提示：下述文章点击中文标题可直达热心肠日报，点击英文标题可访问论文官网。
Cell[IF:64.5]
① 抗生素的滥用和耐药性细菌的出现使得噬菌体疗法的研究重新活跃地来，其可联合抗生素使用；② 噬菌体分为裂性或温和性噬菌体，广泛存在各种环境，有宿主特异性和长进化跨度；③ 噬菌体特性需被解析并考虑其制备安全性、纯度、效价、一致性、给药途径和副作用，并被实时监管；④ 利用天然噬菌体存在潜在障碍，需利用基因组工程和合成基因组学设计新噬菌体；⑤ 噬菌体疗法可应用于医疗、兽医和畜牧业和环境等领域，但使用规范和效果仍需被标准化。
Phage therapy: From biological mechanisms to future directions
2023-01-05 , doi: 10.1016/j.cell.2022.11.017
Cell[IF:64.5]
① 由微生物生产的食品（微生物食品）包括微生物生物质、发酵食品以及细胞工厂；② 微生物食品可在营养等层面改善人群健康，又可以通过减少碳排放等改善环境，从而促进人和自然可持续健康发展；③ 挖掘微生物的生物多样性可提供新的潜在食品来源；④ 科学驱动的发酵方法和合成生物学技术，将为研发下一代微生物食品提供助力；⑤ 一些废料（如豆渣）可作为微生物发酵底物，有助于提高食品系统效率；⑥ 微生物食品正在蓬勃发展，但仍面临多项挑战。
Microbial foods for improving human and planetary health
2023-01-18 , doi: 10.1016/j.cell.2022.12.002
Cell[IF:64.5]
① 使用循环免疫荧光及多重成像技术，对肿瘤样本约1亿个细胞进行成像和分析，发现即使是单一肿瘤，也具备不同分区，其中有些侵袭性更强，有些则更弱；② 除肿瘤本身存在内部差异，免疫系统在单个肿瘤内部及不同肿瘤间的变化也很大；③ 负责抗击癌症的T细胞功能通常会被抑制，但其实与肿瘤无关，抑制根源可能与微环境中其他免疫细胞有关；④ 3D成像还发现一类特殊结构（黏蛋白池），黏蛋白池间存在各种通道连接，其中有些是突起状的癌细胞。
Multiplexed 3D atlas of state transitions and immune interaction in colorectal cancer
2023-01-19 , doi: 10.1016/j.cell.2022.12.028
Cell[IF:64.5]
① 开发一种基于液滴的细菌单细胞RNA测序技术——BacDrop；② BacDrop通过rRNA耗竭和组合条码等设计，可一次检测数千到数百万个细菌细胞，对革兰氏阳性和阴性菌均适用；③ 用BacDrop分析肺炎克雷伯菌的单个分离株在有/无抗生素扰动时的群落内异质性；④ 无抗生素时，群落内异质性主要由可移动遗传元件的表达所驱动；⑤ 暴露于抗生素使群落内出现异质性的应激反应，产生具有不同转录特征的、与不同表型结果（如耐受抗生素）相关的细菌亚群。
Bacterial droplet-based single-cell RNA-seq reveals antibiotic-associated heterogeneous cellular states
2023-01-27 , doi: 10.1016/j.cell.2023.01.002
Cell[IF:64.5]
① 在果蝇中筛选调节睡眠唤醒能力的基因，发现一条信号通路能将膳食蛋白质信息从肠道传至大脑，使动物睡眠时不易被机械振动唤醒；② 高蛋白饮食激活肠内分泌细胞，使其释放多肽CCHa1，CCHa1将信号传递给大脑中的一群多巴胺神经元，从而调节动物对振动的反应性；③ 果蝇和小鼠进食高蛋白食物可降低睡眠时对振动的敏感性，不易被唤醒；④ CCHa1途径和膳食蛋白质不影响对其他感觉输入的反应性（如热觉），说明不同的感觉模态由不同机制进行门控。
A gut-secreted peptide suppresses arousability from sleep
2023-03-22 , doi: 10.1016/j.cell.2023.02.022
Cell[IF:64.5]
① 小鼠模型中，口服的罗伊氏乳杆菌（Lr）可移位并持续定植于肿瘤内，以依赖于产IFNγ的CD8+ T细胞（Tc1）的方式增强局部抗肿瘤免疫和免疫检查点抑制剂（ICI）疗效；② Lr释放的色氨酸代谢物吲哚-3-甲醛（I3A）是该作用的充要条件，I3A通过激活CD8+ T细胞的AhR信号，促进转录因子CREB磷酸化，从而增强IFNγ生成等Tc1效应功能；③ 小鼠吃高色氨酸饮食可增强Lr和ICI诱导的抗肿瘤免疫；④ I3A在促进黑色素瘤患者的ICI应答和生存方面有潜在作用。
Dietary tryptophan metabolite released by intratumoral Lactobacillus reuteri facilitates immune checkpoint inhibitor treatment
2023-04-06 , doi: 10.1016/j.cell.2023.03.011
Cell[IF:64.5]
① 慢性压力加重小鼠肠道炎症，肠神经系统起关键介导作用；② 心理压力相关的长期糖皮质激素水平升高，促使肠神经胶质细胞产生一个炎症亚群，其通过分泌细胞因子CSF1促进单核细胞招募，后者生成TNF加剧肠道炎症；③ 糖皮质激素还使肠神经元中TGF-β2表达升高，致使不成熟的前体样神经元增多、成熟的氮能神经元和胆碱能神经元减少，从而引起肠道运动障碍；④ 在IBD患者群中验证了心理状态、肠道炎症和肠道运动障碍之间的联系。
The enteric nervous system relays psychological stress to intestinal inflammation
2023-05-25 , doi: 10.1016/j.cell.2023.05.001
Cell[IF:64.5]
① 开发一种用于鉴定药物-菌群关联的新计算方法PARADIGM， 用其分析接受异基因造血细胞移植（allo-HCT）癌症患者的纵向粪便菌群和用药记录数据；② 一些非抗生素药物，如泻药、止吐药和阿片类药物，与肠球菌属的相对丰度升高和菌群α-多样性降低相关；③ 用药物抗菌活性的体外测量数据检验了PARADIGM发现的药物-菌群关联；④ allo-HCT期间，菌种内的优势菌株的遗传趋同增加与抗生素相关；⑤ 药物-菌群关联可预测allo-HCT后的菌群轨迹和临床结果。
High-resolution analyses of associations between medications, microbiome, and mortality in cancer patients
2023-06-08 , doi: 10.1016/j.cell.2023.05.007
Cell[IF:64.5]
① 开发了高通量筛选平台PRESTO-Salsa，其基于mRNA条形码和NGS测序，能在96孔板单孔中评估314个GPCR的生物活性；② 用该方法筛选了GPCR组对1041种人类相关代谢物的活性，发现了新的内、外源性和微生物生成的GPCR激动剂；③ 绘制了人体5个部位菌群的435个菌株的微生物-GPCR互作图谱，揭示了菌群代谢物主要激活的GPCR类型以及菌株特异性的GPCR激动剂；④ 牙龈卟啉单胞菌分泌的蛋白酶Gingipain K通过K290位点特异性裂解作用激活CD97/ADGRE5。
Highly multiplexed bioactivity screening reveals human and microbiota metabolome-GPCRome interactions
2023-06-14 , doi: 10.1016/j.cell.2023.05.024
Cell[IF:64.5]
① 前端小肠的肠上皮细胞（IEC）中特异性积累GSDMD的13kD N端片段；② 该片段是由食物抗原诱导Caspase-3/7切割GSDMD的D88位点生成的；③ 不同于有细胞焦亡功能的30kD GSDMD片段，该13kD片段进入细胞核并诱导CIITA（MHCII的转录因子）和MHCII的表达，从而在前端小肠中诱导1型调节性T细胞（Tr1）；④ 用Caspase-3/7抑制剂处理的小鼠、无法产生该13kD片段的GSDMD突变鼠、IEC中敲除MHCII的小鼠、Tr1缺失的小鼠都呈现食物耐受缺陷。
Gasdermin D licenses MHCII induction to maintain food tolerance in small intestine
2023-06-15 , doi: 10.1016/j.cell.2023.05.027
Cell[IF:64.5]
① 对哈扎人、尼泊尔人和加州人的粪便样本（分别为351、56和12份）进行超深度宏基因组测序；② 获得了91,662个细菌、古菌、噬菌体和真核生物的基因组（哈扎人：83,044个），近半数是新发现的；③ 鉴定出63个和124个只存在于工业化和非工业化人群中的物种，二者富集不同的功能基因（如工业化相关物种富含氧化应激相关基因，可能反应了微生物对宿主炎症的适应）；④ 哈扎肠道微生物的复制率变化呈季节性循环，菌株共享模式与其独特的社会结构有关；⑤ 一种螺旋菌的传播模式反映了人类迁徙情况。
Ultra-deep sequencing of Hadza hunter-gatherers recovers vanishing gut microbes
2023-06-21 , doi: 10.1016/j.cell.2023.05.046
Cell[IF:64.5]
① 在含107个明确菌株的复杂菌群hCom1a中去掉占据胆汁酸7α-脱羧基生态位的唯二菌种（Cs和Ch，单独或同时去掉）；② ΔCsΔCh菌群无法生成次级胆汁酸，并特异性地重塑群落，8个菌株的相对丰度变化>100倍；③ 在ΔCs群落和ΔCh群落中，Ch和Cs能达到相似的相对丰度，且在胆汁酸转化的功能上表现相似；④ 但两个群落在胆汁酸之外的某些代谢表型上有明显差异：由于Cs间接抑制能代谢苯丙氨酸的生孢梭菌，ΔCs群落中该菌增加>1000倍，导致苯丙氨酸代谢产物丰度显著改变（PAGly减少，马尿酸等增多）。
Strain dropouts reveal interactions that govern the metabolic output of the gut microbiome
2023-06-22 , doi: 10.1016/j.cell.2023.05.037
Cell[IF:64.5]
① 许多肠菌都可在厌氧条件下代谢尿酸，将其转化为黄嘌呤、乳酸或短链脂肪酸（SCFAs）乙酸和丁酸；② 鉴定出在消耗尿酸的肠菌中广泛存的一个保守基因簇，其编码尿酸降解途径，能将尿酸转化为SCFAs；③ 缺乏尿酸酶的模型小鼠中，肠道菌群耗竭会导致严重的高尿酸血症，而定植消耗尿酸的肠菌可降低尿酸水平；④ 回顾性队列分析显示，使用靶向厌氧菌的抗生素与之后痛风患病风险升高相关。
