a phase I trial
2023-07-06 , doi: 10.1038/s41591-023-02453-x

Nature子刊:菌群或可帮助筛查肛门癌

Nature Medicine[IF:58.7]

① 将HIV感染者(93.9%为男男性关系)分为发现(n=167)和验证队列(n=46),进行高级鳞状上皮内病变 (HSIL/肛门癌)筛查;② 在两个队列中,没有发现与HSIL相关的特征肛门菌群,但HSIL相关细菌过度表达产生琥珀酰辅酶A和钴胺素;③ 菌群衍生的钴胺素和琥珀酰辅酶A蛋白水平升高与HSIL显著相关;④ 相比肛门细胞学检测,两种生物标志物的组合检测效果更优(灵敏度和特异性分别提高至96.6%和81.8%),可作为肛门癌筛查的新方法。

Microbiome-derived cobalamin and succinyl-CoA as biomarkers for improved screening of anal cancer
2023-07-18 , doi: 10.1038/s41591-023-02407-3

Nature子刊:ctDNA或能指导转移性大肠癌的治疗选择

Nature Medicine[IF:58.7]

① 纳入700多名RAS野生型转移性结直肠癌(mCRC)患者,对其基线血浆样本中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行探索性生物标志物分析,发现ctDNA基因改变可作为评估抗表皮生长因子(EGFR)治疗效果的生物标志物;② 在没有ctDNA基因改变的患者中,与bevacizumab联合改良FOLFOX6方案相比,panitumumab联合改良FOLFOX6方案能显著延长总生存期(40.7对34.4个月);③ 然而,对于ctDNA中含有任何基因改变的患者,无论肿瘤位于何侧,panitumumab的治疗效果相似甚至较差(19.2对22.2个月);④ 本研究表明通过ctDNA的负向超选择或可指导mCRC患者的最佳治疗选择。

Baseline ctDNA gene alterations as a biomarker of survival after panitumumab and chemotherapy in metastatic colorectal cancer
02-12 , doi: 10.1038/s41591-023-02791-w

Nature子刊:纵向分析菌群变化,揭示与癌症免疫治疗长期疗效相关的肠菌特征

Nature Medicine[IF:58.7]

① 通过对175名接受免疫检查点阻断(ICB)治疗的晚期黑色素瘤患者进行纵向的基于物种基因组分箱(SGBs)的肠道微生物组分析,研究揭示出与治疗效果相关的微生物组变化,为指导通过调控微生物组以增强ICB疗效提供了重要参考;② 在实现12个月或更长无进展生存期(PFS≥12)的患者与PFS小于12个月(PFS <12)的患者之间,发现了99个SGB有不同的表达模式,其中20个SGB丰度在基线时差异显著,42个SGB仅在治疗后差异显著;③ 识别出5个SGB在PFS≥12的患者中持续高表达,而4个SGB在PFS<12的患者中持续高表达;④ 通过构建这些SGB的对数比值,发现其与总生存期有关联;⑤ 不同的临床情境下存在不同的微生物组动态,包括ICB方案类型、免疫相关不良事件的发展以及合并用药情况。

Longitudinal gut microbiome changes in immune checkpoint blockade-treated advanced melanoma
02-16 , doi: 10.1038/s41591-024-02803-3

Nature子刊:菌株水平的肠菌特征,助力癌症免疫治疗

Nature Medicine[IF:58.7]

① 对106名接受免疫检查点阻断(ICB)组合治疗(抗PD-1+抗CTLA-4)的罕见癌患者的肠道微生物进行深度测序分析,发现菌株水平的肠菌丰度特征比菌种水平的特征能更好地预测治疗效果;② 识别出22个与治疗反应相关的关键菌株,大部分属于厚壁菌门,7个与疗效正相关的菌株中有4个来自粪杆菌属(Faecalibacterium);③ 对6项可比研究的数据进行荟萃分析(n=364),发现上述菌群特征在使用相同治疗方案的队列中具有较好的泛化性(跨癌症、跨国家),但不能推广到抗PD-1单药队列,提示肠道菌群特征对不同的ICB治疗方案具有特异性;④ 本研究强调了在开发基于肠道微生物的诊疗方法时,或应根据ICB治疗方案而非癌症类型进行定制,并强调了菌株分辨率在开发微生物组生物标志物中的重要性。

A gut microbial signature for combination immune checkpoint blockade across cancer types
03-01 , doi: 10.1038/s41591-024-02823-z

