近期江西农业大学陈从英和黄路生院士与研究团队在Nature Communications上发表了其研究工作，利用745个猪下呼吸道宏基因组数据，建立了目前猪下呼吸道微生物组中最大的抗生素耐药基因（ARG）集，且首次研究了猪下呼吸道微生物群的抗生素耐药性与猪肺部病变间的关系。该研究对优化生猪生产中抗生素使用具有重要参考价值，并有助于了解猪下呼吸道微生物群的抗生素耐药性对猪肺部健康的影响。

猪不仅是重要的养殖动物，也是研究人类疾病的生物医学模型。近日，江西农业大学的陈从英和黄路生院士在Gut Microbes发表综述，回顾了宿主遗传对肠道菌群组成影响的研究进展，并总结了猪作为实验动物在探索宿主遗传对肠道菌群组成影响方面的主要优势和挑战。

江西农业大学黄路生院士、陈从英教授和Michel Georges教授及团队在Nature发表重磅文章。对1500头实验猪进行了纵向、全面的分析，研究宿主遗传-肠道菌群组成-宿主表型之间的关系。首次揭示了ABO血型基因通过调节N-乙酰半乳糖胺浓度影响肠道中丹毒丝菌科丰度，并系统地阐明了其作用机理。该研究是国际上农业动物相关研究领域的一项突破，对我国种业自主创新工作具有重要意义。

畜牧养殖中会使用大量抗生素，是引发细菌抗生素耐药性的一个重要原因。江西农业大学陈从英、高军与团队，近期在Microbiome发表研究，对养猪业中猪肠道菌群中的抗生素耐药基因（ARG）的组成和分布情况进行了大规模的定量分析，鉴定出可以反映ARG污染水平的指标。该研究对于在养猪场中评估ARG的传播风险和指导优化抗生素使用，具有重要参考价值。

江西农业大学的陈从英和黄路生院士与研究团队在Microbiome上发表的一项最新研究结果，在698头商品猪中发现并验证，肠道菌群中的Prevotella copri的丰度与猪的脂肪堆积及血清中的肥胖相关代谢产物的浓度呈正相关，并通过无菌小鼠的细菌定殖实验证明了该菌与宿主脂肪堆积的因果关联。

江西农业大学陈从英和黄路生院士与研究团队在Nature Communication上发表研究，对不同品种、不同农场、不同取材位置的猪肠道微生物组宏基因组测序和已有宏基因组序列结果进行分析，建立了目前最为全面完整的猪肠道微生物组基因目录（PIGC）和宏基因组组装基因组（MAG），应用PIGC和MAG揭示了野生猪和商业品种猪肠道菌群的组成和功能的不同。