《热心肠日报》2023-2024年度榜单 | 全球肠道菌群研究十大人物

热心肠研究院榜单

热心肠小伙伴们 2024-05-30

本篇发布“全球肠道菌群研究十大人物”。

过去的一年里，全球肠道领域的研究成果颇丰，取得了许多令人瞩目的进展。2024年热心肠大会之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2023年5月以来的一年期间（2023年5月1日至2024年4月30日）发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2023-2024年度榜单。

此次榜单评选涵盖了3240篇发表在363个不同期刊上的研究文献，累计影响因子达到75058.51，平均影响因子为23.17。其中，发表在Cell、Nature、Science上的文章有153篇，发表在NEJM、Lancet、JAMA上的文章有46篇。

本榜单仅代表热心肠生物技术研究院基于自身数据所做的评选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。

本篇发布“全球肠道菌群研究十大人物”。

于君

香港中文大学

于君教授团队在过去20多年中，长期致力于消化系统肿瘤机制和防治研究，旨在揭示微生物在结直肠癌、胃癌、肝癌等肿瘤中的作用。过去一年中，她与团队在Cell发表重磅研究，发现了新的促胃癌细菌并揭示了其致病机制；此外，她还带领团队在高影响力期刊发表了多项肠道微生物与消化系统肿瘤的研究，为靶向微生物改善癌症治疗提供了新策略。

2023-2024代表性文章

Streptococcus anginosus promotes gastric inflammation, atrophy, and tumorigenesis in mice

Cell. 2024 Feb 15;187(4):882-896.e17.

doi: 10.1016/j.cell.2024.01.004

【日报解读】于君/沈祖尧等Cell：咽峡炎链球菌——新的促胃癌菌

Carnobacterium maltaromaticum boosts intestinal vitamin D production to suppress colorectal cancer in female mice

Cancer Cell. 2023 Aug 14;41(8):1450-1465.e8.

doi: 10.1016/j.ccell.2023.06.011.

【日报解读】于君等Cell子刊：麦芽香肉杆菌抑制雌性小鼠的大肠癌

Traditional Medicine Pien Tze Huang Suppresses Colorectal Tumorigenesis through Restoring Gut Microbiota and Metabolites

Gastroenterology. 2023 Dec;165(6):1404-1419.

doi: 10.1053/j.gastro.2023.08.052.

【日报解读】于君团队：中药片仔癀通过恢复肠道菌群和代谢物抑制结直肠肿瘤的发生

Parabacteroides distasonis uses dietary inulin to suppress NASH via its metabolite pentadecanoic acid

Nat Microbiol. 2023 Aug;8(8):1534-1548.

doi: 10.1038/s41564-023-01418-7.

【日报解读】于君团队Nature子刊：菊粉改善小鼠脂肪肝炎，关键有益菌和代谢物被锁定

Bifidobacterium pseudolongum-generated acetate suppresses non-alcoholic fatty liver disease-associated hepatocellular carcinoma

J Hepatol. 2023 Dec;79(6):1352-1365.

doi: 10.1016/j.jhep.2023.07.005.

【日报解读】于君团队：假长双歧杆菌产生乙酸，或可预防脂肪肝相关肝癌

Roseburia intestinalis generated butyrate boosts anti-PD-1 efficacy in colorectal cancer by activating cytotoxic CD8+ T cells

Gut. 2023 Nov;72(11):2112-2122.

doi: 10.1136/gutjnl-2023-330291.

【日报解读】于君+黄曦等：肠罗斯氏菌或可增强大肠癌免疫治疗

Dennis L Kasper

哈佛大学医学院

Dennis Kasper教授团队在过去的40多年中，在微生物学、免疫学、传染病和公共卫生领域等方面开展研究。近年来他和团队致力于探索肠道菌群与免疫系统间的相互作用，特别是菌群及其成分在免疫发育、成熟和调控中的作用，以及用于治疗自身免疫疾病和感染性疾病的菌群疗法，并取得了颇多成果。过去一年里，Kasper教授团队在Nature和Cell发表3项研究，推进了对于肠道菌群在肿瘤免疫治疗、肠道免疫中的作用的认知。

2023-2024代表性文章

Targeting PD-L2–RGMb overcomes microbiome-related immunotherapy resistance

Nature. 2023 May;617(7960):377-385.

doi: 10.1038/s41586-023-06026-3.