中山大学Nature子刊:创新三联疗法——治疗MSS/pMMR结直肠癌的新策略

Nature Medicine[IF:58.7]

① 中山大学的王峰和徐瑞华团队合作发表文章,发现在不可切除的化疗难治性局部晚期或转移性微卫星稳定/错配修复功能正常(MSS/pMMR)结直肠癌患者中,联合使用PD-1抗体sintilimab、HDAC抑制剂chidamide以及VEGF抗体bevacizumab是非常具有潜力的治疗方案;② 48名患者分配到双联组(anti-PD1+HDACi,n=23)或三联组(n=25),三联组比双联组在18周无进展生存率(64.0% vs 21.7%)、总体响应率(44.0% vs 13.0%)和中位无进展生存期(7.3个月 vs 1.5个月)均显著改善;③ 最常见的治疗相关不良事件包括蛋白尿、血小板减少、中性粒细胞减少、贫血、白细胞减少和腹泻,有两例与治疗相关的死亡事件(肝功能衰竭和肺炎);④ 三联组增强CD8+ T细胞的浸润,导致更具免疫活性的肿瘤微环境。

Combined anti-PD-1, HDAC inhibitor and anti-VEGF for MSS/pMMR colorectal cancer: a randomized phase 2 trial
03-04 , doi: 10.1038/s41591-024-02813-1

Nature Reviews:肠道肿瘤菌群特征及其潜在应用(综述)

Nature Reviews Clinical Oncology[IF:81.1]

① 研究肠道菌群失调与菌群组织定殖/感染之间的关联,可为胰腺癌、尿路上皮癌等癌症的病因、预防及治疗提供新的见解;② 癌症患者与看似无关的其它疾病的患者共享肠道菌群特征,这些疾病的特征是健康相关共生菌群与慢性炎症疾病相关共生菌群的失衡;③ 已鉴定出在不同的癌症组织分型中具有共性的肠道肿瘤菌群特征(GOMS);④ GOMS或可作为多种癌症类型的非侵入性的、具有成本效益的早期诊断方式,或可用于预测对免疫检查点抑制剂的耐药性。

Gut OncoMicrobiome Signatures (GOMS) as next-generation biomarkers for cancer immunotherapy
2023-06-26 , doi: 10.1038/s41571-023-00785-8

Nature Reviews:通过调节肠道菌群增强免疫检查点抑制剂疗效(综述)

Nature Reviews Clinical Oncology[IF:81.1]

① 饮食是塑造肠道菌群组成和功能的关键因素;② 靶向PD-1、PD-L1或CTLA 4的免疫检查点抑制剂(ICI)疗法可改善肿瘤诱导的免疫抑制;③ 肠道菌群可提高ICI的治疗效果,并降低ICI治疗的副作用;④ 肠道菌群代谢产物(肌苷、氧化三甲胺、环二腺苷酸、吲哚3-乙酸等)增强抗肿瘤免疫;⑤ 饮食、益生元、益生菌、后生元、粪菌移植、人工菌群等可改善肠道菌群,提高ICI疗效;⑥ 根据患者的肠道菌群特性、全身免疫参数和肿瘤特征进行个性化治疗十分必要。

Towards modulating the gut microbiota to enhance the efficacy of immune-checkpoint inhibitors
2023-07-24 , doi: 10.1038/s41571-023-00803-9

Nature Reviews:mIBD精准医疗报告标准(综述)

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:45.9]

① 基因学研究通过确定分子病因使单基因炎症性肠病(mIBD)患者可能获得基因型引导的精准医疗;② mIBD的治疗研究主要来源于回顾性观察性临床报告,缺乏前瞻性临床试验的疗效数据,多种治疗方法没有统一的结果报告标准,无法作为临床决策基础;③ mIBD患者的治疗目标应反映患者与健康相关的生活质量和疾病特异性预后,传统IBD治疗目标也适用于mIBD患者;④ mIBD报告标准应包括遗传学、表型、肠道炎症、肠外疾病、治疗和不良事件等分子诊断参数。

Precision medicine in monogenic inflammatory bowel disease: proposed mIBD REPORT standards
2023-10-03 , doi: 10.1038/s41575-023-00838-4

Nature:监测肠内多种炎症标志物的工程菌电子小胶囊

Nature[IF:50.5]

