Katherine D McMahon

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Katherine D McMahon

文章数：3篇

Nature：宏基因组学解析巨病毒的多样性及与宿主的相互作用

巨病毒（Giant virus），属于核质大DNA病毒（nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDVs），基因组可以达到几个兆碱基大小，病毒体甚至比小细胞生物体尺寸类似甚至更大。这些病毒能够广泛地感染从原生生物到动物等一系列真核生物。但是目前关于巨病毒的了解还仅限于与原生生物和藻类共生的病毒分离株。发表在《Nature》上的一项研究，基于目前公开的众多宏基因组数据，重建了2000多种NCLDV基因组，并分析了其分布模式、代谢特点及与宿主的相互作用。该研究为未来巨病毒的研究提供坚实的基础理论和广泛的资源，为巨病毒多样性以及其与宿主的相互作用提供了更为全面的分析和见解。

病毒鉴定核质大DNA病毒宏基因组水平基因转移代谢重编程

微生物组工程

Nature Reviews：如何开展微生物组工程（重磅综述）

通过微生物组工程方法来设计和构造具有特定功能的菌群，在医学、农业、能源和环境等方面有广泛的应用前景。Nature Reviews Microbiology近期发表的一篇重磅综述，提出了微生物组工程的设计-构建-检测-学习（DBTL）框架，探讨了每个步骤的思路、技术方法和挑战，对于菌群的转化应用研究很有参考意义。

微生物组工程 Christopher A Lamb Christopher A Lamb Aamir Saifuddin Nick Powell

厌氧氨氧化细菌

Nature子刊：厌氧氨氧化细菌与异养细菌的互作

① 利用介导厌氧氨氧化的细菌群落，是从废水中去除氮的最节能环保的生物科技；② 利用genome-centric宏基因组测序法及代谢网络分析，对实验室规模的厌氧氨氧化反应器中的17个厌氧氨氧化细菌及异养细菌的基因表达进行检测；③ 绿菌门中的细菌可能是具有高度活性的蛋白降解者，在将硝酸盐回收转化为亚硝酸盐的过程中分解胞外多肽；④ 其它异养细菌利用其它电子供体（如H2、乙酸盐、甲酸盐）帮助厌氧氨氧化细菌清除多肽碎片。

厌氧氨氧化细菌