空间宏转录组学

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空间宏转录组学

Nature子刊：研究宿主-细菌-真菌相互作用的利器——空间宏转录组学

微生物之间以及与多细胞宿主之间的相互作用发生在微观尺度上，形成复杂的网络和空间模式。现有技术不允许同时研究宿主及大量定殖微生物之间的空间相互作用，这限制了我们对植物或动物组织内宿主-微生物相互作用的理解。Nature Biotechnology近期发表的文章，开发出基于测序的空间宏转录组学（SmT），可对组织内宿主的转录组和细菌、真菌进行表征，研究三者之间的相互作用。

空间宏转录组学宿主-细菌-真菌

空间宏转录组学分析肺癌的瘤内菌群

瘤内菌群影响肺癌的肿瘤发生和治疗反应，然而尚不清楚瘤内菌群在肿瘤微环境中的空间分布和与宿主细胞的互作。Journal for ImmunoTherapy of Cancer近期发表的这项研究采用一种空间宏转录组学方法，对这一问题进行了探索，发现瘤内细菌主要在肿瘤细胞中富集，并与多种致癌途径相关，提示减少瘤内细菌负荷可能有助于改善肺癌治疗。

瘤内菌群肺癌空间宏转录组学