【日报解读】Nature：增强癌症免疫治疗，在菌群中找到新答案

Gut microbial fatty acid isomerization modulates intraepithelial T cells

Nature. 2023 Jul;619(7971):837-843.

doi: 10.1038/s41586-023-06265-4.

【日报解读】宋昕阳等Nature：新机制！肠菌通过脂肪酸异构化，调节肠道免疫细胞

Gut complement induced by the microbiota combats pathogens and spares commensals

Cell. 2024 Feb 15;187(4):897-913.e18.

doi: 10.1016/j.cell.2023.12.036.

【日报解读】Cell：受肠菌调控的肠道补体系统，抵抗病原体，不伤共生菌

Pieter C Dorrestein

加州大学圣迭戈分校

Pieter Dorrestein教授团队的研究旨在开发基于质谱的新方法，以了解微生物、宿主相关微生物组及其生态位的化学性质。他们近期的研究方向包括利用质谱知识了解微生物组、代谢组、微生物-微生物、微生物-免疫细胞、微生物-宿主相互作用等。今年，Dorrestein教授团队在Nature和Cell发表研究，在肠道菌群相关的胆汁酸研究方面取得了瞩目成果。

2023-2024代表性文章

Reverse metabolomics for the discovery of chemical structures from humans

Nature. 2024 Feb;626(7998):419-426.

doi: 10.1038/s41586-023-06906-8.

【日报解读】Nature：反向代谢组学方法，挖掘IBD新线索

The underappreciated diversity of bile acid modifications

Cell. 2024 Mar 28;187(7):1801-1818.e20.

doi: 10.1016/j.cell.2024.02.019.

【日报解读】Cell：超大数据资源库揭示胆汁酸多样性

microbeMASST: a taxonomically informed mass spectrometry search tool for microbial metabolomics data

Nat Microbiol. 2024 Feb;9(2):336-345.

doi: 10.1038/s41564-023-01575-9.

【日报解读】Nature子刊：微生物代谢物质谱搜索工具microbeMASST

姜长涛

北京大学基础医学院

姜长涛教授团队致力于研究肠道微生物与代谢性疾病的发病机制，揭示了代谢性疾病的肠道菌群及其代谢物（如胆汁酸）特征图谱，发现了多个代谢性疾病干预的新靶标，并研发出一系列可用于治疗代谢性疾病的生物制剂和候选药物。过去一年里，姜长涛教授作为共同通讯作者在Science和Cell等期刊发表重要工作，首创肠道菌源宿主同工酶的新概念，并发现降解尼古丁的肠道共生菌，为靶向肠道微生物改善代谢性疾病提供了新视角。

2023-2024代表性文章

Microbial-host-isozyme analyses reveal microbial DPP4 as a potential antidiabetic target

Science. 2023 Aug 4;381(6657):eadd5787.

doi: 10.1126/science.add5787.

【日报解读】姜长涛/乔杰/雷晓光/王广等Science：菌源同工酶为改善糖尿病提供新靶点

Gut symbionts alleviate MASH through a secondary bile acid biosynthetic pathway

Cell. 2024 Apr 22;187(11):2717-2734.e33.

doi: 10.1016/j.cell.2024.03.034.

【日报解读】姜长涛/乔杰/庞艳莉/郑明华/贾彦兴等Cell：肠菌新型次级胆汁酸或可改善脂肪性肝炎

Gut commensal Christensenella minuta modulates host metabolism via acylated secondary bile acids

Nat Microbiol. 2024 Feb;9(2):434-450.

doi: 10.1038/s41564-023-01570-0.

