Chenyi Guo

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文章数：4篇

杨瑞馥等：鼠疫菌基因突变的进化延伸表型

两个月前，北京出现由鼠疫耶尔森菌感染导致的鼠疫个案。这种病菌可通过跳蚤叮咬来传播，除了早期传播模式（跳蚤吸食含鼠疫菌的血液后，在短期内将病菌传播给新的宿主），鼠疫菌还能在跳蚤前肠形成生物膜，使得跳蚤陷入饥饿状态，从而刺激跳蚤的吸血行为来增强病菌传播。北京微生物流行病研究所杨瑞馥团队、新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心Yujiang Zhang团队与挪威奥斯陆大学研究者合作的最新研究发现，环境因素（低温和干旱）会导致鼠疫菌rpoZ基因突变，该突变能增强鼠疫菌的生物膜形成能力，从而可能通过改变其跳蚤宿主的延伸表型（extended phenotype），即增强跳蚤的吸血表型，导致鼠疫菌的传播加快。这是首次证实病原菌突变的进化延伸表型（这是”自私的基因“作者Richard Dawkins提出的平行于达尔文生物体本身进化论的一个进化理论），也是病原菌生态进化（ECO-EVO）研究的一个范例。相关成果近期发表在Nature Communications，值得专业人士关注。

Yongkang Zhen Yifan Wang Mengzhi Wang

保加利亚乳酸杆菌

张和平+杨瑞馥团队：破解保加利亚乳杆菌的基因秘密

① 保加利亚乳酸杆菌是发酵乳制品中常用菌株； ② 基于8个保守基因分析蒙古、俄罗斯及中国西部的天然发酵制品中的298株菌株； ③ 251个确认的菌株拥有106个独特的序列类型，可被分为5个地理分布不平均的clonal complex； ④ 种群结构分析显示6个linegae。

保加利亚乳酸杆菌基因多样性种群结构 Nicole Dubilier Nicole Dubilier

功能基因组学

对213株乳杆菌及其相关菌属进行比较基因组学研究扩展乳酸杆菌的生物应用潜力

① 乳酸菌的代谢多样性、种属不明确、与其他重要的乳酸菌之间关系的不确定性，使得开发利用乳酸菌变得复杂，且乳酸菌催化的生物转化能力尚未开发；② 发布213株乳杆菌及其相关菌属的基因组序列，发现73个核心基因，描述修饰碳水化合物和蛋白质的编码基因目录；③ 乳酸杆菌有广泛且多样性的新CRISPR-Cas免疫系统，可用于基因编辑；④ 揭示乳酸杆菌在自然和工业环境的宿主相互作用因子和细菌素的系统基因组学分布，及工艺过程中承受压力的机制。

功能基因组学乳杆菌

全基因组分析

副溶血弧菌：一种自由生活的海洋病原体的流行性克隆、海洋基因库和生态连锁失衡研究

① 副溶血性弧菌（VP）是一种自由生活的和海产品相关的海洋细菌，每年会引起世界各地成千上万的人感染；② 本研究把有性繁殖种群的分析理念和方法应用于副溶血弧菌，根据全基因组变异重建其精细种群结构，发现该物种的独特海域性基因库；③ 通过建模计算，提出“生态连锁失衡”是其主要进化推动力，并鉴定出具有与生物膜形成和六型分泌系统相关的上位相互作用区；④ 该研究为高频重组细菌进化分析提供了全新范例。

全基因组分析副溶血弧菌海洋微生物菌种进化生物膜