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mbImpute
文章数:1篇
非生物零点
mbImpute:一种准确且稳健的菌群数据插补方法
菌群数据分析存在许多非生物零点,为了解决这个问题,作者提出了微生物组数据的第一种插补方法—mbImpute—通过从相似样本、相似分类群和可选元数据中联合借用信息来识别和恢复可能的非生物零点。作者证明 mbImpute 提高了从 2 型糖尿病和结直肠癌的菌群数据中识别疾病相关类群的能力,并且 mbImpute 保留了类群丰度的非零分布。菌群研究人员可以使用 mbImpute 避免在单个分析任务中处理稀疏数据的麻烦,并享受建立数据分析iytk流程的灵活性。mbImputeR 包可在 https://github.com/ruochenj/mbImpute 获得。重现结果的源代码和数据可在 https://doi.org/10.5281/zenodo.4840266 获得。
非生物零点
非零分布
菌群数据分析
mbImpute
16S rRNA 数据集
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