【日报解读】刘双江/刘宏伟/姜长涛Nature子刊：小克里斯滕森氏菌生成新型胆汁酸，改善代谢

乔杰

北京大学第三医院

中国工程院院士

乔杰院士的研究主要集中在妇产科及生殖健康领域。她与团队在肠道菌群与生殖内分泌疾病（如多囊卵巢综合征）方面的研究取得了多项重要成果。过去一年中，乔杰院士作为共同通讯作者在Science和Cell发表研究，揭示了肠道菌群在代谢性疾病中的新机制。

2023-2024代表性文章

Microbial-host-isozyme analyses reveal microbial DPP4 as a potential antidiabetic target

Science. 2023 Aug 4;381(6657):eadd5787.

doi: 10.1126/science.add5787.

【日报解读】姜长涛/乔杰/雷晓光/王广等Science：菌源同工酶为改善糖尿病提供新靶点

Gut symbionts alleviate MASH through a secondary bile acid biosynthetic pathway

Cell. 2024 Apr 22;187(11):2717-2734.e33.

doi: 10.1016/j.cell.2024.03.034.

【日报解读】姜长涛/乔杰/庞艳莉/郑明华/贾彦兴等Cell：肠菌新型次级胆汁酸或可改善脂肪性肝炎

Michael Fischbach

斯坦福大学

Michael Fischbach教授团队致力于解析宿主-菌群的相互作用，主要专注于两个研究领域：技术发展（涉及合成生物学、细菌遗传学工具、算法和计算工具等）以及分子机制（包括菌群小分子、复杂群落的生态学等）。他和团队在过去一年中在Cell和Nature分别发表重要研究成果，基于他们团队前期构建的组成明确且高度复杂的合成人类肠道菌群模型，研究了肠道菌群的微生物生态学，并在菌株水平上绘制了肠菌特异性T细胞反应图谱。

2023-2024代表性文章

Strain dropouts reveal interactions that govern the metabolic output of the gut microbiome

Cell. 2023 Jun 22;186(13):2839-2852.e21.

doi: 10.1016/j.cell.2023.05.037.

【日报解读】Cell：有同样特定功能的菌株，对群落的影响可能有很大差异

Mapping the T cell repertoire to a complex gut bacterial community

Nature. 2023 Sep;621(7977):162-170.

doi: 10.1038/s41586-023-06431-8.

【日报解读】Nature：菌株水平的肠菌特异性T细胞反应图谱

Noah Palm

耶鲁大学医学院

Noah Palm教授团队专注于阐明免疫系统和肠道菌群在健康和疾病中的各种相互作用，特别强调开发新技术，以解开复杂的宿主-菌群通讯网络，并揭示菌群在人类健康和疾病中的因果作用。过去一年中，他们在Cell和Nature发表重要研究成果，通过开发新技术，绘制了人体和菌群代谢物与G蛋白偶联受体的互作图谱，并首次在蛋白质组水平上大规模评估了人类外蛋白组与微生物组之间的相互作用。

2023-2024代表性文章

Highly multiplexed bioactivity screening reveals human and microbiota metabolome-GPCRome interactions

Cell. 2023 Jul 6;186(14):3095-3110.e19.

doi: 10.1016/j.cell.2023.05.024.

【日报解读】陈海威等Cell：新技术！绘制人体/菌群代谢物与GPCR的互作图谱

A host-microbiota interactome reveals extensive transkingdom connectivity

Nature. 2024 Apr;628(8006):171-179.

doi: 10.1038/s41586-024-07162-0.

