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重叠群分箱
文章数:1篇
宏基因组 Hi-C
HiCBin:染色体构象捕获(Hi-C)辅助宏基因组分箱宏基因组组装基因组
从复杂的微生物生态系统中恢复高质量的宏基因组组装基因组(MAGs)仍然具有挑战性。最近,高通量染色体构象捕获(Hi-C)已被应用于同时研究天然菌群中的多个基因组。本研究中,作者开发了 HiCBin,一种新颖的开源流程,以利用 Hi-C 接触图来解决高质量的 MAGs。
宏基因组 Hi-C
零膨胀负二项式归一化
Leiden聚类
Potts模型
重叠群分箱