① 以益生菌EcN为底盘构建工程菌生物传感器,其编码基于重组酶的记录系统,能感应多种瞬时炎症标志物(如:NO、H2O2、连四硫酸盐、硫代硫酸盐)进而发光,并在小鼠和猪的肠道炎症模型中进行了验证;② 将上述工程菌与低功耗的定制电子读出电路(能将工程菌的光信号转换为无线信号)整合为可吞咽的细菌电子传感器胶囊(体积<1.4立方厘米),可通过智能手机等便携设备接收实时数据;③ 在活猪小肠中验证了该胶囊设备的功能。

Sub-1.4 cm3 capsule for detecting labile inflammatory biomarkers in situ
2023-07-26 , doi: 10.1038/s41586-023-06369-x

Nature:用可解释的深度学习模型,研发对抗超级耐药菌的全新抗生素

Nature[IF:50.5]

① 基于39312种化合物抗生素活性和人体细胞毒性特征,采用蒙特卡罗搜索树算法结合深度学习模型,筛选大约1200万种化合物,被预测对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)具有活性;② 对模型识别的283种候选化合物进行验证,通过在培养皿测试MRSA,进而识别出两个来自同一类别化合物;③ 构建两种小鼠感染模型(皮肤和系统感染),发现这些化合物可将小鼠体内MRSA数量减少10倍;④ 这些化合物可通过破坏细菌维持细胞膜电化学梯度的能力来杀死细菌。

Discovery of a structural class of antibiotics with explainable deep learning
2023-12-20 , doi: 10.1038/s41586-023-06887-8

国内外合作Science:新型生物材料助力胃肠道术后监测

Science[IF:44.7]

① 胃肠道手术后的吻合口漏可危害患者健康甚至生命,其早期检测仍是挑战,清华大学王禾翎与国外团队合作的这项研究开发了一种生物可吸收、形状自适应的材料结构(BioSUM),以实现对深部组织稳态的常规超声监测;② BioSUM由分布在pH响应性水凝胶中的生物可吸收的微小金属盘组成,可通过手术植入或注射方式置于监测部位,金属盘间距的变化可反映该部位的pH变化,可在超声图像中测量;③ 在大鼠和猪模型中,BioSUM成功检测到胃、小肠和胰腺的泄漏,表现出对pH变化的敏感性和特异性;④ BioSUM在体内能自然分解吸收,无需二次手术取出,有望用于术后胃肠道吻合口漏的早期监测。

Bioresorbable shape-adaptive structures for ultrasonic monitoring of deep-tissue homeostasis
03-07 , doi: 10.1126/science.adk9880

黄秀娟团队Lancet子刊:SIM01合生制剂可改善长新冠

The Lancet Infectious Diseases[IF:36.4]

① 一项针对长新冠的随机、双盲、安慰剂对照试验中,463名患者分两组,接受合生制剂SIM01或安慰剂干预;② 6个月时,SIM01组在疲劳、记忆丧失、难以集中注意力、胃肠不适和总体不适等长新冠症状的改善方面,显著优于安慰剂组,且安全性良好;③ 相较于安慰剂组,SIM01组的肠道菌群发生了有益变化,如细菌多样性增加、SCFA生成途径上调、抗生素抗性基因减少;④ 使用SIM01、感染奥密克戎株、新冠前接种疫苗、新冠轻症,均为症状缓解的预测因素。

A synbiotic preparation (SIM01) for post-acute COVID-19 syndrome in Hong Kong (RECOVERY): a randomised, double-blind, placebo-controlled trial
2023-12-07 , doi: 10.1016/S1473-3099(23)00685-0

Cell子刊:AI助力大肠癌检测再取新进展

Cancer Cell[IF:48.8]

① 使用转换器基于人工智能的生物标志物(微卫星不稳定性(MSI)、BRAF(一种基因) 和 KRAS(一种基因))预测;② MSI预测在结直肠癌活检中达到临床级表现;③ 基于转换器的生物标志物预测具有更好的泛化能力并且数据效率更高;④ 该模型可预测KRAS,AUROCs等多种CRC常规诊断相关的生物标志物;⑤ 对16个大肠癌队列的13000多名患者进行培训评估,预测外科切除标本上微卫星不稳定性的敏感度为99%,阴性预测值超过99%。

Transformer-based biomarker prediction from colorectal cancer histology: A large-scale multicentric study
2023-08-30 , doi: 10.1016/j.ccell.2023.08.002

Nature子刊:使用Stabl发现稀疏、可靠的组学生物标志物

Nature Biotechnology[IF:33.1]

