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基准菌群转换
文章数:1篇
采样深度
Nature子刊:基准菌群转换有利于解决组成性和采样深度偏差的实验定量方法
宏基因组测序中,由于序列矩阵的稀疏性和组成性,菌群数据的下游分析和临床解释仍然具有挑战性,在本研究中,作者对一系列广泛的可用计算和实验转换方法的优点和局限性进行了系统评估,这些方法已被提议用于处理序列数据分析中的组成性和采样深度变化 。作者的基准证明了定量方法在报告样本丰富度以及准确恢复真正的分类单元,分类单元和分类单元间,分类单元与元数据关联方面优于其他计算方法的性能,同时最小化了假阳性关联的检测。
采样深度
组成性
基准菌群转换
稀疏性
宏基因组测序