A widely distributed gene cluster compensates for uricase loss in hominids
2023-08-03 , doi: 10.1016/j.cell.2023.06.010
Cell[IF:64.5]
① 相比普通人群，Piezo2缺陷个体会出现一系列胃肠道功能障碍（如肿块和水样便），但其中6名参与者报告未感觉到肠道的运动；② 动物模型发现移除感觉神经元的Piezo2后会加速小鼠胃排空和肠转运时间，且粪便中含水量也更高；③ 利用遗传和病毒工具来选择性地关闭两条神经通路中的Piezo2，发现背根神经节中的神经元会专门负责控制机体肠道的运动；④ 通过荧光成像技术，发现Piezo2能控制发生在整个胃肠道中的肠道运动，从尾部到小肠再到结肠。
PIEZO2 in somatosensory neurons controls gastrointestinal transit
2023-08-03 , doi: 10.1016/j.cell.2023.07.006
Cell[IF:64.5]
① 支配结肠的背根神经节（DRG）传入神经根据基因标志物可分为5个亚型（TrkB+, TH+, Sstr2+, Adra2a+, Bmpr1b+），在结肠中的末端形态各异；② 其中4个亚型具有机械敏感性，对结肠扩张具有不同的反应阈值和生理特性，共同覆盖扩张力度阈值空间；③ Bmpr1b+的Aδ-HTMR亚型的阈值最高，对结肠高度扩张引发的行为反应是必要且充分的，一定程度由机械感觉离子通道Piezo2介导；④ 在IBD模型中，该亚型介导了由炎症引起的对结肠扩张的过度行为反应。
DRG afferents that mediate physiologic and pathologic mechanosensation from the distal colon
2023-08-03 , doi: 10.1016/j.cell.2023.07.007
Cell[IF:64.5]
① 分析来自4个栖息地的2443只蝙蝠、啮齿类和鼩鼱的器官和粪便的宏转录组，发现了669种病毒，包括534种新病毒；② 揭示出野生小型哺乳动物携带的病毒在不同宿主和器官中的分布、多样性和演化、宿主间和跨物种传播，及相关的生态驱动因素；③ 宿主种类（目）和样本大小是影响病毒组组成和病毒溢出模式的关键因素；④ 鼩鼱携带的病毒种类最多，包括大量无脊椎动物相关病毒，且呈多器官分布；⑤ 啮齿类动物携带的病毒有最高的跨宿主物种传播潜力。
Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals
2023-09-20 , doi: 10.1016/j.cell.2023.08.029
Cell[IF:64.5]
① 开发了一种高度复用的质谱平台以及Trellis方法，对＞2500个结直肠癌患者衍生类器官（PDO）和癌相关成纤维细胞（CAF）培养物进行单细胞水平的药物反应分析；② 即使对于抵抗化疗的PDO，药物对细胞周期阻断和DNA损伤的作用都较普遍，但药物诱导的凋亡则较少见且有患者特异性，与细胞的翻译后修饰信号有关；③ CAF能调节PDO可塑性，将增殖型结肠干细胞（proCSC）转变为慢周期的再生结肠干细胞（revCSC），从而在化疗中保护癌细胞。
Trellis tree-based analysis reveals stromal regulation of patient-derived organoid drug responses
2023-12-07 , doi: 10.1016/j.cell.2023.11.005
Cell[IF:64.5]
① 对1107个结肠类器官的系统性单细胞分析揭示了受细胞内外信息（致癌突变和基质信号）调控的结肠干细胞（CSC）表型景观图谱；② 图谱两端分别是CLU+再生CSC（revCSC）和LRIG1+高增殖CSC（proCSC）；③ 成纤维细胞通过基质配体WNT3A和TGF-β1上调上皮YAP信号，使上皮细胞（EC）向revCSC极化；④ APC缺失和KRASG12D致癌突变及基质EGF/EREG则激活MAPK/PI3K信号，使EC向proCSC极化；⑤ APC缺失和KRASG12D共同阻断基质-上皮互作，将EC困在proCSC状态。
An oncogenic phenoscape of colonic stem cell polarization
2023-12-07 , doi: 10.1016/j.cell.2023.11.004
Cell[IF:64.5]
① 对31例人结直肠癌（CRC）样本进行空间多组学分析，将瘤内不同区域作为癌症演化中的快照，绘制个体化的CRC进展轨迹谱系生物地理学图谱；② 肿瘤演化可归为3种主要模型，且可将局部肿瘤区域定位到涉及染色体不稳定性（CIN+）途径和高突变（HM）途径的癌症进展伪时间线上；③ 发现一种沿CIN+途径进展的免疫排斥（IEX）特征（DDR1、TGFBI、PAK4和DPEP1上调），呈现出细胞毒性免疫的抑制，可预测患者不良预后。
Molecular cartography uncovers evolutionary and microenvironmental dynamics in sporadic colorectal tumors
2023-12-07 , doi: 10.1016/j.cell.2023.11.006
Cell[IF:64.5]
① 从工业化和非工业化人群中鉴定出副基体纲原生生物，揭示其多样性；② 在小鼠中发现副基体纲三毛滴虫属新物种（Tc），与此前研究的同属物种Tmu有不同的代谢特征；③ 代谢差异影响了Tc和Tmu的免疫调控作用：二者都能诱导小肠Th1/Th17，但由于只有Tmu能排出琥珀酸因而能诱导Th2免疫；④ 代谢差异还决定了二者在菌群中的生态位（Tc利用宿主黏液聚糖、Tmu偏好膳食纤维），影响与特定共生菌的跨界竞争；⑤ 调节膳食纤维组成可控制Tmu诱导的2型免疫。
Metabolic diversity in commensal protists regulates intestinal immunity and trans-kingdom competition
2023-12-13 , doi: 10.1016/j.cell.2023.11.018
Nature[IF:64.8]
① 分析全球9715个人类肠道和口腔菌群，在菌株水平分析菌群的人际传播规律；② 母婴间存在可观且稳定的肠道菌群垂直传递，1岁内菌株共享率（共享菌种中的相同菌株占比）约50%，之后降低，一些共享菌株可持续至老年；③ 口腔菌群以水平传播为主，同居可增强口腔菌株共享；④ 同居是微生物传播的重要驱动因素，同居者的肠道和口腔菌群的菌株共享率（中位数）分别为12%和32%，同居时长对菌株共享的影响高于年龄和遗传；⑤ 与菌种共享情况相比，菌株共享情况能更好地反映人群结构；⑥ 促进在宿主外生存的特定细菌性状可影响细菌传播性，对肠菌而言尤其明显。
The person-to-person transmission landscape of the gut and oral microbiomes
2023-01-18 , doi: 10.1038/s41586-022-05620-1
Nature[IF:64.8]
① db/db糖尿病小鼠多个代谢组织中丝氨酸和甘氨酸水平降低，丝氨酸从头合成受到限制；② 胰岛素抵抗或缺乏都可能导致糖尿病小鼠循环丝氨酸水平降低；③ 14周龄db/db小鼠热和触觉痛觉减退以及运动神经传导速度降低，表面丝氨酸稳态异常与糖尿病周围神经病变相关；④ 全身性丝氨酸低水平和高脂膳食的组合加速了小鼠周围神经病变的发展；⑤ 通过膳食补充剂使丝氨酸水平回归正常或用肉豆蔻素缓解血脂异常，均可缓解糖尿病小鼠的神经病变。
Insulin-regulated serine and lipid metabolism drive peripheral neuropathy
2023-01-25 , doi: 10.1038/s41586-022-05637-6
Nature[IF:64.8]
① 人类胎儿和产前宫内环境是否有稳定的菌群定植，仍有争议；② 从生殖生物学、微生物生态学、生物信息学、免疫学、临床微生物学和悉生生物学等角度，对近期关于胎儿菌群的多项研究进行重新评估；③ 现有数据不支持“正常/健康状态下的胎儿中有稳定而丰富的菌群定植”这一观点，检测到的微生物信号可能是污染所致；④ 这些结论对理解人类免疫发育有重要意义，并警示在开展低生物量（和无生物量）微生物分析时需将一些常见的方法缺陷纳入考虑。
Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies
2023-01-25 , doi: 10.1038/s41586-022-05546-8
Nature[IF:64.8]
① 四个政策可帮助实现蓝色食品对各国家食品系统的贡献：确保关键营养素的供应，提供陆地肉类的健康替代品，减少饮食环境足迹，及在不断变化的气候下保障蓝色食品对营养、经济和生计的贡献；② 评估了每个国家的政策目标的相关性，并在国家和国际范围内检查相关的共同利益和权衡；③ 促进蓝色食品的消费，可解决VB12和omega-3的缺乏；④ 通过适度消费对环境影响较小的海产品，可降低心血管疾病的发病率和反刍肉的大量温室气体足迹。
Four ways blue foods can help achieve food system ambitions across nations
2023-02-22 , doi: 10.1038/s41586-023-05737-x
Nature[IF:64.8]
① 响应化疗的胰腺癌（PDAC）患者血液中富集了肠道菌群的色氨酸代谢物3-IAA；② 移植响应者的菌群、高色氨酸饮食、口服3-IAA，均可增强化疗对人源化PDAC小鼠模型的疗效；③ 3-IAA通过中性粒细胞的髓过氧化物酶（MPO）（而非AhR信号）发挥这些作用；④ MPO氧化3-IAA，使其与化疗联用时引起活性氧（ROS）降解酶GPX3和GPX7下调，导致ROS积累和癌细胞自噬减少，从而损害癌细胞代谢适性、减少增殖；⑤ 在2个PDAC队列中，3-IAA水平与化疗疗效显著相关。
Microbiota-derived 3-IAA influences chemotherapy efficacy in pancreatic cancer
2023-02-22 , doi: 10.1038/s41586-023-05728-y
Nature[IF:64.8]
