第四章    肠道微生物组研究14个主题方向

经过几十年的持续研究，人们对肠道微生物的认知已经从单独的物种转向了对微生物组群落的探索。随着、高通量测序、代谢组学、蛋白质组学、培养组学和生物信息学工具等技术方法的快速发展，人们对肠道微生物组的研究正在不断深入，并取得了颇多重要发现和成果。作为连接宿主与外部环境的重要中间环节，肠道微生物组直接或间接地参与宿主多种生理过程，例如消化和代谢膳食成分，调节免疫和内分泌，通过肠-脑轴影响宿主认知功能和行为。作为宿主表型的来源之一，其组成、结构和功能也与诸多不同类型的疾病有密切关联，并可影响宿主对疾病的易感性以及作为治疗干预的靶点。

研究者们试图通过不同的研究路径在分类学组成、功能组成、大队列观察性研究和t研究揭示因果性等多个层面上，扩展对肠道微生物组的理解和认知，最终达到靶向和精准调控肠道微生物组的转化应用目的。

肠道微生物组是高度交叉的新兴研究领域。在本章中，我们将基于对肠道微生物组研究领域的观察和理解，以微生物组、营养、医药转化、动物、免疫、代谢、神经、肿瘤、消化道生理、消化系统疾病、肠X轴、特殊人群、技术方法、同一健康这14个学术主题作为分类维度，对超过2000余篇高影响力论文（见2.3）进行主题分类，以期简要概述近20年来的主要进展，提炼肠道微生物组研究的核心框架和主流方向，并特别关注近5年的研究焦点和热点。

受自身局限性和主观性的影响，我们的总结和结论难免存在偏差、遗漏和不足，恳请各位读者不吝指正。

4.1 微生物组

“微生物组”主题主要关注对肠道微生物组自身特征、规律及相关因素的研究，主要涉及肠道微生物组的组成、多样性、空间分布、个体性、稳定性、动态变化，以及与组成相关的共变量。我们将基于近期的高影响力综述和研究，简要概述目前对“微生物组”的主要认知、研究焦点和未来研究方向，重点聚焦以人类肠道微生物组为主体的研究。

4.1.1 高影响力研究者

“微生物组”主题的高影响力研究论文的作者姓名词云、核心研究团队（以通讯作者为准）及代表性研究，分别详见图4.1.1、表4.1.1。

图4.1.1 “微生物组”主题的作者姓名词云

表4.1.1 “微生物组”主题的代表性研究者