Shixu He

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华大基因：SOAPMetaS实现分布式集群高效分析宏基因组大数据

在宏基因组研究中，数据量的快速增长对有效处理大型数据集的新工具提出了更高的要求。为了在大数据情况下加速宏基因组分析过程，作者开发了SOAPMetaS，这是一种基于标记基因的多样本宏基因组分析工具，该工具建立在Apache Spark之上。SOAPMetaS展示了处理大型数据集的高性能和可扩展性。SOAPMetaS可以加速大量多样本宏基因组数据的分析过程，并生成准确的分析结果并可以帮助研究人员有效地获取各种微生物组群落的物种分类和基因组成信息。除了对宏基因组分析外，用户还可以将“比对”模块用作快速的独立分布式比对工具。

宏基因组 SOAPMetaS 高性能可扩展性

华大基因等：植物-固氮菌共生的进化机制

氮是植物生长的必须元素，然而只有部分植物能与土壤中的固氮细菌共生，固定空气的氮供植物吸收。Science近期上线一项由华大基因参与主导的研究，通过比较基因组学方法，发现植物中的NIN和RPG基因可能对调节植物-固氮菌共生有重要作用，并提出了“多重独立丢失”的新假说以解释植物共生固氮的演化机制。这些发现将有助于用生物工程技术改造农业种植，以达到增产和减少氮肥使用的目的。

共生固氮植物比较基因组学植物基因组测序