① 小鼠和细胞实验表明，高剂量摄入三氯蔗糖可减少CD8+和CD4+ T细胞的增殖，并抑制其向产IFNγ的谱系分化，从而产生免疫调节作用；② 机制上，三氯蔗糖选择性地影响T细胞的细胞膜，降低T细胞受体信号传导和胞内钙动员的效率；③ 服用高剂量三氯蔗糖，可降低皮下肿瘤模型和细菌感染模型小鼠的抗原特异性CD8+ T细胞应答，对抗肿瘤和抗感染有不良影响，但能够减轻1型糖尿病和结肠炎模型小鼠的T细胞介导的自身免疫反应。
The dietary sweetener sucralose is a negative modulator of T cell-mediated responses
2023-03-15 , doi: 10.1038/s41586-023-05801-6
Nature[IF:64.8]
① 在小鼠中增强或抑制肠嗜铬细胞（EC）细胞的功能表明，EC细胞促进对肠道扩张的内脏高敏性，并介导了异戊酸（ISV）的神经致敏作用；② EC细胞对内脏高敏性的影响有性别差异，雌鼠基础神经活动较高，故沉默EC细胞对雌鼠影响更大，而ISV对雄性的致敏作用更强；③ 长时间的EC细胞激活可导致持续的内脏高敏性；④ EC细胞信号作用于黏膜神经末梢从而影响内脏疼痛；⑤ 激活或沉默EC细胞均可诱导小鼠焦虑样行为，5-羟色胺信号在前者中起介导作用。
Gut enterochromaffin cells drive visceral pain and anxiety
2023-03-22 , doi: 10.1038/s41586-023-05829-8
Nature[IF:64.8]
① 通过冷冻电镜对肠拟杆菌噬菌体ΦcrAss001进行结构重建，并阐述1440个蛋白的功能；② 病毒粒子由二十面体衣壳和短且不可收缩的尾组成，衣壳内部双链DNA以左旋超螺旋方式存在，并导致六边形紧密堆积；③ 枪口蛋白在尾部末端形成六聚体，表现为未知的“粗褶皱”形式，可能是控制货物排出的守门人；④ 病毒粒子衣壳及异常尾部内存在广泛的货物蛋白存储空间，其中一种货物蛋白在两处同时存在；⑤ 货物蛋白在经过尾部挤出时部分展开以顺利喷射。
Structural atlas of a human gut crassvirus
2023-05-03 , doi: 10.1038/s41586-023-06019-2
Nature[IF:64.8]
① 小鼠中，与无菌和抗生素处理相比，肠道菌群可增强抗PD-1/PD-L1肿瘤免疫治疗；② 菌群通过降低树突细胞的PD-L2和CD8+ T细胞的RGMb（PD-L2的一个结合受体）的表达，来促进抗肿瘤免疫，共生肠菌Coprobacillus cateniformis可下调PD-L2也有相似效应；③ 在抵抗抗PD-1/PD-L1治疗的小鼠模型中（无菌/抗生素处理/定植不应答抗PD-1治疗的患者菌群），阻断PD-L2-RGMb通路（如抗PD-L2或抗RGMb抗体）与抗PD-1/PD-L1的联合治疗，可有效抑制肿瘤生长。
Targeting PD-L2–RGMb overcomes microbiome-related immunotherapy resistance
2023-05-03 , doi: 10.1038/s41586-023-06026-3
Nature[IF:64.8]
① 给果蝇喂食磷甲酸以抑制细胞对磷的吸收，发现缺乏无机磷酸盐（Pi）会导致消化道上皮细胞数量激增，当磷酸盐处于耗尽状态时，基因PXo表达也较低；② 通过抑制PXo表达或完全剔除该基因，出现与无机磷酸盐缺乏时相同的效果，提示PXo在磷酸盐运输中起关键作用；③ 免疫染色和超微结构分析发现PXo特异性地出现在一种以前未知的多层膜中，将其命名为PXo小体（一种新发现的细胞器）；④ PXo小体是胞浆Pi水平的关键调节因子，可以有效控制组织的再生和稳态。
A phosphate-sensing organelle regulates phosphate and tissue homeostasis
2023-05-03 , doi: 10.1038/s41586-023-06039-y
Nature[IF:64.8]
① 开发了一种可吞咽设备，能在正常消化过程中从人的特定肠道区域采样；② 收集15个健康人不同肠段240个肠道样本，多组学分析表明，肠道中的细菌、噬菌体、宿主蛋白和代谢物与粪便的有显著差异；③ 相较于粪便，肠道样本中的菌群多样性较低，特定微生物被差异性富集（优势菌），且原噬菌体诱导更为普遍；④ 宿主蛋白组和胆汁酸谱沿肠道变化，且与粪便很不同；⑤ 分析胆汁酸浓度梯度与肠菌丰度间的关联，表明特定肠菌通过去结合作用改变胆汁酸池；⑥ 肠菌介导生成的结合型胆汁酸的浓度变化模式呈现氨基酸特异性。
Profiling the human intestinal environment under physiological conditions
2023-05-10 , doi: 10.1038/s41586-023-05989-7
Nature[IF:64.8]
① 对899个单细胞克隆进行单细胞全基因组序列分析，确定1708长散在重复序列介导的逆转座事件（soL1Rs）；② soL1Rs与年龄正相关，在胚胎发育期有较高逆转座事件发生，指纹图谱发现34个逆转座原件L1；③ L1启动子去甲基化影响转录，其表观遗传变化主要发生在胚胎发育时期；④ 再甲基化不足的范围定位于rc-L1启动子，大多数L1转录本对正常细胞中的soL1R无效；⑤ soL1R可广泛插入基因组区域，具有靶位点的断点序列，可增加结直肠肿瘤发生。
Widespread somatic L1 retrotransposition in normal colorectal epithelium
2023-05-10 , doi: 10.1038/s41586-023-06046-z
Nature[IF:64.8]
① 人胶质母细胞瘤组织和细胞系的HLA II类分子提呈的抗原中包括来自细菌的肽，这些细菌肽可被患者的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）识别（反应较弱），并能诱导分泌促炎细胞因子；② 采用无偏倚的抗原发现方法表明，源自TIL的靶向胶质母细胞瘤新抗原的一个CD4+ T细胞克隆（TCC88）不仅能识别肿瘤衍生肽，对广泛的病原体和肠道菌群衍生的肽也有强烈反应；③ 这些微生物肽能在TIL甚至外周血记忆T细胞中引起针对肿瘤靶点的交叉反应性T细胞应答。
Microbial peptides activate tumour-infiltrating lymphocytes in glioblastoma
2023-05-17 , doi: 10.1038/s41586-023-06081-w
Nature[IF:64.8]
① 拟杆菌跨细菌外膜的聚糖摄取由SusCD蛋白复合物介导，该复合物包括膜底物桶和脂蛋白盖，在闭合和释放过程中促进底物结合和运输；② 表面暴露的糖结合蛋白和糖苷水解酶在捕获、处理和运输大的糖链中发挥关键作用；③ 添加底物时，果聚糖utilisome发生构象变化，揭示GHlev和SGBPlev底物结合状态，证明踏板仓运输机制在PUL所有OM定位成分存在时运作；④ 拟杆菌额外外膜成分聚集在核心SusCD转运器上形成稳定的糖类利用机器，被命名为utilisome。
Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes
2023-06-07 , doi: 10.1038/s41586-023-06146-w
Nature[IF:64.8]
① 肠道外肌层的常驻巨噬细胞（MMϕ）通过修剪突触和吞噬肠道神经元来完善生命早期的肠神经系统（ENS），断奶前耗竭MMϕ会破坏这一过程，导致肠道转运异常；② 断奶后，MMϕ获得神经支持性表型，伴随其转录组的变化和成熟；③ MMϕ有4个亚群，其相对丰度和分布随年龄变化，其中NA-MMϕ亚群呈现小胶质细胞样转录组特征；④ ENS通过产生TGF-β引导NA-MMϕ表型，NA-MMϕ亚群具有神经保护作用，其缺乏可引起肠道神经元丢失和肠道转运改变。
Dedicated macrophages organize and maintain the enteric nervous system
2023-06-14 , doi: 10.1038/s41586-023-06200-7
Nature[IF:64.8]
① 结直肠癌（CRC）动物模型及患有KRAS致癌突变（KRAS*）CRC的雄/男性具有更高转移率和更差结果；② KRAS*介导转录因子STAT4激活并上调Y染色体基因组蛋白去甲基化酶KDM5D的表达；③ KDM5D通过表观遗传抑制上皮细胞紧密连接调节因子AMOT，破坏紧密连接的完整性，降低细胞侵袭性；④ 同时，KDM5D通过抑制主要组织相容性复合物I抗原呈递，促进癌细胞在转移过程中逃避CD8+ T细胞的免疫监控。
Histone demethylase KDM5D upregulation drives sex differences in colon cancer
2023-06-21 , doi: 10.1038/s41586-023-06254-7
Nature[IF:64.8]
① 在乳腺癌小鼠中，转录因子MYC过表达导致mTORC1依赖的癌细胞“赢家”状态；② 低蛋白饮食激活肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的转录因子TFEB和TFE3及mTORC1，抑制癌细胞中的mTORC1信号传导，减少肿瘤生长；③ Rag GTP酶通过GTP酶激活蛋白GATOR1和FLCN感知膳食来源的胞质氨基酸，从而控制Rag GTP酶效应器，包括TFEB和TFE39；④ TAM中非典型吞噬介导的Rag GTP酶不依赖mTORC1信号通路，控制TAM与癌细胞间的竞争，或可成为癌症治疗的新靶点。
Reprogramming tumour-associated macrophages to outcompete cancer cells
2023-06-28 , doi: 10.1038/s41586-023-06256-5
Nature[IF:64.8]
① 饮食和菌群影响小鼠肠道的亚油酸（LA）异构体——共轭亚油酸（CLA）水平，CLA可诱导小肠CD4+CD8αα+上皮内淋巴细胞（IEL）；② 敲除肠菌的LA异构酶，可降低悉生小鼠的CD4+CD8αα+IEL数量；③ 机制上，CLA能在CD4+ IEL中结合并激活转录因子HNF4γ，从而促进细胞表达IL-18受体1，IL-18通过作用于该受体下调转录因子ThPOK，从而促进CD4+CD8αα+ IEL的分化；④ CLA-HNF4γ轴控制抗感染黏膜免疫，其缺陷会加剧小鼠的肠道病原菌感染。
Gut microbial fatty acid isomerization modulates intraepithelial T cells
2023-06-28 , doi: 10.1038/s41586-023-06265-4
