揭著业 | 热心肠智库

揭著业

华大研究院助理研究员

揭著业现为华大研究院助理研究员，从2011年加入华大，一直从事宏基因组和复杂疾病的研究工作，参与发表过Nature, Nature medicine等，一作发表过Gastroenterology，Nat Commun等。研究领域集中在宏基因组和糖尿病，肥胖，肠癌，冠心病等复杂疾病关系。

主页介绍成果

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刘小敏+张涛+贾慧珏：基因决定口腔微生物组组成

① 首次对1915个人舌背、唾液宏基因组数据和基因组进行了关联分析，发现5个遗传位点与口腔微生物组具有关联性；② 基于1439人的队列分析，验证了其中4个位点与口腔微生物的关联；③ APPL2、SLC2A9、OR11H1和LOC105371703的特定SNP分别与舌苔菌Prevotella jejuni等、OribacteriumuSGB 1215等、F0422 uSGB 392和Eggerthia相关；④ 宿主miRNAs具有调控特定口腔细菌生长的能力；⑤ 基因组和微生物组数据的机器学习可用于预测牙周疾病。

2021-12-07

揭著业+贾慧珏：人类口腔微生物基因组目录

① 研究收集了4154例人类口腔宏基因组样本，重新组装获得56213个质量合格宏基因组组装基因组（MAG）；② 整合公共数据库及已发表的宏基因组数据，新获得的MAG中的物种水平基因组（SGB）大于参考库，可代表口腔宏基因组数据；③ 高质量MAG中uSGBs构成的进化枝发现了无胆甾原体目中新的细菌类群Candidatus Bgiplasma；④ 菌株水平检测到奈瑟菌属、卟啉单胞菌属和普氏菌属等，预测了人类疾病相关基因；⑤ 发现一株在男性中富集的弯曲杆菌属菌株。

2021-09-04

复旦+华大：迄今最大规模的中国汉族人皮肤菌群宏基因组研究

① 采用宏基因组测序法检测了822个健康汉族人群面部皮肤菌群的样本，结合HMP数据，构建了首个皮肤菌群基因集iHSMGC；② 表皮葡萄球菌属是皮肤菌群耐药基因的重要来源，耐药基因的分布具有微生物特异性和部位特异性；③ 发现了中国汉族人群显著富集的一种皮肤微生物奥斯陆莫拉菌；④ 基于皮肤菌群鉴定出了2种广泛存在的皮肤亚型，分别以痤疮丙酸杆菌和奥斯陆莫拉菌为指示菌；⑤ 2种皮肤亚型表现出不同代谢功能特征，或与宿主提供的营养不同有关。

2021-02-17

张涛+贾慧珏+侯勇：深度剖析中国人的遗传-菌群关联

① 纳入632名中国人，通过深度全基因组和宏基因组测序，分析宿主遗传和肠道菌群的关联，并在另外663人的队列中进行验证；② 鉴定出与特定细菌分类群显著相关的37个基因座、47个基因和18个拷贝数变异，可共同解释至少20％的肠道菌群组成；③ 这些遗传信号主要集中在代谢、神经和免疫功能等方面；④ 鉴定出2个与肠型有关的基因座，解释11％的普氏菌肠型和拟杆菌肠型的差异；⑤ 鉴定出33个男性特异和37个女性特异的菌群-宿主遗传关联。

2021-02-09

华大研究院：谁更易减肥成功？肠道菌群或是最强预测力

① 72名超重/肥胖和11名体重正常的中国成人，进行6个月的基于膳食建议的节食减重，干预结束时个体间体重变化差异很大；② 在多个变量中，基线肠道菌群对个体减重轨迹的预测力最强，其中Blautia wexlerae和多氏拟杆菌在基线时的高含量是减重的最强预测因子；③ 体重下降与某些细菌种类的丰度变化有关：活泼瘤胃球菌在肥胖个体中显著富集，并在减重过程中显著减少，而Akk菌和Alistipes obesi在瘦人中显著富集，并在节食过程中丰度增加。

2021-01-19

马现仓+贾慧珏等：精神分裂症患者的肠道微生物组特征

① 收集90例未经治疗的精神分裂症患者和81例对照的粪便样本，通过宏基因组关联分析鉴定出83个相对丰度有显著差异的OTU；② 患者菌群中，兼性厌氧菌和口腔菌增多，短链脂肪酸合成、色氨酸代谢、多种神经递质的合成/降解等功能潜力发生改变；③ 包含26个OTU的诊断模型可较准确的区分患者和对照（AUC=0.896），并在测试队列中得到确认（AUC=0.765）；④ 移植患者中富集的前庭链球菌，可诱导小鼠的精神分裂症样行为、改变外周神经递质水平。

2020-03-31

国内团队：强制性脊柱炎患者的肠道菌群组成及功能变化

① 对比分析85名强直性脊柱炎（AS）患者及62名健康人的肠道菌群，发现惰性真杆菌等5种菌种在AS患者中富集；② 在AS患者的肠道菌群中，氧化磷酸化、脂多糖生物合成和粘多糖降解作用增强；③ AS患者中存在脆弱拟杆菌和III型分泌系统等与自身免疫相关的特征；④ AS患者肠道菌群中部分富集的细菌多肽可模拟II型胶原，并促进特定HLA分类（HLA-B27）AS患者的PBMC产生IFN-γ。

2019-12-02

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注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者

2023

FAA consortium of three-bacteria isolated from human feces inhibits formation of atherosclerotic deposits and lowers lipid levels in a mouse model

iScience, 10.1016/j.isci.2023.106960

2022

FASex differences in the oral microbiome, host traits, and their causal relationships

iScience, 10.1016/j.isci.2022.105839

2021

FANetwork of Interactions Between Gut Microbiome, Host Biomarkers, and Urine Metabolome in Carotid Atherosclerosis

FCIMB, 10.3389/fcimb.2021.708088

CAOver 50,000 Metagenomically Assembled Draft Genomes for the Human Oral Microbiome Reveal New Taxa

GENOM PROTEOM BIOINF, 10.1016/j.gpb.2021.05.001

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FALife History Recorded in the Vagino-cervical Microbiome Along with Multi-omes

GENOM PROTEOM BIOINF, 10.1016/j.gpb.2021.01.005

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FALife History Recorded in the Vagino-cervical Microbiome Along with Multi-omics

GENOM PROTEOM BIOINF, 10.1016/j.gpb.2021.01.005

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FAThe Baseline Gut Microbiota Directs Dieting-Induced Weight Loss Trajectories

Gastroenterology, 10.1053/j.gastro.2021.01.029

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2019

FAFecal microbiota transplantation results in bacterial strain displacement in patients with inflammatory bowel diseases

FEBS openbio, 10.1002/2211-5463.12744

2017

FAThe gut microbiome in atherosclerotic cardiovascular disease

Nat Commun, 10.1038/s41467-017-00900-1

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头衔

华大研究院助理研究员

简介

主要研究领域与方向

宏基因组和复杂疾病的研究

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刘学波

西北农林科技大学食品科学与工程学院教授，博士生导师