① Stabl是一种有监督机器学习框架,将噪声注入和数据驱动的信噪比阈值集成到多变量预测建模中,识别一组稀疏、可靠的生物标志物;② 在合成数据集和五项独立的临床研究上测试,与常用的稀疏促进正则化方法相比,Stabl可提高生物标志物的稀疏性和可靠性,同时保持预测性能;③ Stabl可扩展到多组学整合任务,能够对复杂的预测模型进行生物学解释;④ Stabl提供了一个强大的机器学习管道,有望在所有组学数据中推广。

Discovery of sparse, reliable omic biomarkers with Stabl
01-02 , doi: 10.1038/s41587-023-02033-x

粪菌移植或可改善造血干细胞移植和白血病化疗患者的肠道菌群失调

Journal of Clinical Oncology[IF:42.1]

① 两个独立队列分别纳入异基因造血细胞移植(HCT)患者74例、接受化疗的急性髓系白血病(AML)患者26例,2:1随机分组至口服胶囊粪菌移植(FMT)治疗和安慰剂组,3个月内最多治疗3次,评估4个月时的全因感染率;② HCT和AML队列中,FMT组与对照组在4个月时的感染密度均无显著差异(0.74 vs. 0.91,0.93 vs. 1.25 例/100患者-天);③ 较安慰剂,FMT改善抗生素导致的肠道菌群多样性破坏,恢复多种厌氧菌丰度并降低肠球菌属、链球菌属的丰度。

Randomized Double-Blind Phase II Trial of Fecal Microbiota Transplantation Versus Placebo in Allogeneic Hematopoietic Cell Transplantation and AML
2023-05-26 , doi: 10.1200/JCO.22.02366

AI提升结肠癌化疗用药准确性

Journal of Clinical Oncology[IF:42.1]

① 匹兹堡大学鲁兴华和孙旻教授与团队训练了一个名为COLOXIS的AI模型,用来预测结肠癌患者对奥沙利铂的反应;② 在1065名患者中,有526名被预测为COLOXIS+(奥沙利铂响应者),而539名被预测为COLOXIS-(非响应者),COLOXIS+组的病人显著受益于奥沙利铂,而COLOXIS-组的病人则不受益;③ 建议在结直肠癌辅助治疗中仅对COLOXIS+患者使用奥沙利铂,但需要进一步验证;④ COLOXIS可以让约半数接受辅助治疗的结肠癌患者避免不必要的奥沙利铂诱发的毒副作用,并大幅度提高总体获益风险比;⑤ COLOXIS是目前唯一用逾一千病人的大规模的临床试验数据证明化疗药物疗效可以用AI的方法来推算的模型,证实了用AI指导化疗药物的可行性。

Machine Learning Predicts Oxaliplatin Benefit in Early Colon Cancer
02-05 , doi: 10.1200/JCO.23.01080

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仁济医院NEJM:治疗小肠血管发育不良反复出血,沙利度胺疗效显著

New England Journal of Medicine[IF:96.2]

① 开展一项多中心、双盲、随机、安慰剂对照试验,共150名小肠血管发育不良(SIA)反复出血患者被分配接受沙利度胺或安慰剂治疗4个月,评估沙利度胺对SIA反复出血的疗效和安全性;② 其中,51人和49人被随机分配到100 mg和50 mg沙利度胺组,50人被分配到安慰剂组;③ 100 mg和50 mg沙利度胺组及安慰剂组有效缓解率为68.6%、51.0%和16.0%;④ 沙利度胺组不良事件发生率高于安慰剂组,如便秘、嗜睡、肢体麻木、外周水肿、头晕和肝酶水平升高。

Thalidomide for Recurrent Bleeding Due to Small-Intestinal Angiodysplasia
2023-11-02 , doi: 10.1056/NEJMoa2303706

国内团队JAMA:信迪利单抗联合化疗用于胃癌和胃食管交界腺癌

JAMA[IF:63.1]

① 在中国62家医院共纳入650例患有无法切除的局部晚期或转移性胃或胃食管交界癌患者进行信迪利单抗或安慰剂联合XELOX方案治疗;② 在所有随机患者中,与安慰剂相比,信迪利单抗将总生存期中位数从12.3个月提高到15.2个月;③ 61.1%患者的肿瘤PD-L1联合阳性评分大于等于5,在这些患者中信迪利单抗将总生存期中位数从12.9个月提高到18.4个月;④ 与治疗相关最多的不良事件是血小板计数减少、中性粒细胞计数减少和贫血。