Nature[IF:64.8]
① 结合单核RNA测序、单核染色质可及性测序、空间蛋白质组成像技术，在单细胞水平上绘制8个不同肠道区域的细胞组成、基因调控信息和空间分布图谱；② 肠道不同区域的细胞组成差异很大，有复杂的上皮亚型，并发现了潜在的新分泌细胞亚型；③ 绘制了大肠和小肠的空间层次结构网络图（细胞→邻区→群落→组织单位），揭示出不同细胞之间和多细胞结构之间的互作，突显了肠道中存在的不同免疫微环境；④ 鉴定出肠道不同区域的关键基因调控因子和肠细胞分化途径的差异，并将肠道疾病遗传性与特定细胞类型联系起来。
Organization of the human intestine at single-cell resolution
2023-07-19 , doi: 10.1038/s41586-023-05915-x
Nature[IF:64.8]
① 以益生菌EcN为底盘构建工程菌生物传感器，其编码基于重组酶的记录系统，能感应多种瞬时炎症标志物（如：NO、H2O2、连四硫酸盐、硫代硫酸盐）进而发光，并在小鼠和猪的肠道炎症模型中进行了验证；② 将上述工程菌与低功耗的定制电子读出电路（能将工程菌的光信号转换为无线信号）整合为可吞咽的细菌电子传感器胶囊（体积<1.4立方厘米），可通过智能手机等便携设备接收实时数据；③ 在活猪小肠中验证了该胶囊设备的功能。
Sub-1.4 cm3 capsule for detecting labile inflammatory biomarkers in situ
2023-07-26 , doi: 10.1038/s41586-023-06369-x
Nature[IF:64.8]
① 从健康人粪便中获得严格厌氧的普氏粪杆菌（Fp）菌株和一种脱硫弧菌（Dp）菌株的共培养物，二者为互养共生，Dp可利用Fp产生的乳酸生成乙酸，乙酸可供Fp生长并产生丁酸；② 采用逐步适应培养方法获得对氧气耐受的Fp菌株，将该菌株与Dp共培养，大幅提高了Fp产量，其菌剂可进行冷冻干燥、低温稳定性好，且没降低Fp的潜在有益特性；③ 在小鼠实验和人体临床试验中，含Fp和Dp的菌剂具有良好的耐受性和安全性，高剂量下受试者粪便中Dp水平升高。
Synergy and oxygen adaptation for development of next-generation probiotics
2023-08-02 , doi: 10.1038/s41586-023-06378-w
Nature[IF:64.8]
① 鉴定出树突状细胞（DC）限制自身免疫病理的一个负反馈调节环路；② 活化的DC等免疫细胞产生的乳酸可通过转录因子HIF-1α介导的机制，上调NDUFA4L2（线粒体呼吸链复合体I的一个亚基）的表达；③ NDUFA4L2通过限制DC中的线粒体活性氧生成，抑制DC中的XBP1驱动的转录模块，从而限制自身反应性致病T细胞分化；④ 开发一种工程益生菌，它能通过产生乳酸，激活肠道DC的HIF-1α-NDUFA4L2信号，减轻由T细胞驱动的小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎。
Lactate limits CNS autoimmunity by stabilizing HIF-1α in dendritic cells
2023-08-09 , doi: 10.1038/s41586-023-06409-6
Nature[IF:64.8]
① 采用单细胞测序技术，揭示小肠内皮细胞（EC）具有复杂性和功能异质性；② 具有芳香烃受体（AHR）反应性是肠道及其他器官EC的保守特征；③ AHR配体维持肠道屏障稳态归功于其确保EC在肠道屏障中处于静止状态；④ 通过构建EC特异性AHR缺陷小鼠模型，表明AHR是EC维持静止状态的关键因子，并调节血管生成和炎症反应；⑤ 成人肠道EC中AHR通过限制EC的增殖和血管生成维持稳态；⑥ EC中AHR通过调节肠道免疫成分来抑制炎症，从而促进对肠道感染的耐受性。
Endothelial sensing of AHR ligands regulates intestinal homeostasis
2023-08-16 , doi: 10.1038/s41586-023-06508-4
Nature[IF:64.8]
① 用组成明确的复杂菌群（约100个细菌菌株）定植无菌小鼠，分析每个菌株的T细胞反应，发现许多肠道T细胞都能识别多个菌株；② 从92个T细胞受体（TCR）克隆型中构建了T细胞杂交瘤，对每个杂交瘤进行单菌株筛选，几乎所有细菌特异性TCR都呈现TCR与菌株之间一对多的关系；③ 鉴定出13个高丰度TCR，共同识别一组厚壁菌（18个菌株），且共享一个靶标（一个保守的ABC转运系统底物结合蛋白）；④ 对该蛋白特定表位具有特异性的pTreg和Th17细胞，在SPF小鼠中也大量存在。
Mapping the T cell repertoire to a complex gut bacterial community
2023-08-16 , doi: 10.1038/s41586-023-06431-8
Nature[IF:64.8]
① 纳入306名受试者，结合多组学方法和临床数据，分析肠道菌群与胰岛素抵抗（IR）的关系；② 粪便碳水化合物（尤其宿主可用的单糖）在IR患者中增多，并与微生物碳水化合物代谢和宿主血浆炎症细胞因子相关；③ Dorea和Blautia等细菌与IR相关，Alistipes和拟杆菌属等细菌与胰岛素敏感（IS）相关，这些菌有不同的碳水化合物代谢模式；④ 小鼠模型中，IS相关细菌（如A. indistinctus）可减少肠道中可用的碳水化合物（如果糖），降低血糖，改善IR。
Gut microbial carbohydrate metabolism contributes to insulin resistance
2023-08-30 , doi: 10.1038/s41586-023-06466-x
Nature[IF:64.8]
① 艰难梭菌（CD）毒素TcdB分别通过作用于受体FZD1/2/7和CSPG4，直接靶向支配肠道的传入神经和血管周周细胞，诱导二者分别分泌神经肽（SP和CGRP）和促炎细胞因子，从而引发神经源性炎症，促进结肠炎症；② 采用毒素遗传学方法，将TcdB酶域靶向作用于肽能感觉神经，足以在小鼠中诱发神经源性炎症，再现CD感染（CDI）相关的主要结肠组织病理；③ 用遗传操作或药物方法阻断SP和CGRP信号，则可减轻TcdB处理和CDI模型小鼠的病理和CD定植。
C. difficile intoxicates neurons and pericytes to drive neurogenic inflammation
2023-09-12 , doi: 10.1038/s41586-023-06607-2
Nature[IF:64.8]
① 果蝇中肠从炎症损伤过渡到稳态的恢复期间，肠上皮细胞（EC）下调乙酰胆碱酯酶、上调烟碱受体亚基β3，使其对乙酰胆碱（Ach）更敏感；② 同时，一个胆碱能神经元亚群（ARCEN）感应TNF/Egr信号，增强其支配肠道的轴突特性，并释放Ach作用于EC烟碱受体，这触发了EC中Ca2+电流经Inx2/Inx7间隙连接在EC间传播，从而促进EC成熟，继而减少增殖和炎症；③ 破坏该过程会造成离子失衡、Yki/Yap激活、细胞死亡和炎症细胞因子增加等类IBD的慢性损伤。
Cholinergic neurons trigger epithelial Ca2+ currents to heal the gut
2023-09-18 , doi: 10.1038/s41586-023-06627-y
Nature[IF:64.8]
① 开发了一种新的计算方法，从微生物组数据中挖掘未知（无参考）的微生物蛋白家族；② 分析近2.7万个宏基因组和宏转录组数据，鉴定出11.7亿个长度超过 35 个氨基酸的新蛋白序列；③ 对这些序列进行聚类，归为10.6万个新的蛋白家族（每个家族包含≥100个成员）（用同样方法从参考基因组中获得的蛋白家族数量是9.3万个）；④ 对这些新的蛋白家族进行了基于其分类学、栖息地、地理分布和基因邻域分布的注释，并预测了部分3D蛋白结构。
Unraveling the functional dark matter through global metagenomics
2023-10-11 , doi: 10.1038/s41586-023-06583-7
Nature[IF:64.8]
① 艰难梭菌（Cd）通过产生含有非结晶磷酸铁生物矿物的铁小体细胞器来储存铁，铁小体通常在细胞膜附近；② 铁小体的形成依赖于膜蛋白FezA和P1B6-ATP酶转运蛋白FezB，二者可被铁和铁摄取调节因子Fur抑制；③ 铁小体系统在环境从低铁向富铁转变时维持Cd的铁稳态，抵御短暂的铁过载毒性；④ 在Cd感染小鼠模型中，Cd的铁小体系统在发炎肠道中被激活，以对抗由钙卫蛋白介导的铁螯合（宿主营养免疫机制），对感染期间Cd的定植和存活很重要。
Clostridioides difficile ferrosome organelles combat nutritional immunity
2023-11-15 , doi: 10.1038/s41586-023-06719-9
Nature[IF:64.8]
① 筛选血液营养素化合物库，发现膳食反式异油酸（TVA，主要源自乳制品和牛羊肉）能直接促进效应CD8+ T细胞的功能，增强小鼠的抗肿瘤免疫；② 机制上，TVA能拮抗短链脂肪酸对GPR43（细胞表面的一种具有免疫调节作用的G蛋白偶联受体）的激活作用，通过使GPR43失活来激活cAMP-PKA-CREB轴，从而增强CD8+ T细胞功能；③ 小鼠实验和患者分析显示，TVA有改善基于T细胞的免疫治疗（如抗PD1和CART）疗效的潜力。
Trans-vaccenic acid reprograms CD8+ T cells and anti-tumour immunity
2023-11-22 , doi: 10.1038/s41586-023-06749-3
Nature[IF:64.8]
① 结肠上皮细胞（IEC）经IFNγ受体感知IFNγ信号后，上调IRF1-MHCI/II通路，促进将病原体和自身衍生抗原呈递给上皮内T细胞；② 这促进了上皮内T细胞表达胞外ATP酶，限制胞外ATP积累，从而抑制组织巨噬细胞中的NLRP3炎性体活化；③ 而IEC的IFNγ信号及其下游抗原呈递的丧失，可引起胞外ATP积累，促进组织巨噬细胞的抗原呈递、炎性体相关IL-1α和IL-1β的表达，导致CD4+ T细胞向促结肠炎/结直肠癌的致病性GM-CSF+ T细胞转化。
Epithelial IFNγ signalling and compartmentalized antigen presentation orchestrate gut immunity
