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文章数:1篇
16s扩增子测序
苏晓泉:菌群16S扩增子测序的功能校正算法Meta-Apo
5月29日上午的新技术大会上,青岛大学苏晓泉教授报告了菌群16S扩增子功能校正算法Meta-Apo。利用Meta-Apo可以让低成本的16S扩增子测序产生与WGS相近的、可靠的、高分辨率的菌群功能图谱。Meta-Apo能够综合16S扩增子测序的较低成本和WGS的较高精确度两方面的优势,使大规模的菌群研究受益匪浅。对于之前和新兴菌群项目,借助Meta-Apo等新工具,16S扩增子的测序和分析策略将继续为菌群的功能研究做出贡献。作者在GitHub上提供了Meta-Apo优化的C ++实现(https://github.com/qibebt-bioinfo/ meta-apo)。
16s扩增子测序
宏基因组测序
Meta-Apo
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功能图谱