David T Riglar

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David T Riglar

文章数：4篇

Nature子刊：利用合成振荡器监测肠道内的细菌生长变化

合成基因振荡器（synthetic gene oscillators）具有控制定时功能及周期性基因表达的潜能，因其稳健性及准确性的不足，在复杂体内环境中的应用受限。Nature Communications上发表的一项最新研究，设计了一种新型合成振荡器：由三个与不同荧光蛋白偶联的阻遏蛋白组成的负反馈循环——RINGS，可在不同菌种及菌株中，通过成像监测细菌生长的周期。在小鼠肠道环境中，RINGS系统可保持稳定，可用于长期监测细菌的生长情况，并可在疾病状态下或在不同的生态位中监测细菌生长的变化。

工程细菌合成振荡器研究论文基础研究 Manuel Zorzi

挖掘细菌中的传感器元件，助力工程菌研发

通过给细菌装入能被特定信号激活的“触发器”开关，搭配记忆回路，能使工程菌成为检测体内特定疾病信号的生物传感器。然而，已知的“触发器”种类有限，大大限制了这种策略的应用。《mSystems》近期发表的一项研究，构建了一个高通量筛选平台，可实现对细菌中已存在的“触发器”元件进行筛选，并成功找到了能感应肠道炎症的“触发器”。该策略可用于发掘细菌中存在的响应其它疾病信号的“触发器”，从而实现用活菌对肠道甚至其它部位疾病的无创诊断。

工程菌 biosensors synthetic biology 生物传感器合成生物学

基因工程细菌

Nature Reviews：工程菌在诊断及治疗中的应用（综述）

除了益生菌，经过DNA改造的“智能”工程菌也可用于疾病的诊断和治疗，目前的研究集中在对糖尿病、IBD、HIV感染和癌症等疾病的诊疗应用。近期Nature Reviews Microbiology[IF：26.819]发表了哈佛大学Pamela Silver教授主笔的综述，总结和讨论了这一领域取得的进展和面临的挑战，非常值得关注。

基因工程细菌 Atsushi Kadowaki Atsushi Kadowaki

肠道炎症监测

Nature子刊：工程改造的细菌，用于长期监测肠道炎症

① 本文报道了一种工程改造后的大肠杆菌，可在小鼠肠道中维持功能稳定达6个月之久；② 可利用这株细菌检测连四硫酸盐，后者主要在炎症过程中产生；③ 在小鼠共生大肠杆菌NGF-1中构建一个“细菌记忆装置”，并同时表达鼠伤寒沙门氏菌的ttrR/S基因、PttrBCA启动子及其调控的Cro基因；④ 连四硫酸盐可使TtrS磷酸化，并磷酸化TtrR，后者在无氧条件下通过PttrBCA激活Cro基因表达；⑤ Cro蛋白的表达可开启记忆装置，伴随着lacZ报告基因的表达。

肠道炎症监测菌株改造连四硫酸盐