2023-11-22 , doi: 10.1038/s41586-023-06721-1
Nature[IF:64.8]
① 开发反向代谢组学方法，通过合成新化合物→获得质谱图（LC-MS/MS）→搜索公共代谢组数据（MASST）→元数据分析（ReDU），揭示代谢物与表型、物种、样本类型的关联；② 对4类人体代谢物进行合成和探索，其中胆汁酸类分子的分析表明，克罗恩病中Glu、Ile/Leu、Phe、Thr、Trp和Tyr结合型胆酸升高，并在4个IBD队列中验证；③ 双歧杆菌属、梭菌属和肠球菌属等可产生某些胆汁酰胺化合物，可能通过调节T细胞的IFNγ生成和激动PXR促进肠道炎症。
Reverse metabolomics for the discovery of chemical structures from humans
2023-12-05 , doi: 10.1038/s41586-023-06906-8
Nature[IF:64.8]
① 分析菌群导向性辅食（MDCF-2）干预试验中营养不良儿童的肠道菌群，发现75个细菌基因组（MAG）与体重增长正相关；② 菌群RNA测序揭示了MDCF-2影响的菌群代谢途径，2个与体重增长正相关的Prevotella copri MAG是MDCF-2中多种聚糖的代谢途径的主要贡献者；③ 分析多糖利用位点及其碳水化合物活性酶底物特异性，结合相关菌株的体外生长实验和粪便碳水化合物结构分析，支持特定P. copri菌株是MDCF-2聚糖代谢和宿主体重增长反应的关键介导者。
Bioactive glycans in a microbiome-directed food for children with malnutrition
2023-12-13 , doi: 10.1038/s41586-023-06838-3
Nature[IF:64.8]
① 分析多个生境的149842个基因组，构建未培养原核生物中有重要功能和进化意义的新基因家族目录（FESNov），含404085个基因家族；② 所有FESNov基因家族都跨多个物种，呈现负选择信号，可视为新的直系同源基因群；③ 1034个共同衍征基因家族能在门纲目水平上准确区分未培养类群；④ 预测了32.4%的FESNov基因家族的功能关联，包括4349个与关键生物过程相关的高置信度关联，并实验验证了2个基因家族；⑤ 新基因家族的相对丰度谱可区分不同环境和临床状况，如发现与大肠癌相关的潜在新生物标志物。
Functional and evolutionary significance of unknown genes from uncultivated taxa
2023-12-18 , doi: 10.1038/s41586-023-06955-z
Nature[IF:64.8]
① 肠上皮特异性敲除DARS2、SDHA或COX10以造成肠上皮线粒体功能缺陷，可导致小鼠近端小肠肠细胞中出现大脂滴积累，影响存活；② 无脂喂养可抑制DARS2缺陷肠细胞的脂滴积累，表明脂滴源自膳食脂肪；③ 代谢追踪分析表明，肠上皮缺乏DARS2损害小鼠从肠道向外周器官运输膳食脂质的能力；④ DARS2缺陷使肠细胞中成熟的乳糜微粒减少，并破坏高尔基体，表明线粒体功能障碍可阻碍乳糜微粒从内质网向高尔基体的运输，进而导致膳食脂质在大脂滴中积累。
Mitochondrial dysfunction abrogates dietary lipid processing in enterocytes
2023-12-20 , doi: 10.1038/s41586-023-06857-0
Science[IF:56.9]
① 构建表达人ApoE异构体——ApoE3（中性）和ApoE4（增加AD风险）的tau蛋白病小鼠模型（称为TE3和TE4）；② 无菌TE4小鼠可抵抗tau介导的神经退行病变；③ 生命早期抗生素（ABX）处理也有保护作用，但与性别和ApoE异构体有关（只对雄性有效，且对TE3鼠作用强、对TE4鼠作用弱）；④ 这些保护作用与星形胶质细胞和小胶质细胞的表型变化有关；⑤ ABX引起的肠道菌群变化导致SCFA减少、外周免疫改变，给无菌TE4小鼠补充SCFA会促进其胶质增生和tau病理。
ApoE isoform– and microbiota-dependent progression of neurodegeneration in a mouse model of tauopathy
2023-01-12 , doi: 10.1126/science.add1236
Science[IF:56.9]
① 用低脂低蛋白饮食喂养常规幼鼠，建立营养不良诱导的发育迟缓小鼠模型；② 在该模型中，补充植物乳杆菌WJL（LpWJL）菌株可提高血液IGF-1和胰岛素的水平和活性，从而改善全身生长；③ LpWJL的促生长效应是菌株特异的，其热灭活菌和纯化细胞壁也有效；④ 机制上，LpWJL通过作用于肠上皮中的模式识别受体NOD2，促进小肠隐窝细胞增殖和1型干扰素信号，从而发挥促生长作用；⑤ 口服NOD2配体（如胞壁酰二肽和米伐木肽）也有一定促生长作用。
Microbe-mediated intestinal NOD2 stimulation improves linear growth of undernourished infant mice
2023-02-23 , doi: 10.1126/science.ade9767
Science[IF:56.9]
① 1990年代以来，EOCRC的发病率每年增加2%-4%；② 相比于晚发性结直肠癌（LOCRC），EOCRC通常具有家族史，并表现为微卫星不稳定性，确诊时更多为转移性/晚期；③ EOCRC的分子特征为：低分化、长散在重复序列-1（LINE-1）低甲基化；④ EOCRC的临床特征为：更多发生在左侧结肠及直肠；⑤ Lynch综合征是最常见的导致EOCRC的原因；⑥ 代谢综合征、含糖饮料、红肉/加工肉类、西式饮食、肥胖、久坐等环境因素可能增加EOCRC及LOCRC的风险。
A common cancer at an uncommon age
2023-03-16 , doi: 10.1126/science.ade7114
Science[IF:56.9]
① 多形拟杆菌（Bt）的转录终止蛋白Rho含有内在无序结构域（IDR），对Bt在小鼠肠道中的适应性很重要；② 在体外，IDR能促进Rho发生液-液相分离，根据盐和蛋白质浓度及RNA的存在而形成液滴；③ 小鼠实验显示，Rho以IDR依赖的方式在Bt中凝聚形成无膜区室（相分离），从而应对碳源不足和肠道环境；④ IDR依赖的相分离能增强Rho的转录终止活性，且对特定基因的转录终止有关键作用；⑤ IDR调控Bt的全局基因表达，包括在肠道内生存所需的一些关键基因。
Bacteria require phase separation for fitness in the mammalian gut
2023-03-16 , doi: 10.1126/science.abn7229
Science[IF:56.9]
① 限制膳食支链氨基酸（BCAA）尤其异亮氨酸，或激活促进饥饿感/进食动机的特定神经，能诱导果蝇的饥饿状态，使其在进食量增加的情况下延长寿命；② BCAA限制可改变果蝇神经的组蛋白修饰模式，在分子层面上编码饥饿感，但饥饿似乎通过不同的神经途径调节进食和衰老；③ 组蛋白乙酰化组的变化介导了BCAA限制引起的进食增加，并部分介导其延寿作用；④ 此外，BCAA限制通过增加组蛋白变体H3.3促进短期进食，而长期饥饿似乎可改变食欲调控设定点，从而延缓衰老。
Effects of hunger on neuronal histone modifications slow aging in Drosophila
2023-05-11 , doi: 10.1126/science.ade1662
Science[IF:56.9]
① 抗生素（ABX）治疗后，Enterocloster菌属物种的反弹/再定植，通过其对胆汁酸的影响下调回肠的MAdCAM-1（α4β7整合素的配体）表达；② MAdCAM-1表达的降低，促进了肠道中具有免疫抑制作用的α4β7+CD4+调节性T细胞（Treg17）大量离开肠道，迁移到肿瘤中，这与ABX损害靶向PD-1免疫治疗效果有关；③ PD-1阻断治疗的抗癌效果依赖于MAdCAM-1–α4β7轴，阻断IL-17A或肝脏异位表达MAdCAM-1以截留肠道Treg17，可逆转ABX引起的免疫抑制；④ 肺癌、肾癌和膀胱癌患者中，低水平的血清可溶性MAdCAM-1与肠道菌群失调和不良预后相关。
A microbiota-modulated checkpoint directs immunosuppressive intestinal T cells into cancers
2023-06-09 , doi: 10.1126/science.abo2296
Science[IF:56.9]
① 筛选一系列双翅菌肽（Dpt）家族基因DptA和DptB的突变体果蝇，发现二者分别对病原体雷氏普罗威登斯菌（Pr）和肠道共生菌醋杆菌属具有特异性防御作用；② Dpt家族基因的快速演化反映了果蝇生态环境中特定细菌的存在情况：食果和食菇果蝇的生活环境中分别富含和缺乏醋杆菌，伴随DptB基因的存在或丢失，而寄生植物的果蝇同时丢失DptA和B，与环境中同时缺乏Pr和醋杆菌有关；③ DptA和DptB样序列可预测不同果蝇物种对Pr和醋杆菌感染的抵抗力。
Ecology-relevant bacteria drive the evolution of host antimicrobial peptides in Drosophila
2023-07-20 , doi: 10.1126/science.adg5725
Science[IF:56.9]
① 明确微生物种群多样性维持机制是生态学关键问题，目前微生物共生研究多集中在种间；② 为阐明独立成对共存与多物种群落共存的关系，在体外对12个不同富集群落的稳定共存成员进行了数百次成对竞争实验，通过自动图像分析系统量化物种丰度；③ 竞争性排斥为最常见结果，且具有很强的等级性和传递性；④ 稳定的生态群落中共存的许多物种在相同条件下无法成对共生共存，提示多物种共存是涌现现象；⑤ 群落环境对复杂生态系统的共存起源意义重大。
Emergent coexistence in multispecies microbial communities
2023-07-20 , doi: 10.1126/science.adg0727
Science[IF:56.9]
