Thomas Roeder

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Thomas Roeder

文章数：2篇

肠道干细胞

高脂膳食如何诱导肠道干细胞瞬时激活

高脂膳食（HFD）可以诱导肠道干细胞的激活，是包括癌症在内肠道疾病的主要原因之一。但高脂膳食诱导干细胞激活的机制尚不清晰。近期一篇发表在《PLoS Genetics》上的文章，应用果蝇模型揭示了高脂膳食依赖于肠道菌群激活JNK通路，增加细胞因子upd3的合成，进而激活JAK/STAT通路，导致肠道干细胞的瞬时激活。同时改变了肠道细胞群体组成、肠道菌群组成和载量。文章提出肠道菌群载量增加可能是HFD触发肠道干细胞激活的主要原因。

肠道干细胞高脂饮食 HFD high-fat diet Gut microbiota JNK-upd3-JAK/STAT

扩增子测序

“扩增子”VS“宏基因组”——到底谁可以描绘宿主和微生物共生体进化蓝图

高通量测序使微生物组的研究走上了快车道，与宿主相关的微生物往往更受研究者青睐。不仅仅作为人类的第二基因组，微生物其实与大量的动植物都有互作关系。这一宿主微生物共生体对于生态系统的稳定、发展和进化尤其重要。在微生物协同宿主进化研究中，基于扩增子和宏基因组都可以对微生物群落结构进行表征。为了比较它们表征微生物群落和功能的异同，同时为广大研究者提供方法上的优化和参考，基于两种不同方法，作者使用不同环境的宿主相关微生物进行了深入的讨论。并且在宿主和微生物互作方面提出了自己独特的见解。相信在今后可以为我们研究宿主微生物进化之路提供有力的技术参考和重要的认识。

扩增子测序宏基因组分析方法系统综述 Animal microbiome