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全外显子组
文章数:3篇
全基因组分析
新发现一个淋巴瘤抑癌基因:Bcor
① 对Eμ-Myc基因工程小鼠进行全基因组和全外显子组测序;② 常发生PRC1样组分和BCL6共抑制基因Bcor的破坏性突变,AKT-MTOR-eIF4E下调协同MYC参与Eμ-Myc淋巴瘤形成,依维莫司抑制mTORC1延缓癌前病变发展为淋巴瘤;③ 同时发生多基因病灶,涉及Cdkn2a缺失和Nras、Kras和 Bcor等;④ 多个驱动性癌基因协同突变,多个遗传学事件协同,挑战了Eμ-Myc的“二次打击”模型;⑤ Bcor在体内具有抑癌基因作用,Bcor缺失使TGFb信号成为淋巴瘤的驱动基因。
全基因组分析
全外显子组
PRC1样组分
BCL6共抑制基因Bcor
AKT-MTOR-eIF4E通路
胆碱激酶α(CHKA)
肝癌耐药和转移的凶手:胆碱酯酶α
① 对9例肝细胞癌(HCC)和配对癌旁组织进行全外显子组和转录组分析,120例术后配对标本行组织芯片分析,48例配对标本行qRT-PCR等分析,细胞株行移植瘤等研究;② HCC组织中胆碱激酶α(CHKA)信使RNA水平升高,与CHKA位点扩增相关;③ 稳定过表达CHKA的HCC细胞株转移和侵袭水平更高,移植瘤更大转移灶更多,CHKA高表达患者术后生存期更短;④ CHKA过表达促进HCC侵袭性,对EGFR抑制剂产生耐药,通过促进EGFR和mTORC2相互作用而促进转移。
胆碱激酶α(CHKA)
肝细胞癌(HCC)
全外显子组
转录组
组织芯片分析
遗传性弥漫性胃癌(HDGC)
遗传性胃癌:同源重组修复相关基因胚系突变
① 收集28例与CDH1突变无关的遗传性弥漫性胃癌(HDGC)患者的血样,进行全外显子测序分析;② 分析333个 独立HDGC和非HDGC病例的候选基因;③ 11例存在调控DNA同源重组基因PALB2、BRCA1或 RAD51C的胚系突变,31例HDGC中2例 (6.5%)、331例散发胃癌中9例(2.8%)存在该突变;④ 上述基因突变与其他肿瘤相关,本研究中与胃癌部分共分离;⑤ 携带这些突变的患者所发生的肿瘤,具有与体细胞同源重组缺陷相关的突变特征,同源重组缺陷增加胃癌风险。
遗传性弥漫性胃癌(HDGC)
全外显子组
候选基因
DNA同源重组
共分离