Sintilimab Plus Chemotherapy for Unresectable Gastric or Gastroesophageal Junction Cancer - The ORIENT-16 Randomized Clinical Trial
2023-12-05 , doi: 10.1001/jama.2023.19918

中山大学Nature子刊:创新三联疗法——治疗MSS/pMMR结直肠癌的新策略

Nature Medicine[IF:58.7]

① 中山大学的王峰和徐瑞华团队合作发表文章,发现在不可切除的化疗难治性局部晚期或转移性微卫星稳定/错配修复功能正常(MSS/pMMR)结直肠癌患者中,联合使用PD-1抗体sintilimab、HDAC抑制剂chidamide以及VEGF抗体bevacizumab是非常具有潜力的治疗方案;② 48名患者分配到双联组(anti-PD1+HDACi,n=23)或三联组(n=25),三联组比双联组在18周无进展生存率(64.0% vs 21.7%)、总体响应率(44.0% vs 13.0%)和中位无进展生存期(7.3个月 vs 1.5个月)均显著改善;③ 最常见的治疗相关不良事件包括蛋白尿、血小板减少、中性粒细胞减少、贫血、白细胞减少和腹泻,有两例与治疗相关的死亡事件(肝功能衰竭和肺炎);④ 三联组增强CD8+ T细胞的浸润,导致更具免疫活性的肿瘤微环境。

Combined anti-PD-1, HDAC inhibitor and anti-VEGF for MSS/pMMR colorectal cancer: a randomized phase 2 trial
03-04 , doi: 10.1038/s41591-024-02813-1

国内外合作Science:新型生物材料助力胃肠道术后监测

Science[IF:44.7]

① 胃肠道手术后的吻合口漏可危害患者健康甚至生命,其早期检测仍是挑战,清华大学王禾翎与国外团队合作的这项研究开发了一种生物可吸收、形状自适应的材料结构(BioSUM),以实现对深部组织稳态的常规超声监测;② BioSUM由分布在pH响应性水凝胶中的生物可吸收的微小金属盘组成,可通过手术植入或注射方式置于监测部位,金属盘间距的变化可反映该部位的pH变化,可在超声图像中测量;③ 在大鼠和猪模型中,BioSUM成功检测到胃、小肠和胰腺的泄漏,表现出对pH变化的敏感性和特异性;④ BioSUM在体内能自然分解吸收,无需二次手术取出,有望用于术后胃肠道吻合口漏的早期监测。

Bioresorbable shape-adaptive structures for ultrasonic monitoring of deep-tissue homeostasis
03-07 , doi: 10.1126/science.adk9880

黄秀娟团队Lancet子刊:SIM01合生制剂可改善长新冠

The Lancet Infectious Diseases[IF:36.4]

① 一项针对长新冠的随机、双盲、安慰剂对照试验中,463名患者分两组,接受合生制剂SIM01或安慰剂干预;② 6个月时,SIM01组在疲劳、记忆丧失、难以集中注意力、胃肠不适和总体不适等长新冠症状的改善方面,显著优于安慰剂组,且安全性良好;③ 相较于安慰剂组,SIM01组的肠道菌群发生了有益变化,如细菌多样性增加、SCFA生成途径上调、抗生素抗性基因减少;④ 使用SIM01、感染奥密克戎株、新冠前接种疫苗、新冠轻症,均为症状缓解的预测因素。

A synbiotic preparation (SIM01) for post-acute COVID-19 syndrome in Hong Kong (RECOVERY): a randomised, double-blind, placebo-controlled trial
2023-12-07 , doi: 10.1016/S1473-3099(23)00685-0

国内团队:益生菌SsK12可减轻头颈癌放疗后的口腔粘膜炎

Journal of Clinical Oncology[IF:42.1]

① 华西口腔医院的徐欣团队发表的一项临床研究结果,在接受放疗的头颈癌患者中,口服唾液链球菌K12(SsK12)可显著减少严重口腔黏膜炎(SOM)的发生率、持续时间,并延缓SOM的发生时间;② 160名接受放疗的头颈癌患者1:1分组,分别口服SsK12或安慰剂;③ SsK12组的SOM发生率显著低于安慰剂组(36.6% vs. 54.2%),SOM持续时间显著缩短,SOM发生时间显著延迟;④ 两组的不良事件相似,SsK12益生菌可抑制条件致病菌,并富集口腔共生菌群;⑤ SsK12有望成为减轻头颈癌放疗患者的口腔黏膜炎症状的有效手段。

