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广义线性混合模型GLMMs
文章数:1篇
差异丰度分析
国内团队:用于菌群关联分析的R包-MZINBVA
上海交通大学王涛团队近期在Briefings in Bioinformatics发表文章,提出了用于菌群研究中关联分析的多级零膨胀负二项式模型,开发了一种用于最大似然估计和推理的变分逼近方法,其使用优化而不是抽样来近似对数似然和计算参数估计,提供参数估计协方差的稳健估计,并构建用于关联测试的 Wald 型检验统计量。作者开发了一个 R 包 MZINBVA 来实现所提出的方法,可从 GitHub 资源库 https://github.com/liudoubletian/MZINBVA 上获得。
差异丰度分析
广义线性混合模型GLMMs
纵向和多级数据
变分推理