【日报解读】Nature：新方法！大规模揭示人体与菌群的跨界互作连接

Ramnik Xavier

哈佛医学院麻省总医院

哈佛-麻省理工博德研究所

Ramnik Xavier教授在美国哈佛大学医学院、麻省总医院和哈佛-麻省理工博德研究所（Broad Institute）等机构均担任重要研究职务。他带领团队主要研究肠道微生物组与免疫系统之间的相互作用及其对炎症性肠病和其他疾病的影响，利用多组学技术，包括基因组学、转录组学和代谢组学，深入解析微生物与宿主的互作机制。今年Xavier教授团队在Cell发表重要工作，鉴定出对心血管健康有潜在益处的能代谢胆固醇的肠道细菌。

2023-2024代表性文章

Gut microbiome and metabolome profiling in Framingham heart study reveals cholesterol-metabolizing bacteria

Cell. 2024 Apr 11;187(8):1834-1852.e19.

doi: 10.1016/j.cell.2024.03.014.

【日报解读】Cell：肠道菌群+代谢组分析，揭示出代谢胆固醇的肠菌

Linking microbial genes to plasma and stool metabolites uncovers host-microbial interactions underlying ulcerative colitis disease course

Cell Host Microbe. 2024 Feb 14;32(2):209-226.e7.

doi: 10.1016/j.chom.2023.12.013.

【日报解读】Cell子刊：新方法揭示结肠炎病程相关的宿主-肠菌互作

Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan

Nat Microbiol. 2023 Jun;8(6):1064-1078.

doi: 10.1038/s41564-023-01370-6.

【日报解读】Nature子刊：百岁老人肠道病毒群或可助其抵抗病原体

Absence of a pancreatic microbiome in intraductal papillary mucinous neoplasm

Gut. 2024 Mar 1:gutjnl-2023-331012.

doi: 10.1136/gutjnl-2023-331012.

【日报解读】罕见胰腺肿瘤IPMN中不存在菌群

Kerwyn Casey Huang

斯坦福大学

Kerwyn Casey Huang教授团队致力于研究细菌增殖的机制，旨在揭示细菌生长的物理规则并应用于合成生物学。他们的研究涵盖培养体外群落以建立菌群模型、细菌细胞壁生长建模、细菌生长的空间模式、肠道微生物组的空间组织、活细菌的单分子成像等方向。Huang教授团队与合作者去年在Nature发表研究，开发了可在正常生理状态下从受试者特定肠段取样的可吞咽胶囊设备，为进一步研究肠道微生物组和代谢组在人类生理和疾病中的作用提供了有力工具。

2023-2024代表性文章

Profiling the human intestinal environment under physiological conditions

Nature. 2023 May;617(791):581-591.

doi: 10.1038/s41586-023-05989-7.

【日报解读】Nature：采样胶囊助力人类肠道多组学分析

Resource competition predicts assembly of gut bacterial communities in vitro

Nat Microbiol. 2024 Apr;9(4):1036-1048.

doi: 10.1038/s41564-024-01625-w.

【日报解读】Nature子刊：资源竞争预测体外模型中肠道菌群的组装

Itzhak Mizrahi

以色列内盖夫本古里安大学

Itzhak Mizrahi教授团队研究微生物基因组进化和生态互动，特别关注肠道环境。他们运用深度测序、大数据分析、代谢组学等技术，研究微生物群落的组装动态和水平基因转移（HGT）。该团队重点研究瘤胃微生物群，通过了解微生物间的生态互动来优化功能效率，以改善健康、疾病和农业系统。他与团队今年在Science发表的研究，系统性分析了人类和不同动物肠道中分解纤维素的瘤胃球菌。

2023-2024代表性文章

Cryptic diversity of cellulose-degrading gut bacteria in industrialized humans

Science. 2024 Mar 15;383(6688):eadj9223.

doi: 10.1126/science.adj9223.

【日报解读】Science：降解纤维素的人类肠菌

Plasmid-encoded toxin defence mediates mutualistic microbial interactions

Nat Microbiol. 2024 Jan;9(1):108-119.

doi: 10.1038/s41564-023-01521-9.

【日报解读】Nature子刊：质粒编码防御蛋白，抵抗毒素