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纵向差分丰度
文章数:1篇
宏基因组学
研究肠道菌群组成和功能的新兴计算工具和模型(综述)
高通量测序、质谱和其他组学分析平台的进步提高了我们生成大量数据的能力,从而能够探索微生物群落组成和功能的时间变化。方法和工具是阐明机制必需的,其可以对时序数据中的依赖性进行严格建模。纵向数据通常是稀疏且采样不均匀的,在确定统计显著性,跨不同数据类型进行归一化以及模型验证方面仍然存在不小的挑战。本综述重点介绍了用于分析时间序列微生物组和代谢组数据以及整合这些数据的模型和软件工具的最新发展。
宏基因组学
时间序列
建模
多组学
纵向差分丰度