① 建立一个酶活筛选平台，对110种人类疾病相关酶进行测定，从肠道菌群中鉴定出71个可模拟宿主酶功能的菌源同工酶；② 糖尿病重要靶点二肽基肽酶4（DPP4）的菌源同工酶主要由拟杆菌属表达，其能在肠屏障受损的小鼠模型中降低体内胰高血糖素样肽-1（GLP-1）活性，损害糖稳态；③ 靶向人体DPP4的药物西他列汀对菌源DPP4抑制较弱，与分子结构有关，菌源DPP4可影响西格列汀的治疗效果；④ 通过高通量筛选和结构修饰获得一种选择性的菌源DPP4抑制剂Dau-d4（蝙蝠葛苏林碱衍生物），可改善糖尿病小鼠的GLP-1活性和糖稳态。
Microbial-host-isozyme analyses reveal microbial DPP4 as a potential antidiabetic target
2023-08-03 , doi: 10.1126/science.add5787
Science[IF:56.9]
① 从无法维持疟原虫寄生虫发育的按蚊群落中分离出一种天然的按蚊共生肠菌——鹤羽田戴尔福特菌TC1（Dt）；② Dt能稳定地在蚊子肠道中定植，该菌不影响蚊子生存适性，不会经叮咬传播，能持续抑制疟原虫在蚊子体内发育；③ 机制上，Dt通过分泌一种小分子抑制剂哈尔满碱，抑制蚊子肠道中雌性疟原虫配子的发育，哈尔满碱也可通过接触方式穿过蚊子角质层发挥抑制作用；④ 实地试验和模型研究表明，Dt有望用于疟疾控制。
Delftia tsuruhatensis TC1 symbiont suppresses malaria transmission by anopheline mosquitoes
2023-08-03 , doi: 10.1126/science.adf8141
Science[IF:56.9]
① 小肠上皮中，潘氏细胞能产生全长的肽YY（PYY1-36），其被分泌并保留在肠上皮表面黏液层中，而不会被裂解为PYY3-36（内分泌型PYY）；② 不同于内分泌型PYY，PYY1-36具有抗微生物肽活性，主要作用是选择性抑制致病侵袭性的白色念珠菌菌丝，而对其共生性的酵母型影响较小；③ 机制上，PYY1-36是一种阳离子分子，可与真菌菌丝的阴离子表面相互作用，导致膜破坏和转录重编程，从而选择酵母型；④ 小鼠中，PYY可减少白色念珠菌的肠道定植。
Peptide YY: A Paneth cell antimicrobial peptide that maintains Candida gut commensalism
2023-08-03 , doi: 10.1126/science.abq3178
Science[IF:56.9]
① 以贝氏不动杆菌为底盘，基于其天然感受态特性，结合CRISPR-Cas系统，构建能检测靶标游离DNA的工程菌，该方法命名为CATCH（靶向的、CRISPR区分的水平基因转移细胞检测法）；② 以结直肠癌（CRC）致癌突变KRASG12D为靶标构建工程菌，使其在摄取含该突变基因（而非野生型基因）的游离DNA时，通过DNA同源重组获得卡那霉素抗性，进而可被检测；③ 在体外（细胞和类器官与工程菌共培养）和体内（经直肠灌肠将工程菌输送到小鼠CRC模型中）验证了该方法的可行性。
Engineered bacteria detect tumor DNA
2023-08-10 , doi: 10.1126/science.adf3974
Science[IF:56.9]
① 对比常规（有菌）和无菌小鼠的小肠上皮细胞转录组测序，发现lncRNA Snhg9在常规小鼠中表达降低；② Snhg9通过与CCAR2结合，引起CCAR2-SIRT1复合物解离，释放出的SIRT1抑制了PPARγ的表达和活性，重编程肠道脂代谢；③ 常规小鼠中，在肠上皮细胞中过表达Snhg9可阻碍脂质吸收、减少体脂并防止饮食引起的肥胖；④ 肠道菌群通过髓系细胞-3型天然淋巴细胞的信号转导中继，抑制肠上皮的Snhg9表达。
The gut microbiota reprograms intestinal lipid metabolism through long noncoding RNA Snhg9
2023-08-24 , doi: 10.1126/science.ade0522
Science[IF:56.9]
① 膳食几丁质可引发小鼠胃膨胀，通过诱导胃簇细胞产生IL25等机制激活2型天然淋巴细胞（ILC2）；② 几丁质诱导的内源性胃2型免疫回路，驱动了胃肠道组织重塑，促进了胃主细胞扩增，使其产生更多消化几丁质的酶AMCase和其他消化酶，从而使小鼠适应膳食几丁质；③ 几丁质的这些作用不依赖于菌群，虽然其能改变肠道菌群组成；④ 补充几丁质可改善高脂喂养的肥胖小鼠的代谢健康，而缺乏AMCase的小鼠补充几丁质可增强基础2型免疫、抵抗肥胖。
A type 2 immune circuit in the stomach controls mammalian adaptation to dietary chitin
2023-09-07 , doi: 10.1126/science.add5649
Science[IF:56.9]
① 对小鼠不同组织的嗜酸性粒细胞（EOS）进行转录组分析，发现小肠中存在表达神经调节肽U（NMU）受体1（NMUR1）的EOS亚群；② 命运图谱分析表明，EOS归巢小肠后受组织微环境的诱导而表达NMUR1，且可被炎症信号进一步上调；③ 小肠中，NMUR1维持EOS数量并促进其脱粒；④ 小鼠遗传操纵和EOS-类器官共培养实验表明，NMU通过激活表达NMUR1的小肠EOS，促进抗寄生虫黏膜免疫和杯状细胞分化。
Neuromedin U programs eosinophils to promote mucosal immunity of the small intestine
2023-09-14 , doi: 10.1126/science.ade4177
Science[IF:56.9]
① 人结肠中存在复杂的γδ T细胞库，包括一个表型独特的CD103+ Vγ4+亚群，其兼具T细胞和NK细胞的配体识别系统，但不易被常规效应因子激活；② 该亚群可与肠上皮细胞呈递的BTNL3+BTNL8异聚体结合，被BTNL选择和维持；③ IBD患者中，该亚群不成比例地减少和失调，而治疗诱导的CD103+γδ T细胞的恢复则与IBD持续缓解相关；④ 携带缺陷型BTNL3/BTNL8突变的人也有CD103+Vγ4+细胞失调和缺失，且与克罗恩病患者疾病严重程度相关。
Conserved γδ T cell selection by BTNL proteins limits progression of human inflammatory bowel disease
2023-09-14 , doi: 10.1126/science.adh0301
Science[IF:56.9]
① 下丘脑弓状核（ARC）可整合食物营养相关信号，以控制和调节代谢；② 能量不足时，ARC中表达刺鼠相关肽的神经元被激活，被瘦素和胰岛素抑制，促进觅食和食物消耗；③ 能量充足时，表达阿片黑素促皮质激素原的神经元被激活，减少食物摄入并增加能量消耗；④ 不同时间尺度上，这些神经元可感知食物线索、胃肠道的进食信号（肠-脑轴）及更长期的能量相关激素信号；⑤ 此外，这些神经元还根据机体的能量状态调整外周组织的多种行为和其他生理过程。
Integrative neurocircuits that control metabolism and food intake
2023-09-29 , doi: 10.1126/science.abl7398
Science[IF:56.9]
① 开发了一种益生菌引导的CAR-T细胞（ProCAR）平台，用于实体瘤治疗；② 以大肠杆菌Nissle1917为底盘构建工程菌，其能定植于实体瘤并向肿瘤核心释放合成抗原ProTag（包含结合肿瘤胞外基质的HBD以及可被工程化CAR-T识别的GFP），从而将肿瘤标记为CAR-T细胞的攻击目标；③ 进一步构建了能共同释放趋化因子的多功能工程菌，增强CAR-T细胞对肿瘤的浸润和治疗反应；④ 在大肠癌、乳腺癌等多种小鼠肿瘤模型中证实了ProCAR的安全有效性。
Probiotic-guided CAR-T cells for solid tumor targeting
2023-10-12 , doi: 10.1126/science.add7034
Science[IF:56.9]
① 噬菌体疗法可抑制特定菌株（如肺炎克雷伯菌），有望用于治疗非传染性疾病（如炎症性肠病）；② 使用噬菌体疗法的方法包括活体口服、活噬菌体引导的纳米系统和使用提纯的噬菌体作用蛋白；③ 共同培养噬菌体和患者的靶向菌株可加快个体噬菌体疗法的发展；④ 研究非传染性疾病的噬菌体疗法仍处于探索阶段，面临噬菌体分离、临床设计选择和噬菌体安全有效使用的挑战；⑤ 现有的药物上市规定需根据噬菌体疗法自身的特点进一步更新。
Phage therapy in noncommunicable diseases
2023-10-19 , doi: 10.1126/science.adh2718
Science[IF:56.9]
① 构建基于成年人类小肠类器官和CRISPR基因敲除的高通量筛选平台，对调控人类肠内分泌细胞（EEC）谱系分化的转录因子（TF）进行系统性无偏鉴定；② 发现ZNF800是在内分泌谱系定向分化中起主导作用的转录抑制因子；③ ZNF800直接抑制内分泌TF调控网络（其靶基因包括该网络中的核心TF：INSM1、SOX4、NEUROG3等），从而抑制肠干细胞向EEC分化；④ ZNF800还直接抑制PAX4，PAX4通过抑制ARX来抑制其他EEC亚型的分化，驱动偏向肠嗜铬细胞的分化轨迹。
Unbiased transcription factor CRISPR screen identifies ZNF800 as master repressor of enteroendocrine differentiation
2023-10-26 , doi: 10.1126/science.adi2246
Science[IF:56.9]
① 小鼠中，小肠肠细胞表达的转运蛋白Aster调节对膳食胆固醇的吸收；② 小鼠口服胆固醇后，Aster-B蛋白富集到小肠肠细胞刷状缘，Aster-B/C双敲除阻碍胆固醇吸收，并抵抗食源性高胆固醇血症；③ 机制上，Aster位于NPC1L1下游，NPC1L1使膳食胆固醇在刷状缘沉积，以招募Aster到肠细胞顶端质膜，Aster将胆固醇转移到内质网，其缺失导致质膜上胆固醇积累、内质网胆固醇耗竭；④ 用小分子抑制剂AI-3d靶向Aster通路，可减少小鼠对膳食胆固醇的吸收。
Aster-dependent nonvesicular transport facilitates dietary cholesterol uptake
2023-11-09 , doi: 10.1126/science.adf0966
Science[IF:56.9]
