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evaluation
文章数:1篇
微生物组-代谢组
亟待优化的微生物组-代谢组关联分析
用相关性分析手段评估微生物对代谢物变化量的影响常会得到假阳性结果,因为1)其对“影响”二字无严格定义,2)缺乏自然条件下微生物-代谢物互作的真实数据。本文通过建立数学模型和使用化学恒化器建立简化的体外微生物-代谢物模型证明了传统的相关性分析预测准确度低,但也随不同菌株、代谢物和环境波动的不同而变化,而原理验证结果可帮助改善准确度。尽管如此微生物组-代谢组数据仍包含了大量信息,建议未来的方向包括1)使用多菌株代谢模型来复制实验,2)多变量分析解构菌株与环境间关系,3)使用概率方法融入未知原理。
微生物组-代谢组
关联性分析
Correlation
evaluation
metabolic modeling