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映射
文章数:2篇
数据库资源
KEGG: 基于分类的通路和基因组分析
KEGG数据库于1995年12月首次发布时,它只包含流感嗜血杆菌的一个完整基因组和其他少数物种的不完整基因组。 它现在包含超过 8400 个基因组,涵盖广泛的分类群。现在可以使用新开发的 KEGG 基因组浏览器更好地分析染色体上基因的物理链接,然后可以使用分类树的 Brite 层次结构查看器检查这些链接。Nucleic Acids Research发表的这篇文章报告了这一点以及过去 2 年的其他进展,KEGG网站 (https://www.kegg.jp/kegg/docs/relnote.html) 的发行说明中也总结了这些进展。
数据库资源
标识符
层次结构查看器
基因组浏览器
分类树
肠道菌群
北林团队:理解肠道菌群内部结构功能关系的新模型
肠道菌群通过其复杂的内部相互作用决定人类健康,这是人类基因组编码的一个过程。然而,在这种高度密集的群落组合中对微生物的相互作用进行建模是一项重大挑战。北京林业大学邬荣领团队在Gut Microbes发表文章,绘制了微生物如何相互作用和共同工作以确定微生物群落行为的宿主遗传结构图,并进行路径分析来揭示基因型的直接影响,以及其通过微生物网络作为“内表型”对宿主表型的间接影响。本研究的模型提供了一种工具,可以潜在地用于了解肠道菌群内部结构功能关系的机制基础。
肠道菌群
映射
行为模型
遗传图谱理论
互作网络