Streptococcus salivarius K12 Alleviates Oral Mucositis in Patients Undergoing Radiotherapy for Malignant Head and Neck Tumors: A Randomized Controlled Trial
01-12 , doi: 10.1200/JCO.23.00837

北航团队:新型电子绷带促进肠道伤口愈合

Nature Electronics[IF:33.7]

① 北京航空航天大学生物与医学工程学院常凌乾和王柳、宾夕法尼亚州立大学余存江与团队发表研究,开发了一种软性可生物降解的自供电电子绷带,通过双重电刺激加速肠道伤口愈合;② 该电子绷带利用脉冲电刺激促进上皮细胞的电转染,提高愈合因子(如上皮生长因子)的表达,利用直流电刺激增强转染细胞的愈合因子分泌;③ 该电子绷带在体外对肠上皮细胞具有高转染效率和细胞活性,能在术中期提升上皮生长因子的表达;④ 与传统缝合治疗和单一电刺激的电子绷带相比,该电子绷带能显著加快小鼠肠道伤口的愈合速度。

Accelerated intestinal wound healing via dual electrostimulation from a soft and biodegradable electronic bandage
03-29 , doi: 10.1038/s41928-024-01138-8

翟齐啸+张家超+黄适Cell子刊:益生菌如何改善便秘?锁定菌株特异性背后的关键遗传因子

Cell Host and Microbe[IF:20.6]

① 构建长双歧杆菌(Bl)库,结合小鼠实验和细菌基因组分析,发现改善功能性便秘(FC)的Bl菌株,特异性携带能增强细菌利用阿拉伯聚糖的abfA基因簇;② abfA介导了Bl对小鼠FC的疗效,其作用依赖于膳食阿拉伯聚糖;③ 一项双盲随机对照试验中,补充携带abfA的Bl菌株(而非abfA缺陷菌株)可富集利用阿拉伯聚糖的肠菌,增加有益代谢物,改善FC症状;④ 多个队列分析表明,菌群中的abfA丰度可预测FC;⑤ 移植富含abfA的人类粪菌可改善FC无菌小鼠的症状。

A key genetic factor governing arabinan utilization in the gut microbiome alleviates constipation
2023-11-21 , doi: 10.1016/j.chom.2023.10.011

秦环龙/许谦/李宁Cell子刊:供受体微生物亚种水平的相互作用或是菌群移植疗法成败的关键因素

Cell Host and Microbe[IF:20.6]

① 同济大学医学院上海第十人民医院秦环龙、许谦、李宁团队利用物种基因组分箱(SGB)技术,研究接受粪菌移植(FMT)治疗的29名伴有胃肠症状的自闭症谱系障碍(ASD)儿童的亚种水平菌群动态;② FMT对患有胃肠道合并症的ASD儿童有效;③ 供-受体间的SGB匹配意味着菌株转移的可能性很高;④ 供-受体的微生物间相互作用对亚种转移和积极的临床结果至关重要;⑤ 相关的供-受体SGB配对,通常在系统发育上有较大差异,且包含很多未命名微生物;⑥ 以上菌群动态也出现在包含多种疾病的FMT数据集中;⑦ 本研究为决定FMT成功的微生物相互作用和动态提供了详细见解。

Donor-recipient intermicrobial interactions impact transfer of subspecies and fecal microbiota transplantation outcome
02-12 , doi: 10.1016/j.chom.2024.01.013

姜卫红等Nature子刊:阿卡波糖降糖不给力,肠菌干了啥坏事?

Nature Metabolism[IF:18.9]

① 纳入393名接受阿卡波糖治疗的2型糖尿病患者;② 收集对阿卡波糖反应最低的患者的粪便样本,鉴定出一种人体肠道中降解阿卡波糖的细菌为Klebsiella grimontii TD1(TD1);③ TD1丰度在对阿卡波糖反应较低的患者中富集,且随着阿卡波糖治疗时间而增加;④ 糖尿病小鼠模型中,TD1处理可抑制阿卡波糖的降血糖效果;⑤ TD1中鉴定出一种广泛分布于肠道菌群且可降解阿卡波糖的葡萄糖苷酶Apg,将阿卡波糖降解为小分子并失去抑制剂功能。

Inactivation of the antidiabetic drug acarbose by human intestinal microbial-mediated degradation
2023-05-08 , doi: 10.1038/s42255-023-00796-w

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