Ilana L Brito

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Ilana L Brito

文章数：5篇

Nature子刊：PRO-seq解析微生物组的转录组学

细菌通过精确调节转录起始和延伸来对环境刺激做出反应，但RNAseq主要表征成熟的转录本。PRO-seq可捕获正在转录的RNA聚合酶（RNAP）从而鉴定出活跃转录的基因位点，但PRO-seq只在可培养的已知基因组的细菌中使用过，如大肠杆菌和枯草芽孢杆菌。Nature Microbiology近期发表的文章，将PRO-seq成功应用于培养的大肠杆菌和人类微生物组，拓展了PRO-seq在探索不同微生物群落中转录动力学的应用。

微生物组 PRO-seq 转录动力学

Nature子刊：临床相关抗生素耐药性基因的全球患病率和分类范围

获得抗生素耐药性（AR）基因使病原体对抗生素无反应，病原体可从肠道菌群中获得AR特征，但目前对其分类学关联及其在肠道菌群不同成员中的转移潜力知之甚少。近日，发表在Nature Communications上的这篇文章，发现临床相关的AR基因与全球肠道菌群中的一组有限分类群不同的共生肠道微生物群中有关，挑战了目前观点。

蛋白-蛋白相互作用

肠道细菌与人体蛋白质相互作用对健康的影响（观点）

人类肠道微生物组与多种疾病相关，然而这些微生物是影响人类健康的机制尚不完全清楚。越来越多的研究认为蛋白质相互作用是肠道微生物影响宿主健康的潜在机制之一。一篇发表在Trends in Microbiology上的观点文章总结了蛋白质相互作用在免疫信号传导和肠道屏障调节领域的最新进展，并认为人类肠道微生物蛋白质相互作用网络在各种疾病的预防或发病中起着重要作用，未来的研究应该扩大对蛋白质相互作用的探索。

蛋白-蛋白相互作用肠道细菌信号传递分子模式

宏基因组学能回答什么问题？什么不能？（综述）

本文介绍了使用宏基因组学的优势，以及当前可用的分析工具得出的结论的范围，例如跨门和功能组成在物种和菌株水平的高分辨率，同时强调了宏基因组学数据分析的挑战，且表明将来技术和方法的改进和创新将导致成本降低，并预期我们将不仅能够表征复杂的微生物群，而且能够操纵群落以实现人类健康、农业和环境可持续性发展的结果。

微生物组宏基因组学 DNA测序微生物学计算生物学

胆盐水解酶

检测肠道菌群胆盐水解酶活性的新工具

《ACS Central Science》发表的一项研究，开发了一种化学蛋白质组学工具，可检测肠道菌群的胆盐水解酶（BSH）活性，或可用于研究肠道菌群在与胆汁酸代谢相关的病理和生理过程中的作用机制。

胆盐水解酶化学蛋白质组学 Huidi Jiang Ping Li