① 碳饥饿时，有益肠菌多形拟杆菌（Bt）通过特定机制来增强其在宿主肠道中的存活和适应性；② 碳水化合物利用调节因子Cur上调EF-G2表达，EF-G2能以不消耗GTP的方式进行蛋白质合成，帮助细菌节能；③ (p)ppGpp分子积累，调节大量基因表达和代谢物丰度，增强细菌对环境变化的适应力；④ Rho蛋白的液-液相分离增强其转录终止活性，帮助细菌调节基因表达；⑤ 这些因子使Bt在低营养时减少生长，增强存活，或是少食/间歇性禁食改善宿主健康的潜在原因。
Advancing the fitness of gut commensal bacteria
2023-11-16 , doi: 10.1126/science.adh9165
Science[IF:56.9]
① 在体外和体内（悉生小鼠）研究人肠菌如何影响致病菌（肺炎克雷伯菌和伤寒沙门氏菌）的定植；② 单个物种的定植抵抗作用有限，群落水平的定植抵抗是一种集体特性，取决于其生态多样性和组成（特定关键物种的存在）；③ 定植抵抗作用可归因于群落共同消耗的营养素与致病菌所需营养素的重叠，从而限制致病菌生长和定植；④ 基于这种营养阻断原理建立预测模型（可用群落与靶标菌株的基因组重叠度作为替代指标），可指导构建抵抗靶标菌株的菌群。
Microbiome diversity protects against pathogens by nutrient blocking
2023-12-14 , doi: 10.1126/science.adj3502
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 纳入100名健康成年人进行随机病例交叉试验，通过手机App和可穿戴传感器评估心脏、步数、睡眠和血糖等参数，研究含咖啡因咖啡对健康状况的急性影响；② 喝咖啡日与无咖啡日的每日房性期前收缩次数分别为58次和53次（差异不显著），室性期前收缩次数分别为154次和102次；③ 喝咖啡和无咖啡还分别与以下情况相关：每日10,646步和9665步，每晚睡眠时间397分钟和432分钟，血糖水平95 mg/dL和96 mg/dL。
Acute Effects of Coffee Consumption on Health among Ambulatory Adults
2023-03-23 , doi: 10.1056/NEJMoa2204737
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 246名接受过不超过2线化疗的转移性结直肠癌患者随机均分为两组，分别接受FTD-TPI+贝伐珠单抗治疗（联合治疗组）或FTD-TPI治疗（FTD-TPI组）；② 联合治疗组的中位总生存期为10.8个月，显著高于FTD-TPI组的7.5个月；③ 联合治疗组的中位无进展生存期为5.6个月，显著高于FTD-TPI组的2.4个月；④ 最常见不良事件为中性粒细胞减少、恶心、贫血，未发生治疗相关死亡；⑤ 联合治疗组的ECOG评分恶化的中位时长为9.3个月，显著高于FTD-TPI组的6.3个月。
Trifluridine–Tipiracil and Bevacizumab in Refractory Metastatic Colorectal Cancer
2023-05-04 , doi: 10.1056/NEJMoa2214963
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 两项诱导试验分别纳入526例、495例中重度克罗恩病（CD）患者，2:1随机分组至每日45mg乌帕替尼治疗组或安慰剂；② 维持试验纳入上述诱导治疗有临床反应的患者，1:1:1随机分组至每日15mg、30mg乌帕替尼或安慰剂；③ 12周（诱导试验）时和52周（维持试验）时，乌帕替尼组患者的临床和内镜下缓解比例显著高于安慰剂组；④ 45mg和30mg乌帕替尼组的带状疱疹感染发生率较安慰剂组更高，30mg乌帕替尼组的肝病和中性粒细胞减少发生率较其他组更高。
Upadacitinib Induction and Maintenance Therapy for Crohn’s Disease
2023-05-25 , doi: 10.1056/NEJMoa2212728
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 纳入1128名患者接受治疗，分为奥沙利铂（FOLFOX）组（585人）和放化疗组（543人）；② 中位随访58个月时，FOLFOX和放化疗组的疾病复发或死亡的风险比为0.92，FOLFOX组中89.6%最终能够避免接受放化疗；③ FOLFOX在无病生存方面不逊于放化疗，FOLFOX组5年无病生存率为80.8%，放化疗组为78.6%；④ FOLFOX组和放化疗组的总生存率（89.5% vs 90.2%）和局部复发率（1.8% vs 1.6%）相似；⑤ FOLFOX组术前放化疗53例（9.1%），术后放化疗8例（1.4%）。
Preoperative Treatment of Locally Advanced Rectal Cancer
2023-06-05 , doi: 10.1056/NEJMoa2303269
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 在中度至重度活动性溃疡性结肠炎患者中开展mirikizumab的诱导和维持两项试验；② 诱导试验第12周，治疗组24.2%患者达到临床缓解，高于安慰剂组13.3%，维持试验第40周，治疗组49.9%达到临床缓解，显著高于安慰剂组25.1%；③ 两项试验均符合临床缓解、内镜下缓解和急便症状改善的标准；④ 治疗组发生鼻咽炎和关节痛的不良事件比安慰剂组更频繁，且在1217例治疗组中，发生机会性感染15例，癌症8例，安慰剂组1例患带状疱疹感染，无人患癌。
Mirikizumab as Induction and Maintenance Therapy for Ulcerative Colitis
2023-06-29 , doi: 10.1056/NEJMoa2207940
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 开展一项为期3年的双中心随机对照研究，志愿者被随机分轻度热量限制的MIND饮食组和日常饮食组，最终共301例和303例认知损伤受试者入组；② 基线时两组平均MIND饮食评分为7.7和7.8，6个月后提高到11和8.5分，两组体重下降分别为5.0和4.8kg；③ 从基线到干预3年后，MIND饮食组整体认知评分平均增加0.205标准单位，对照组增加0.170标准单位，组间不显著；④ 两组间在蛋白质高信号、总灰质、海马体积和不良事件发生率等方面无显著差异。
Trial of the MIND Diet for Prevention of Cognitive Decline in Older Persons
2023-07-18 , doi: 10.1056/NEJMoa2302368
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 蛋白丢失性肠病（PLE）是肠道血浆蛋白的非代偿性损失，表现为在没有肝脏或肾脏疾病的情况下出现全低蛋白血症、水肿、营养缺乏、感染和胃肠道症状；② 许多获得性和先天性疾病通过直接损伤肠黏膜、阻塞和淋巴管扩张阻断胃肠道淋巴流动导致PLE；③ 结合综合征特点和临床病史、影像学检查、组织病理学检测特别是基因检测可揭示PLE潜在病因和发展有效的治疗方法；④ 近期进展表明进一步的分子研究将继续为PLE诊断和治疗提供新的和更精确的方法。
Protein-Losing Enteropathy
2023-08-24 , doi: 10.1056/NEJMra2301594
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 开展一项多中心、开放标签、随机的3期临床试验，将未接受KRAS G12C抑制剂治疗的转移性CRC患者分3组；② 中位随访7.8个月后，接受960和240mg的索托拉西布+帕尼单抗组及标准治疗组的中位无进展生存期为5.6、3.9和2.2个月，客观缓解率为26.4、5.7和0%；③ 相比标准治疗组，接受960和240mg的索托拉西布+帕尼单抗组的疾病进展或死亡风险比为0.49和0.58，不良事件发生率为35.8和30.2%；④ 皮肤相关毒性作用和低镁血症是联合治疗最常见的不良事件。
Sotorasib plus Panitumumab in Refractory Colorectal Cancer with Mutated KRAS G12C
2023-10-22 , doi: 10.1056/NEJMoa2308795
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 开展一项多中心、双盲、随机、安慰剂对照试验，共150名小肠血管发育不良（SIA）反复出血患者被分配接受沙利度胺或安慰剂治疗4个月，评估沙利度胺对SIA反复出血的疗效和安全性；② 其中，51人和49人被随机分配到100 mg和50 mg沙利度胺组，50人被分配到安慰剂组；③ 100 mg和50 mg沙利度胺组及安慰剂组有效缓解率为68.6%、51.0%和16.0%；④ 沙利度胺组不良事件发生率高于安慰剂组，如便秘、嗜睡、肢体麻木、外周水肿、头晕和肝酶水平升高。
Thalidomide for Recurrent Bleeding Due to Small-Intestinal Angiodysplasia
2023-11-02 , doi: 10.1056/NEJMoa2303706
New England Journal of Medicine[IF:158.5]
① 通过分析12项口腔癌和4项食管癌研究，发现减少饮酒或戒酒可降低口腔癌和食管癌风险；② 通过分析其他癌症研究，发现减少饮酒或戒酒降低喉癌、结直肠癌和乳腺癌风险证据有限，而降低咽癌和肝癌证据不足；③ 戒酒会导致唾液乙醛浓度下降，消除上呼吸消化道和结肠局部接触与酒精相关的乙醛；④ 戒酒可导致后期外周血单个核细胞DNA染色体畸变和微核减少，口腔中乙醛-DNA加合物快速减少；⑤ 戒酒可逆转酒精使用障碍患者肠通透性增加和微生物易位。
The IARC Perspective on Alcohol Reduction or Cessation and Cancer Risk
2023-12-28 , doi: 10.1056/NEJMsr2306723
JAMA[IF:120.7]
① 91名活动性溃疡性结肠炎患者随机均分为三组，每两周静注Olamkicept 600mg、300mg或安慰剂，持续12周；② 600mg组、300mg组及安慰剂组的临床应答率分别为58.6%、 43.3%及34.5%，600mg组的临床应答率显著高于安慰剂组；③ 25个次要终点中，600mg组及300mg组分别有16个及6个显著优于安慰剂组；④ 600mg组、300mg组及安慰剂组的治疗相关不良事件发生率分别为53.3%、58.1%及50%；⑤ 最常见不良事件：尿胆红素升高、高尿酸血症、天冬氨酸转氨酶升高。
Effect of Induction Therapy With Olamkicept vs Placebo on Clinical Response in Patients With Active Ulcerative Colitis - A Randomized Clinical Trial
2023-03-07 , doi: 10.1001/jama.2023.1084
JAMA[IF:120.7]
① VE303是一种由8个共生性梭菌菌株组成的成分明确的混合菌剂；② 开展一项2期、多中心、随机、双盲、安慰剂对照、剂量范围研究，纳入79名艰难梭菌感染（CDI）复发高风险受试者，分别服用高剂量VE303、低剂量VE303或安慰剂，每天1次，持续14天，研究VE303预防CDI复发的有效性；③ 第8周时，高剂量VE303组的CDI复发率为13.8%，低剂量VE303组为37.0%，安慰剂组为45.5%；④ 与安慰剂相比，高剂量VE303可预防CDI复发（两组的复发率差异显著）。
VE303, a Defined Bacterial Consortium, for Prevention of Recurrent Clostridioides difficile Infection - A Randomized Clinical Trial
2023-04-15 , doi: 10.1001/jama.2023.4314
JAMA[IF:120.7]
① 纳入超9.8万名绝经妇女（年龄50-79岁），通过问卷收集其含糖饮料摄入量，评估含糖饮料摄入与肝癌发生率和慢性肝病死亡率间的关系；② 在平均21年的随访期间，共出现207例新发肝癌病例和148例慢性肝病死亡病例；③ 与从不喝或每月喝少于3份含糖饮料的人相比（每份约355mL），每天喝1份或更多含糖饮料的女性，患肝癌的风险高85%，而患慢性肝病的死亡风险高68%；④ 人工甜味剂饮料摄入量与肝癌发病率和慢性肝病死亡率间没有显著的相关性。
Sugar-Sweetened and Artificially Sweetened Beverages and Risk of Liver Cancer and Chronic Liver Disease Mortality
2023-08-08 , doi: 10.1001/jama.2023.12618
JAMA[IF:120.7]
① 溃疡性结肠炎（UC）与免疫系统对肠菌的异常反应有关，肠道症状有慢性腹泻和直肠出血等，约27%的患者有肠外症状；② UC降低患者预期寿命、增加结直肠癌风险，患者应监测炎症症状和生物标志物，并按期进行结直肠癌筛查；③ 根据疾病位置和活动情况可对UC进行风险分层和治疗，5-氨基水杨酸用于治疗轻至中度UC，中至重度UC可采用针对特定炎症通路的治疗方法，如靶向TNFα、α4β7整合素、IL-12和IL-23的单克隆抗体及JAK和S1P的小分子抑制剂。
Ulcerative Colitis in Adults - A Review
2023-09-12 , doi: 10.1001/jama.2023.15389
JAMA[IF:120.7]
① 纳入8920例参与者（平均55岁，60%为女性），结肠镜检查确认36例CRC和606例晚期腺瘤；② 粪便多靶点RNA（mt-sRNA）检测成功识别其中的34例CRC和278例晚期腺瘤，灵敏度分别为94%和46%；③ mt-sRNA检测对I/II期和III/IV期CRC的敏感性无显著差别，对直径较大或数量超过10个或远端或高级别不典型增生的腺瘤相对更敏感；④ 与粪便免疫化学相比，mt-sRNA检测对CRC（94% vs. 78%）和晚期腺瘤（46% vs. 29%）的灵敏度明显提高。
Multitarget Stool RNA Test for Colorectal Cancer Screening
2023-10-23 , doi: 10.1001/jama.2023.22231
JAMA[IF:120.7]
① 纳入213名中老年人随机分高钠或低钠饮食组持续一周，随后参与者用相反饮食继续干预一周，监测其血压并收集24小时尿液评估饮食依从性；② 正常、高钠和低钠饮食中位收缩压测量值分别为125、126和119mmHg；③ 相比高钠组，低钠饮食参与者收缩压显著降低7～8mmHg，相比常规饮食，收缩压显著降低6mmHg，且收缩压的降低与常见降压药的效果相当；④ 相比与正常饮食，高钠饮食参与者收缩压并没显著升高，而从低钠恢复到高钠饮食则会导致血压升高。
Effect of Dietary Sodium on Blood Pressure A Crossover Trial
2023-11-11 , doi: 10.1001/jama.2023.23651
Lancet[IF:168.9]
① 纳入15个国家1301例接受机械通气的具有高营养风险的ICU入院96小时内的危重病人，1:1随机分组，高剂量蛋白质组和普通剂量组每天分别至少摄入2.2g/kg、1.2g/kg蛋白质，两组摄入的能量相当；② 随机分组后60天，高剂量组和普通剂量组的累计存活出院率分别为46.1%和50.2%，且出院所需时间没有差异，两组死亡率分别为34.6%和32.1%；③ 亚组分析表明，高蛋白质剂量可能会使急性肾损伤患者以及较高的器官衰竭估计评分患者临床结局恶化。
The effect of higher protein dosing in critically ill patients with high nutritional risk (EFFORT Protein): an international, multicentre, pragmatic, registry-based randomised trial
2023-01-25 , doi: 10.1016/S0140-6736(22)02469-2
Lancet[IF:168.9]
① 营养不良会增加老年人发生衰弱、骨质疏松、肌肉萎缩和死亡等不良临床结果的风险；② 老年人营养不良包括三种病因亚型：由炎症驱动的疾病相关、无炎症的疾病相关和与疾病无关（饥饿、社会经济或心理因素）的营养不良；③ 老年人营养不良的管理需要将常规筛查与营养评估、咨询、教育、及食物、口服营养补充剂等营养护理计划相结合，不建议进行减重相关的饮食限制；④ 目前的管理在地区之间存在差异，循证知识与当前临床实践之间也存在着差距。
Malnutrition in older adults
2023-01-27 , doi: 10.1016/S0140-6736(22)02612-5
Lancet[IF:168.9]
① ELEVATE UC12和UC52试验分别纳入433例和354例活动性中至重度溃疡性结肠炎患者，2:1随机分组，接受每日一次口服2mg剂量etrasimod或安慰剂作为诱导疗法治疗12周，UC52试验另维持治疗40周；② 12周时，两试验的治疗组临床缓解率均显著高于安慰剂组（25% vs. 15%，27% vs. 10%）；③ 52周时，治疗组临床缓解率显著高于安慰剂组（32% vs. 7%）；④ 两试验中，治疗组在其他临床反应次要终点均较安慰剂组显著改善，不良反应发生率未见显著增加。
Etrasimod as induction and maintenance therapy for ulcerative colitis (ELEVATE): two randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 studies
2023-03-02 , doi: 10.1016/S0140-6736(23)00061-2
Lancet[IF:168.9]
① 纳入691例难治性转移性结直肠癌患者（中位年龄64岁），既往接受过标准全身治疗（73%接受了超过3线治疗），2:1随机分配至呋喹替尼治疗组（5mg，每日一次，每1-21天，28天周期）或安慰剂组；② 治疗暴露中位持续时间3.1个月，与安慰剂相比，呋喹替尼显著延长患者的中位总生存期（7.4个月 vs. 4.8个月）和中位无进展生存期（3.7个月 vs. 1.8个月）；③ 呋喹替尼和安慰剂组的3级及以上严重不良事件发生率分别为63%和50%。
Fruquintinib versus placebo in patients with refractory metastatic colorectal cancer (FRESCO-2): an international, multicentre, randomised, double-blind, phase 3 study
2023-06-15 , doi: 10.1016/S0140-6736(23)00772-9
Lancet[IF:168.9]
① 溃疡性结肠炎的发生与肠上皮屏障缺陷，微生态失调和免疫反应失调密切相关；② 患者常表现为血性腹泻，诊断是基于临床、生物学、内镜和组织学的综合表现；③ 医疗管理的目的是，首先诱导快速临床反应并使生物标志物正常化，其次维持临床缓解并达到内窥镜正常化；④ 诱导缓解的治疗包括5-氨基水杨酸药物和皮质类固醇，维持治疗包括5-氨基水杨酸药物、硫嘌呤、生物制剂和小分子药物；⑤ 虽然治疗选择正在扩大，10-20%的患者仍然需要结直肠切除术。
Seminar - Ulcerative colitis
2023-08-12 , doi: 10.1016/S0140-6736(23)00966-2
Lancet[IF:168.9]
① 纳入463名参与者（68%女性）随机分配接受低剂量阿米替林（232人）或安慰剂（231人）治疗；② 阿米替林在3个月和6个月时的主要结果优于安慰剂，组间IBS-SSS评分差异显著；③ 主观全面评定发现服用阿米替林患者总体改善症状的可能性几乎是安慰剂组的两倍；④ 参与者的焦虑或抑郁评分无显著差异，说明药物可能通过肠道而不是抗抑郁发挥作用；⑤ 阿米替林的不良反应主要与其已知的抗胆碱能作用有关，除便秘和腹泻外（＜10%），严重的不良反应很少。
Amitriptyline at Low-Dose and Titrated for Irritable Bowel Syndrome as Second-Line Treatment in primary care (ATLANTIS): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 trial
2023-10-16 , doi: 10.1016/S0140-6736(23)01523-4
